肝炎病毒蛋白领域本体的构建及应用研究

发布时间：2017-03-27 17:21

  本文关键词：肝炎病毒蛋白领域本体的构建及应用研究，由笔耕文化传播整理发布。

【摘要】：作为最早在哲学范围内探讨的一个专业术语，本体（ontology）为哲学家们用以描述客观世界内一切实际存在的现象、行为及事物的本质。随着计算机科学相关技术的发展，本体对客观事物本质的描述功能逐渐被计算机、人工智能等领域的研究学者所关注并被逐步引入到相关领域。在哲学领域本体含义的基础上，计算机领域的学者对“本体”的定义作了进一步的延伸，将其定义为描述知识的术语及关系。在计算机、信息组织等领域，本体的功能是作为一种知识组织体系，本体不仅准确定义并描述了领域知识范围内的重要概念，同时对概念间的语义关系也进行了准确的定义与描述，从而实现了知识表示与组织的多样化、语义化。近年来，国内外在本体理论与应用两方面的研究都迅速发展，，无论是理论研究、实证研究，还是技术手段的实现和应用都方兴未艾。 本文介绍了国内外领域本体的研究现状，探讨了本体的相关理论与构建方法和工具。为了验证用本体进行知识组织与管理的可行性及现有本体建模方法与工具的有效性，本文以斯坦福大学开发的“七步法”为本体构建方法，利用其开发的本体构建工具Protégé进行了肝炎病毒蛋白领域本体的构建试验。通过建立概念、概念之间的语义关系表达了肝炎病毒蛋白的领域知识。通过具体的本体构建流程印证了领域本体构建工具与方法的可行性，在此基础上总结出一套本体构建的具体流程，为本体构建的相关方法与工具在生物医学领域的应用提供了样例。本文的研究内容主要包括本体相关理论研究，领域本体构建方法与构建工具的研究，肝炎病毒蛋白领域本体的构建，以及肝炎病毒蛋白领域本体在检索中的应用。
【关键词】：本体 本体构建 语义检索 查询扩展
【学位授予单位】：上海交通大学
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2013
【分类号】：G254.2;R512.6
【目录】：

• 摘要5-7
• ABSTRACT7-9
• 目录9-11
• 第一章 序言11-20
• 1.1 研究背景及意义11-12
• 1.2 本体概述12-14
• 1.2.1 本体12-13
• 1.2.2 领域本体13-14
• 1.3 本体研究现状14-17
• 1.3.1 国外本体研究现状14-16
• 1.3.2 国内本体研究现状16-17
• 1.4 蛋白质数据库研究与应用现状17-18
• 1.5 研究内容与章节安排18-20
• 第二章 本体相关理论20-33
• 2.1 本体描述语言20-24
• 2.1.1 基于 AI 的本体描述语言20-22
• 2.1.2 基于 Web 的本体描述语言22-24
• 2.2 本体建模方法24-30
• 2.2.1 骨架法24-25
• 2.2.2 TOVE 法25-26
• 2.2.3 Methontology 方法26-27
• 2.2.4 七步法27-30
• 2.3 本体构建原则30-31
• 2.4 本体构建工具31-32
• 2.5 本章小结32-33
• 第三章 本体在信息检索中的应用33-36
• 3.1 基于本体的跨语言检索33-34
• 3.2 基于本体的自然语言检索34
• 3.3 基于本体的查询扩展检索34-36
• 第四章 肝炎病毒蛋白领域本体的构建36-45
• 4.1 本体构建工具选择36
• 4.2 本体构建方法选择36-37
• 4.3 本体构建流程与步骤37-44
• 4.4 本章小结44-45
• 第五章 基于肝炎病毒蛋白本体的语义检索设计与试验45-68
• 5.1 实验平台和工具47
• 5.2 系统设计与实现47-61
• 5.2.1 基于本体的语义扩展模块47-51
• 5.2.2 信息检索模块51-59
• 5.2.3 用户界面模块59-61
• 5.3 检索功能试验61-67
• 5.4 本章小结67-68
• 第六章 总结和展望68-70
• 6.1 论文研究工作总结68-69
• 6.1.1 本文的主要工作68-69
• 6.1.2 本文的创新点69
• 6.2 下一步工作展望69-70
• 参考文献70-73
• 致谢73-74
• 攻读硕士学位期间已发表的论文74

