基于高效液相色谱-质谱联用技术的HBV相关性肝纤维化血清代谢标志物筛选研究
发布时间：2021-05-28 13:10
目的:探讨乙型肝炎病毒（HBV）相关肝纤维化和慢性乙型肝炎（CHB）患者血清代谢组的差异,寻找与HBV相关性肝纤维化相关的潜在标志物。方法:采用高效液相色谱-质谱联用技术（HPLC-MS）分析16名HBV相关性肝纤维化和16名CHB患者血清代谢谱;应用主成分分析、变量投影重要性分析值等统计分析及数据库检索,筛选鉴定有差异的代谢物;利用Metabo Analyst 4.0软件对差异代谢物进行代谢通路富集分析,筛选出富集于主要代谢通路上的关键代谢物;利用受试者工作特征曲线（ROC）评价主要关键代谢物作为潜在标志物的诊断性能。结果:（1）共筛选并鉴定出神经鞘磷脂、1-磷酸-鞘氨醇、磷脂酰胆碱、磷脂酸、磷脂酰甘油、磷脂酰丝氨酸、磷脂酰肌醇、尿酸、苏氨酸、乳酸、脱氧胆酸、肉桂酸、左旋肉碱（卡尼丁）、（神经）鞘氨醇、神经酰胺、酪氨酸、甘露醇等54种内源性差异代谢产物。（2）代谢通路分析和富集分析发现,神经鞘磷脂、1-磷酸-鞘氨醇、（神经）鞘氨醇、神经酰胺等4种差异代谢物主要富集于鞘脂代谢通路（-log（p）=9.747,impact=0.420）,而磷脂酰胆碱、磷脂酰丝氨酸、磷脂酰肌醇、磷脂酸、磷...
【文章来源】：西南医科大学四川省
【文章页数】：90 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
技术线路图
-16-partialleastsquaresdiscriminationanalysis，OPLS-DA）进行建模分析。用OPLS-DA模型的变量投影重要性分析（variableimportanceintheprojection,VIP）值（阈值＞1），并结合t-test的P值（P＜0.05）来寻找差异性表达代谢物。通过搜索在线数据库（http://metlin.scripps.edu/），比较质谱的质荷比（Masstochargeratio,m/z）或精确分子质量（Mass）对差异性代谢物进行鉴定。4.4差异代谢物富集分析和代谢通路分析使用MetaboAnalyst4.0在线分析软件（https://www.metaboanalyst.ca）对鉴定的差异代谢物进行代谢通路分析与富集分析，以确定差异代谢物涉及的代谢途径，并对富集在通路上的代谢差异物进行诊断性能分析。具体步骤如下：（1）首先，在“MetaboAnalysthome”界面，点击“clickheretostart”，进入模块选择页面，见下图2；图2代谢通路分析步骤1Figure2Metabolicpathwayanalysisstep1（2）在模块选择页面，选择“PathwayAnalysis”模块，见下图3；
-17-图3代谢通路分析步骤2Figure3Metabolicpathwayanalysisstep2（3）上传数据，输入化合物名称，“InputType”选择为化合物名称，参数设置完成后，点击“Submit”，见下图4；图4代谢通路分析步骤3Figure4Metabolicpathwayanalysisstep3（4）化合物名称/ID检查：希腊字母用英文名称（即alpha，beta）替换；正常白色的查询名称表示完全匹配，在下载文件中标记为“1”；突出显示的查询名称表示没有完全匹配项或唯一匹配项，在下载的文件中标记
【参考文献】：
期刊论文
[1]慢性乙型肝炎防治指南（2019年版）[J]. 王贵强,王福生,庄辉,李太生,郑素军,赵鸿,段钟平,侯金林,贾继东,徐小元,崔富强,魏来. 临床肝胆病杂志. 2019(12)
[2]HPLC/MS分析乙肝相关性肝细胞癌的血清代谢轮廓分析[J]. 张磊,范志娟,康华,王宇凡,刘树业,单忠强. 南方医科大学学报. 2019(01)
[3]多项肝纤维化无创诊断模型在乙肝后肝硬化中的诊断效能[J]. 姚文军,谢群,王文星,胡忠群,柯凌霞. 现代医药卫生. 2018(16)
[4]Progress in non-invasive detection of liver fibrosis[J]. Chengxi Li,Rentao Li,Wei Zhang. Cancer Biology & Medicine. 2018(02)
[5]中国2007-2016年59岁以下普通人群HBsAg阳性率的Meta分析[J]. 张维璐,吉兆华,付婷,张磊,苏海霞,闫永平. 中华流行病学杂志. 2017 (09)
[6]慢性乙型肝炎防治指南（2015年版）[J]. 王贵强,王福生,成军,任红,庄辉,孙剑,李兰娟,李杰,孟庆华,赵景民,段钟平,侯金林,贾继东,唐红,盛吉芳,彭劼,鲁凤民,谢青,魏来. 实用肝脏病杂志. 2016(03)
[7]《2015年世界卫生组织慢性乙型肝炎病毒感染预防、关怀和治疗指南》解读:慢性乙型肝炎的抗病毒治疗策略比较[J]. 戴明佳,冷雪君,颜学兵. 临床肝胆病杂志. 2015(07)
[8]血清鞘脂类的变化与肝纤维化进展及治疗效果的关系[J]. 孔文丽,李婉玉,Grammatikos G. 临床肝胆病杂志. 2015(04)
[9]瞬时弹性成像在慢性乙型肝炎肝纤维化诊断中的应用[J]. 徐燕,冯艳玲,施裕新. 山东医药. 2014(47)
[10]代谢组学及其分析技术的研究进展[J]. 李宁,范雪梅,王义明,王玉,罗国安. 中南药学. 2014(07)
博士论文
