聚乙二醇姜黄素衍生物（Curc-mPEG454）对肝细胞脂肪变的改善作用及机制研究
发布时间：2020-12-31 16:50
背景:非酒精性脂肪性肝病（NAFLD）是我国最常见的慢性肝病,但目前尚无特异性药物用于治疗NAFLD。前期研究证实聚乙二醇姜黄素衍生物Curc-mPEG454可显著降低高脂饮食（HFD）喂养小鼠的体重增长值和血清甘油三酯（TG）水平,但尚不清楚Curc-mPEG454调节肝脏脂质与脂肪酸代谢的机制,也不清楚它是否对人肝细胞脂肪变有类似的改善作用。本研究采用生物信息学方法分析Curc-mPEG454治疗后的小鼠肝脏RNA测序数据,以探究Curc-mPEG454是否调节脂质代谢相关的关键基因,并使用体外游离脂肪酸（FFA）诱导的HepG2细胞脂肪变模型来考察Curc-mPEG454对人肝细胞脂肪变的作用及机制。材料与方法:1.RNA测序及差异基因的识别:提取对照组、HFD组、Curc-mPEG454 50mg/kg治疗组的小鼠肝组织RNA,质控合格后送华大基因公司进行RNA测序。采用FPKM法计算基因表达水平,并应用NOISeq方法按差异表达倍数>2、偏离概率值>0.7为显著性标准筛选差异表达基因。2.差异基因GO分析和KEGG分析:使用基于R语言的clusterProfile...
【文章来源】：重庆医科大学重庆市
【文章页数】：66 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
姜黄素和聚乙二醇姜黄素衍生物Curc-mPEG454化学结构图
3.2 差异基因的识别为了进一步挖掘 Curc-mPEG454 降脂作用的潜在机制，我们通过高通量测序来观察各基因在转录组水平的变化。通过对原始数据质控处理后，共检测到 17154个基因。我们以差异表达倍数＞2 倍及偏离概率值＞0.7 为条件筛选差异表达基因，结果见图 1-1，发现 HFD 共导致 1319 个基因显著改变，其中包括 638 个基因表达上调，681 个基因下调。与 HFD 组相比，Curc-mPEG454 治疗组有 511 个基因变化明显，包括 136 个基因上调和 375 个基因下调。通过比较 HFD 组的 1319 个差异基因和 Curc-mPEG454 治疗组的 511 个差异基因，我们发现有 152 个基因同时在治疗前后有明显变化。其中，有 74 个基因在 HFD 组高表达，而 Curc-mPEG454 治疗后表达下降；有 18 个基因从 HFD 组低表达转变为治疗组中高表达状态。这 152个差异基因表达情况见图 1-1，通过热图我们可以看出，差异基因在组内表达相似，从另一方面反映出我们数据质量可信，可进行后续分析。
分析可以明确差异基因主要参与的生物学过程，以便进一步了解差异作用。图 1-2 展示了 HFD 组和 Curc-mPEG454 治疗组 GO-BP 分析中变 5 条生物学过程。HFD 引起的生物学改变主要富集在脂肪酸代谢过程酸代谢过程的有 50 个基因，其中有 21 个基因主要参与长链脂肪酸代D36、FATP4、SCD1、CYP2E1、ACOT 等基因。Curc-mPEG454 治疗改变主要富集在脂肪酸代谢过程，包括 37 个基因如 CD36、PPAR 、PPA10、ACOT、ACADM。鉴于脂肪酸代谢过程在 HFD 组和治疗组均发，我们进一步分析了参与脂肪酸代谢的基因在治疗前后的改变。我们发造成大多数基因表达上调（如 CD36、FATP4、APOA2），进而导致脂多并蓄积在肝细胞内。然而，Curc-mPEG454 可以显著下调这些基因的D36、PPARγ、CYP4A10、ACOT2、ACADM 和 ACOX1），从而减少取和代谢。
【参考文献】：
期刊论文
[1]Silymarin: An option to treat non-alcoholic fatty liver disease[J]. Carmela Colica,Luigi Boccuto,Ludovico Abenavoli. World Journal of Gastroenterology. 2017(47)
[2]CD36在非酒精性脂肪性肝病中的作用[J]. 詹柱,任红,彭明利. 中华肝脏病杂志. 2017 (12)
[3]非那西丁探针法动态观测非酒精性脂肪肝大鼠发病进程中的CYP1A2活性[J]. 刘莹,金涌,蒋培培,吴德敏,方慧子,周静婷,季俊虬. 中国药房. 2012(17)
本文编号：2949974
【文章来源】：重庆医科大学重庆市
【文章页数】：66 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
姜黄素和聚乙二醇姜黄素衍生物Curc-mPEG454化学结构图
3.2 差异基因的识别为了进一步挖掘 Curc-mPEG454 降脂作用的潜在机制，我们通过高通量测序来观察各基因在转录组水平的变化。通过对原始数据质控处理后，共检测到 17154个基因。我们以差异表达倍数＞2 倍及偏离概率值＞0.7 为条件筛选差异表达基因，结果见图 1-1，发现 HFD 共导致 1319 个基因显著改变，其中包括 638 个基因表达上调，681 个基因下调。与 HFD 组相比，Curc-mPEG454 治疗组有 511 个基因变化明显，包括 136 个基因上调和 375 个基因下调。通过比较 HFD 组的 1319 个差异基因和 Curc-mPEG454 治疗组的 511 个差异基因，我们发现有 152 个基因同时在治疗前后有明显变化。其中，有 74 个基因在 HFD 组高表达，而 Curc-mPEG454 治疗后表达下降；有 18 个基因从 HFD 组低表达转变为治疗组中高表达状态。这 152个差异基因表达情况见图 1-1，通过热图我们可以看出，差异基因在组内表达相似，从另一方面反映出我们数据质量可信，可进行后续分析。
分析可以明确差异基因主要参与的生物学过程，以便进一步了解差异作用。图 1-2 展示了 HFD 组和 Curc-mPEG454 治疗组 GO-BP 分析中变 5 条生物学过程。HFD 引起的生物学改变主要富集在脂肪酸代谢过程酸代谢过程的有 50 个基因，其中有 21 个基因主要参与长链脂肪酸代D36、FATP4、SCD1、CYP2E1、ACOT 等基因。Curc-mPEG454 治疗改变主要富集在脂肪酸代谢过程，包括 37 个基因如 CD36、PPAR 、PPA10、ACOT、ACADM。鉴于脂肪酸代谢过程在 HFD 组和治疗组均发，我们进一步分析了参与脂肪酸代谢的基因在治疗前后的改变。我们发造成大多数基因表达上调（如 CD36、FATP4、APOA2），进而导致脂多并蓄积在肝细胞内。然而，Curc-mPEG454 可以显著下调这些基因的D36、PPARγ、CYP4A10、ACOT2、ACADM 和 ACOX1），从而减少取和代谢。
【参考文献】：
期刊论文
[1]Silymarin: An option to treat non-alcoholic fatty liver disease[J]. Carmela Colica,Luigi Boccuto,Ludovico Abenavoli. World Journal of Gastroenterology. 2017(47)
[2]CD36在非酒精性脂肪性肝病中的作用[J]. 詹柱,任红,彭明利. 中华肝脏病杂志. 2017 (12)
[3]非那西丁探针法动态观测非酒精性脂肪肝大鼠发病进程中的CYP1A2活性[J]. 刘莹,金涌,蒋培培,吴德敏,方慧子,周静婷,季俊虬. 中国药房. 2012(17)
本文编号：2949974
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