应用SELDI-TOF-MS技术筛选原发性胆汁性肝硬化患者血清特异性标志物
发布时间:2020-07-22 03:23
【摘要】:[目的]运用SELDI-TOF-MS技术比较原发性胆汁性肝硬化患者和正常人血清的蛋白指纹图谱,筛选PBC患者的血清特异性标志物,为PBC的早期诊断提供可靠的,敏感的实验室指标。 [实验方法]应用SELDI-TOF-MS蛋白质芯片技术检测21例PBC患者、20例正常健康人血清,获得弱阳离子交换(weak cation exchange, WCX2)芯片的蛋白质指纹图谱。应用BiomarkerWizard软件识别蛋白峰信息,用SPSS 13.0软件对数据进行统计学分析,然后应用Biomarker Patterns软件建立树形分类模型寻找能够以最高敏感性和特异性分辨PBC组和正常对照组(Normal)的蛋白谱,寻找在PBC患者血清中异常表达的蛋白峰。 [实验结果](1)在分子量1000-50000Da段寻找PBC组和正常人的蛋白峰,在此范围全部可识别的153个差异蛋白峰中,有18个蛋白峰有统计学差异(p0.05),有15个来源于配对t检验(符合正态分布的),3个来自于两相关样本的非参数检验(不符合正态分布的)。 (2)应用Biomarker Patterns软件寻找最佳的树形分类模型,结果得到由5个鉴别蛋白峰组成的树形模型。其中包括质荷比为23356.2Da,9589.96 Da,5860.40,8583.71 Da,11924.5 Da的蛋白峰。该模型对诊断PBC的敏感性为95.000%,特异性为90.476%。 [实验结论](1)应用SELDI-TOF-MS技术可建立高敏感性和高特异性的PBC患者的血清学诊断模型。 (2)检测到的5种差异蛋白有可能参与了PBC的发生、发展过程。
【学位授予单位】:昆明医学院
【学位级别】:硕士
【学位授予年份】:2011
【分类号】:R575.2
【图文】:
如图:每个点代表一种树形模型。横坐标为模型中的终结点数。纵坐标为模型中代入新样本时进行错误划分的相对损失。由图可见,相对损失最小的模型即为有6个终结点的树形模型。
本文编号:2765252
【学位授予单位】:昆明医学院
【学位级别】:硕士
【学位授予年份】:2011
【分类号】:R575.2
【图文】:
如图:每个点代表一种树形模型。横坐标为模型中的终结点数。纵坐标为模型中代入新样本时进行错误划分的相对损失。由图可见,相对损失最小的模型即为有6个终结点的树形模型。
【参考文献】
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1 胡朝军;李永哲;赵冠飞;李宁;许洋;佟大伟;张蜀澜;;应用蛋白指纹图谱技术筛选原发性胆汁性肝硬化患者血清特异性标志物[J];世界华人消化杂志;2008年03期
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1 王永胜;补体C3a活性片段对大鼠部分肝移植后肝再生的影响[D];重庆医科大学;2008年
本文编号:2765252
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