[1]HBV相关肝纤维化组织的蛋白质组学和转录组学研究[D]. 阚方明.北京协和医学院 2017
硕士论文
[1]肝癌中特异性磷脂改变的初步研究[D]. 戴超.南昌大学 2017
[2]miR-134在肝纤维化中的作用及其机制研究[D]. 王建雄.第二军医大学 2014
[3]循环miR-185对临床肝纤维化诊断价值的研究[D]. 李彬彬.第二军医大学 2013
[4]肝纤维化无创诊断模型在慢性乙型肝炎患者中的验证和探索[D]. 吴盛迪.复旦大学 2009
本文编号：3208173
【文章来源】：西南医科大学四川省
【文章页数】：90 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
技术线路图
-16-partialleastsquaresdiscriminationanalysis，OPLS-DA）进行建模分析。用OPLS-DA模型的变量投影重要性分析（variableimportanceintheprojection,VIP）值（阈值＞1），并结合t-test的P值（P＜0.05）来寻找差异性表达代谢物。通过搜索在线数据库（http://metlin.scripps.edu/），比较质谱的质荷比（Masstochargeratio,m/z）或精确分子质量（Mass）对差异性代谢物进行鉴定。4.4差异代谢物富集分析和代谢通路分析使用MetaboAnalyst4.0在线分析软件（https://www.metaboanalyst.ca）对鉴定的差异代谢物进行代谢通路分析与富集分析，以确定差异代谢物涉及的代谢途径，并对富集在通路上的代谢差异物进行诊断性能分析。具体步骤如下：（1）首先，在“MetaboAnalysthome”界面，点击“clickheretostart”，进入模块选择页面，见下图2；图2代谢通路分析步骤1Figure2Metabolicpathwayanalysisstep1（2）在模块选择页面，选择“PathwayAnalysis”模块，见下图3；
-17-图3代谢通路分析步骤2Figure3Metabolicpathwayanalysisstep2（3）上传数据，输入化合物名称，“InputType”选择为化合物名称，参数设置完成后，点击“Submit”，见下图4；图4代谢通路分析步骤3Figure4Metabolicpathwayanalysisstep3（4）化合物名称/ID检查：希腊字母用英文名称（即alpha，beta）替换；正常白色的查询名称表示完全匹配，在下载文件中标记为“1”；突出显示的查询名称表示没有完全匹配项或唯一匹配项，在下载的文件中标记
【参考文献】：
期刊论文
[1]慢性乙型肝炎防治指南（2019年版）[J]. 王贵强,王福生,庄辉,李太生,郑素军,赵鸿,段钟平,侯金林,贾继东,徐小元,崔富强,魏来. 临床肝胆病杂志. 2019(12)
[2]HPLC/MS分析乙肝相关性肝细胞癌的血清代谢轮廓分析[J]. 张磊,范志娟,康华,王宇凡,刘树业,单忠强. 南方医科大学学报. 2019(01)
[3]多项肝纤维化无创诊断模型在乙肝后肝硬化中的诊断效能[J]. 姚文军,谢群,王文星,胡忠群,柯凌霞. 现代医药卫生. 2018(16)
[4]Progress in non-invasive detection of liver fibrosis[J]. Chengxi Li,Rentao Li,Wei Zhang. Cancer Biology & Medicine. 2018(02)
[5]中国2007-2016年59岁以下普通人群HBsAg阳性率的Meta分析[J]. 张维璐,吉兆华,付婷,张磊,苏海霞,闫永平. 中华流行病学杂志. 2017 (09)
[6]慢性乙型肝炎防治指南（2015年版）[J]. 王贵强,王福生,成军,任红,庄辉,孙剑,李兰娟,李杰,孟庆华,赵景民,段钟平,侯金林,贾继东,唐红,盛吉芳,彭劼,鲁凤民,谢青,魏来. 实用肝脏病杂志. 2016(03)
[7]《2015年世界卫生组织慢性乙型肝炎病毒感染预防、关怀和治疗指南》解读:慢性乙型肝炎的抗病毒治疗策略比较[J]. 戴明佳,冷雪君,颜学兵. 临床肝胆病杂志. 2015(07)
[8]血清鞘脂类的变化与肝纤维化进展及治疗效果的关系[J]. 孔文丽,李婉玉,Grammatikos G. 临床肝胆病杂志. 2015(04)
[9]瞬时弹性成像在慢性乙型肝炎肝纤维化诊断中的应用[J]. 徐燕,冯艳玲,施裕新. 山东医药. 2014(47)
[10]代谢组学及其分析技术的研究进展[J]. 李宁,范雪梅,王义明,王玉,罗国安. 中南药学. 2014(07)
博士论文
[1]HBV相关肝纤维化组织的蛋白质组学和转录组学研究[D]. 阚方明.北京协和医学院 2017
硕士论文
[1]肝癌中特异性磷脂改变的初步研究[D]. 戴超.南昌大学 2017
[2]miR-134在肝纤维化中的作用及其机制研究[D]. 王建雄.第二军医大学 2014
[3]循环miR-185对临床肝纤维化诊断价值的研究[D]. 李彬彬.第二军医大学 2013
[4]肝纤维化无创诊断模型在慢性乙型肝炎患者中的验证和探索[D]. 吴盛迪.复旦大学 2009
本文编号：3208173
本文链接：https://www.wllwen.com/yixuelunwen/xiaohjib/3208173.html
最近更新
教材专著
