NLRP3基因多态性与慢性胃炎、胃腺癌的遗传易感性研究

发布时间：2020-09-10 08:35

　　 目的:探讨NLRP3(NLR family pyrin domain containing 3或Nod-like receptor protein 3)基因位点rs3806265、rs4612666和rs10754558单核苷酸多态性(SNP)与HP(Helicobacter pylori)感染、慢性胃炎、胃腺癌遗传易感性的关系。方法:收集胃腺癌患者124例、慢性胃炎患者153例和健康体检者119例,其中HP阳性106例、HP阴性162例。采用AxyPrep试剂盒法对各组全血样本DNA提取,PCR扩增后,采用SNapshot测序技术对各组患者的NLRP3基因的3个SNP位点的等位基因和基因型进行检测分析。采用SPSS23.0进行卡方检验分析各基因型和等位基因频率在各组分布之间的差异。通过在线软件SHEsis构建NLRP3基因rs3806265、rs4612666和rs10754558三个SNP位点与HP感染、慢性胃炎和胃腺癌的遗传易患性相关的单倍体。结果:rs3806265的C和T两种碱基,在HP感染组与未感染组的比较中并未发现其等位基因频率和基因型与HP感染的相关性(P0.05)。C和T两种碱基在健康对照组的分布频率分别为38.2%和61.8%;其在慢性胃炎组中的分布频率分别为38.2%和61.8%;其在胃腺癌组中的分布频率分别为39.1%和60.9%,三组间两两比较无统计差异(P0.05)。rs3806265三种基因型CC、CT和TT,在健康对照组和胃腺癌组中仅出现CT和TT两种基因型。在健康对照组中,CT基因型分布频率为76.5%,而TT基因型分布频率为23.5%;胃腺癌组中,CT基因型分布频率为78.2%,而TT基因型分布频率为21.8%。而在慢性胃炎组中,CC基因型分布频率为5.2%(仅发现于慢性胃炎组,且全部为HP阳性),CT基因型分布频率为66.0%,而TT基因型分布频率则为28.8%。胃腺癌组与健康对照组相比基因型分布频率无统计学差异(P0.05)。但慢性胃炎组与其余两组相比,基因型频率分布有统计学差异(P0.05)。rs4612666存在C和T两种碱基,在HP感染组与未感染组的比较中并未发现其等位基因频率和基因型与HP感染的相关性(P0.05)。C和T两种碱基在健康对照组的分布频率分别为50.0%和50.0%;其在慢性胃炎组中的分布频率分别为55.2%和44.8%;其在胃腺癌组中的分布频率分别为39.1%和60.9%。慢性胃炎组与健康对照组的等位基因频率比较无统计差异(P0.05)。胃腺癌组与健康对照组和慢性胃炎组比较,等位基因频率存在统计学差异(P0.05)。三种基因型CT、TT和CC,在健康对照组中,CT基因型分布频率为28.6%,TT基因型分布频率为42.9%,而CC基因型分布频率为28.6%;在慢性胃炎组中,CT基因型分布频率为34.0%,TT基因型分布频率为42.5%,而CC基因型分布频率则为23.5%;胃腺癌组中,CT基因型分布频率为26.6%,TT基因型分布频率为51.6%,而CC基因型分布频率为21.8%。三组间NLRP3基因位点rs4612666基因型两两比较未出现统计学差异(P0.05)。rs10754558存在C和G两种碱基,在HP感染组与未感染组的比较中并未发现其等位基因频率和基因型与HP感染的相关性(P0.05)。C和G两种碱基在健康对照组的分布频率分别为65.1%和34.9%;在慢性胃炎组中的分布频率分别为61.4%和38.6%;在胃腺癌组中的分布频率分别为64.5%和35.5%。三个研究组的NLRP3基因位点rs10754558等位基因频率构成比组间比较无统计学差异(P0.05)。该位点存在CC、CG和GG三种基因型。在健康对照组中,CC基因型分布频率为43.7%,CG基因型分布频率为42.9%,而GG基因型分布频率为13.4%;在慢性胃炎组中,CC基因型分布频率为41.2%,CG基因型分布频率为40.5%,而GG基因型分布频率则为18.3%;胃腺癌组中,CC基因型分布频率为42.7%,CG基因型分布频率为43.5%,而GG基因型分布频率为13.7%。三个研究组的NLRP3基因位点rs10754558基因型CC、CG、GG构成比组间比较亦无统计学差异(P0.05)。NLRP3基因三个SNP位点rs3806265、rs4612666和rs10754558构建的单倍体与慢性胃炎和胃腺癌的遗传易感性无关;单倍体TCC、TTG可能是HP感染低风险单倍型(OR值分别为0.580[0.389~0.865]、0.034[0.003~0.374]),而TCG则是HP感染的高风险单倍型(OR值1.551[1.020~2.357])。结论:NLRP3基因三个SNP位点rs3806265、rs4612666和rs10754558构建的单倍体TCC、TTG可能是HP感染低风险单倍型,而TCG则可能是HP感染的高风险单倍型。rs3806265、rs4612666和rs10754558等位基因频率与HP感染、慢性胃炎遗传易患性无关。rs4612666和rs10754558基因型与HP感染、慢性胃炎遗传易患性无关。NLRP3基因位点rs3806265基因型CC只出现在慢性胃炎中,提示该基因型属于慢性胃炎的易患因素。rs3806265和rs10754558等位基因频率与胃腺癌遗传易患性无关。rs4612666等位基因频率与胃腺癌的遗传易感性相关,野生型碱基T频率较高更易患胃腺癌。rs3806265、rs4612666和rs10754558基因型与胃腺癌的遗传易患性无关。
【学位单位】：广西医科大学
【学位级别】：硕士
【学位年份】：2019
【中图分类】：R573.3;R735.2
【部分图文】：