【相似文献】

中国期刊全文数据库 前10条

1 杜志银;刘芳;赵文龙;胡虹;;临床检验诊断学领域本体构建及其在门户网站信息检索中应用研究[J];医学信息;2010年07期

2 胡兆芹;张士靖;;领域本体的构建实践[J];医学信息学杂志;2008年01期

3 黄惠芬;;浅议医院本体建模及技巧[J];科技信息(学术研究);2007年27期

4 方安;王惠临;王军辉;林芳;;临床疾病领域本体构建方法研究——以手足口病本体为例[J];情报杂志;2009年11期

5 曾召;;构建中医药学领域本体的实践[J];中华医学图书情报杂志;2009年04期

6 杜志银;刘芳;;应用Protégé构建临床检验诊断学领域本体的探索[J];医学教育探索;2010年05期

7 杜志银;刘芳;胡虹;赵文龙;;临床检验诊断学双语领域本体构建方法研究[J];情报探索;2010年06期

8 郭会雨;张文举;李娜;;疾病领域本体模型构建研究[J];预防医学情报杂志;2011年06期

9 王东升;刘亮亮;曹敢;王莉莉;;基于领域本体的心血管疾病辅助诊断系统[J];微计算机信息;2008年01期

10 纪军;徐鸣曙;杨韵华;;针灸学领域本体构建研究[J];医学信息学杂志;2008年05期

中国重要会议论文全文数据库 前10条

1 冯瑾;;初始领域本体获取研究——以国际共运领域为例[A];中国图书馆学会专业图书馆分会2009年学术年会论文集[C];2009年

2 张晓莹;张桂平;王裴岩;;领域本体构建中关系辅助判断技术研究[A];中国计算语言学研究前沿进展（2009-2011）[C];2011年

3 孙涌;韦小丽;;领域本体构建研究及在专利信息服务中的应用[A];江苏省系统工程学会第十一届学术年会论文集[C];2009年

4 叶琼;李绍稳;张友华;刘恺;;农业领域本体知识的云化方法研究[A];中国农业工程学会2011年学术年会论文集[C];2011年

5 谌贻荣;陆勤;李文捷;崔高颖;;一种基于共享后缀术语集改进中文核心领域本体构建的方法[A];中国计算机语言学研究前沿进展（2007-2009）[C];2009年

6 李贵;张兆鑫;李征宇;韩子洋;;WEB环境下基于领域本体的语义匹配技术研究[A];科学发展与社会责任（A卷）——第五届沈阳科学学术年会文集[C];2008年

7 李伟刚;张克亮;王慧兰;;基于航空领域本体知识库的语义检索研究[A];中国计算语言学研究前沿进展（2009-2011）[C];2011年

8 唐晋韬;王挺;;基于本体概念结构的SVM多类分类方法及其在本体自动扩充中的应用[A];2006年全国理论计算机科学学术年会论文集[C];2006年

9 张士靖;胡兆芹;;医学领域本体的构建实践[A];中华医学会第十二次全国医学信息学术会议论文汇编[C];2006年

10 刘新华;刘文剑;;基于领域本体的技术准备信息集成技术研究[A];全国先进制造技术高层论坛暨第七届制造业自动化与信息化技术研讨会论文集[C];2008年

中国重要报纸全文数据库 前10条

1 汪学群;乾嘉汉学家对理的新诠释[N];中国社会科学院院报;2008年

2 本报记者 易凌珊;酷讯旅游推特色搜索 搜索功能细分成趋势[N];通信信息报;2011年

3 孙永娟;试论成就报道应该“刷新”[N];鄂尔多斯日报;2005年

4 韩震;应加强对西方历史哲学的研究[N];光明日报;2000年

5 韦升阳;ECM:在业务系统中提炼信息[N];中国计算机报;2003年

6 ;多方协作发展内容管理[N];中国计算机报;2003年

7 雷达;第四种新命运观[N];兰州日报;2005年

8 郭华强;靠合作发展内容管理[N];中国计算机报;2003年

9 上海交通大学图书馆 杨宗英 郑巧英;数字图书馆的三种主流模式[N];中国电脑教育报;2004年

10 杞人;我基于中文的农业本体论研究与应用国际领先[N];科技日报;2011年

中国博士学位论文全文数据库 前10条

1 赵娜;基于知识地图的多领域本体语义互联研究[D];吉林大学;2011年

2 董俊;基于KDD的领域本体构建若干关键问题研究[D];南京邮电大学;2011年

3 于娟;基于文本的领域本体学习方法及其应用研究[D];大连理工大学;2010年

4 云红艳;设备功能视点下的海洋生态本体构建及应用研究[D];中国海洋大学;2012年

5 米杨;基于顶级本体整合的医学领域语义标注研究[D];吉林大学;2012年

6 杨志和;教育资源云服务本体与技术规范研究[D];华东师范大学;2012年

7 谷建军;基于叙词表的中医古籍文献领域本体建模方法研究[D];中国中医科学院;2006年

8 陈雯;基于本体框架的交通出行语义轨迹建模、标记及数据库研究[D];华东师范大学;2011年

9 王琦;古代壁画的语义检索技术及应用研究[D];浙江大学;2011年

10 徐振宁;基于本体的Web数据语义信息的表示与处理方法研究[D];中国人民解放军国防科学技术大学;2002年

中国硕士学位论文全文数据库 前10条

1 叶剑;基于领域本体的E-Learning系统研究[D];华中师范大学;2011年

2 张亮亮;基于领域本体的语义检索研究[D];吉林大学;2009年

3 韦小丽;领域本体构建及其在专利信息服务中的研究与应用[D];苏州大学;2009年

4 邹景华;语义万维网在智能信息检索中的应用研究[D];重庆大学;2005年

5 李璞;领域本体的模块化构建与重用[D];广西师范大学;2010年

6 李春玲;基于领域本体的语义检索研究[D];重庆大学;2008年

7 高继峰;基于语义Web的智能信息检索系统研究[D];郑州大学;2006年

8 毛平;基于领域本体的文本信息语义检索研究[D];南京理工大学;2007年

9 贾保先;基于Ontology的智能信息检索关键技术研究[D];中国海洋大学;2007年

10 魏晓萍;肝炎病毒蛋白领域本体的构建及应用研究[D];上海交通大学;2013年

  本文关键词：肝炎病毒蛋白领域本体的构建及应用研究，由笔耕文化传播整理发布。

本文编号：270773