P3 基因位点 rs3806265、rs4612666 和 rs10754558DNA 扩增起：M 泳道为 DNA marker，1-8 泳道为 1-8 号样本扩增产扩增电泳条带从上至下为 rs4612666、rs3806265 和 rs10754ctrophoresis results of NLRP3 locus rs3806265, rs4612666 and rcts (from left: M lane is DNAmarker, lanes 1-8 are sample amplplification electrophoresis bands were rs4612666, rs3806265 andto bottom. rs3806265 扩增产物进行 snapshot 测序的结

2-2 NLRP3 位点 rs3806265 碱基扩增测序峰图，C 碱基在 52.5bp 位置处出现黑色标志的峰图碱基在 54.1bp 处出现红色峰图。Figure 2-2 NLRP3 locus rs3806265 base amplification sequencing peak map, the C base appears at th52.5 bp position of the black marker peak map, the T base appears at 54.1 bp red peak map.

2-3 NLRP3 位点 rs4612666 碱基扩增测序峰图，G 碱基在 52.0 位置处出现蓝色标志的峰图，碱基在 52.6 处出现绿色峰图。igure 2-3 NLRP3 locus rs4612666 base amplification sequencing peak map, G base at the 52.0 positiothe blue marker peak map,Abase at 52.6 green peak map..3 NLRP3 位点 rs10754558 扩增产物进行 snapshot 测序的结果，如图 2-

【相似文献】

相关期刊论文 前10条

1 高泽锋;栗一帆;;纤维母细胞生长因子1在胃腺癌中的表达及其预后生存观察[J];中国药物与临床;2016年08期

2 王路兵;朱登峰;黄磊;张超峰;姜波健;;胃腺癌患者外周血中基质细胞衍生因子-1α含量检测及其临床意义[J];中国普外基础与临床杂志;2015年11期

3 陈茉;丁士刚;刘琳娜;张静;娄雅欣;杨彬;刘丹;;胃腺癌伴淋巴结转移的蛋白质组学分析[J];中国微创外科杂志;2012年04期

4 朱立超;潘施文;杨留才;刘洪;李仕红;徐红涛;;血清中MMP-2、MMP-9水平与青年胃腺癌发生发展的相关性分析[J];医学综述;2011年05期

5 李晓芳;;胃腺癌组织中67LR的蛋白表达及其意义[J];河南大学学报(医学版);2010年01期

6 汪晓庆;吴强;张诗武;王弦;;胃腺癌血管生成拟态的形态学观察和MMP-2表达[J];临床与实验病理学杂志;2010年06期

7 李光会;;胃腺癌的探讨与治疗[J];中国现代药物应用;2009年17期

8 曾庆东;吕丽红;邢培祥;吕斌;汪运山;;细胞因子基因多态性与胃腺癌关系的探讨[J];中华医学杂志;2007年15期

9 刘丽华;胡大为;金小平;胡建功;;微血管密度在胃腺癌中的表达及临床预后意义[J];中国医药导刊;2006年01期

10 孙宝泉;许洪伟;秦成勇;薛淑芳;王永康;刘莹;;胃腺癌中脆性组氨酸三联体基因蛋白表达[J];中国肿瘤;2006年07期

相关会议论文 前10条

1 邢培祥;肖东杰;王洪春;高卫;汪运山;曾庆东;;细胞因子基因多态性在胃腺癌发生及其与胃腺癌临床特点的关系[A];第五次全国中青年检验医学学术会议论文汇编[C];2006年

2 王学哲;张蕴莉;李昆;唐甜甜;;肿瘤坏死因子-α诱导胃腺癌细胞凋亡中热休克蛋白作用的研究[A];中华医学会第九次全国检验医学学术会议暨中国医院协会临床检验管理专业委员会第六届全国临床检验实验室管理学术会议论文汇编[C];2011年

3 马林;;胃腺癌及转移印戒细胞腺癌1例[A];中国超声医学工程学会第七届全国腹部超声学术会议学术论文汇编[C];2007年

4 徐芳英;刘琴;韩丰艳;来茂德;赵仲生;;胃腺癌伴神经内分泌分化现象临床意义分析[A];2015年浙江省医学会病理学术年会论文汇编[C];2015年

5 徐怡;;胃腺癌肿瘤标志物与其生物学行为的研究[A];第五次全国中青年检验医学学术会议论文汇编[C];2006年

6 王小霞;李志伟;张艳桥;;SPARC在胃癌中的表达及对胃癌生存的影响[A];第9届全国胃癌学术会议暨第二届阳光长城肿瘤学术会议论文汇编[C];2014年

7 周祥;赵平;唐令超;丁志;陈小东;肖硕萌;;胃食管结合部胃腺癌中三种消化道重建方式的临床对比研究[A];第9届全国胃癌学术会议暨第二届阳光长城肿瘤学术会议论文汇编[C];2014年

8 周宏众;韩少良;余作黔;张培趁;万丽;;p73基因在胃腺癌组织中的表达及其临床意义[A];2009年浙江省外科学学术年会论文汇编[C];2009年

9 赵岚;单毓娟;;临床胃腺癌Fas、PCNA表达与癌浸润转移关系的研究[A];第九次全国生物物理大会学术会议论文摘要集[C];2002年

10 周宏众;韩少良;;p73和COX-2在胃腺癌中的表达及其预后意义[A];2008年浙江省外科学术年会论文汇编[C];2008年

相关重要报纸文章 前1条

1 本报记者 刘虎;“无胃”老人创奇迹[N];保定日报;2006年

相关博士学位论文 前7条

1 谷建斌;胃腺癌中差异表达lncRNA筛选及相关功能分析研究[D];河北医科大学;2018年

2 王滨;胃腺癌染色体等位基因杂合性丢失及相关蛋白表达的研究[D];中国协和医科大学;2003年

3 陈玲;肿瘤坏死因子α诱导蛋白8在胃腺癌侵袭转移中的作用研究[D];山东大学;2016年

4 梁盼;能谱CT成像在诊断胃腺癌及新辅助化疗疗效评估中的价值[D];郑州大学;2016年

5 薛丽英;贲门腺癌与远端胃腺癌免疫表型及p14~（AFR）和p16~（INK4a）基因变化的对比研究[D];河北医科大学;2010年

6 刘羽;应用蛋白质组学技术鉴定胃癌分化相关蛋白及Serpin B1表达与机制的研究[D];河北医科大学;2012年

7 彭正;IL-15基因转染人CIK细胞过继转移治疗胃癌的实验研究[D];中国人民解放军军医进修学院;2009年

相关硕士学位论文 前10条

1 李丹阳;胃腺癌分子分型与预后的相关性研究[D];郑州大学;2019年

2 马帅;Hsa_circ_0006401作为胃腺癌诊断标志物的初步研究[D];厦门大学;2018年

3 檀润先;NLRP3基因多态性与慢性胃炎、胃腺癌的遗传易感性研究[D];广西医科大学;2019年

4 孙艳珍;稳定过表达CD14胃腺癌SGC-7901细胞体系的构建[D];广西中医药大学;2018年

5 杨枫;CD-DST法检测胃腺癌术后辅助化疗敏感性及个体治疗的应用[D];吉林大学;2018年

6 王炳智;胃腺癌的临床病理特征及免疫组化分型研究[D];北京协和医学院;2018年

7 卞尧刚;HepaCAM在胃腺癌中的功能研究[D];南昌大学;2017年

8 殷宏玲;胃腺癌患者术前NLR和PLR与其临床病理特征及预后的相关性研究[D];延安大学;2018年

9 魏友芬;ELTD1、VEGF、DLL4在胃腺癌中的表达及临床意义[D];兰州大学;2018年

10 瞿国峰;胃腺癌的病理组织类型与淋巴结转移的相关性研究[D];青海大学;2018年

本文编号：2815611