广西地区丙型肝炎病毒的基因分型及其临床意义
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【摘要】:目的了解广西地区丙型肝炎病毒(Hepatitis C Virus,HCV)基因型的分布特征,探讨HCV基因型与民族、性别、年龄、感染途径及HCN-RNA载量的关系。 方法收集广西地区2011年2月~2013年5月158例HCV-RNA阳性患者的血清,采用逆转录巢式PCR(RT nested-PCR)法扩增HCV NS5B区段,对PCR产物进行纯化后测序,测序结果与Genbank中已注册的标准株全基因序列比对共同构建系统进化树;分别分析HCV基因型与民族、性别、年龄、感染途径及HCN-RNA载量的关系。 结果158例样本中,共有150例成功扩增并分型,分型结果显示:广西地区HCV基因型以1b型为主,占54.7%(82/150),其次是6a型占13.3%(20/150)、1a型占10%(15/150)、3b型占9.3%(14/150)、2a型占6.7%(10/150)、3a型占5.3%(8/150)、6d型占0.7%(1/150)。分析表明,HCV基因型与民族、性别无明显相关(P>0.05),而与年龄、感染途径及HCV-RNA载量相关(P<0.05)。HCV基因6型有21例(20例6a亚型,1例6d亚型),占分析总数14%(21/150)。进化分析表明,广西地区HCV6型病毒株与来自越南的标准株在进化上相似。 结论1、构建HCV NS5B区段系统进化树能得到准确的HCV基因型和亚型;2、包括早期报道的2b、6b亚型,广西地区目前至少存在9种HCV基因亚型,本研究检出7种亚型(1a、1b、2a、3a、3b、6a、6d),其中以1b型为主,6a型次之;3、较以往的研究报道,1b型的流行率似乎呈下降趋势,而6a型的流行率似乎逐渐上升;4、1b型多见于≥40岁的患者,主要通过输血感染,其HCV-RNA载量高于其它基因型,3型与6a型多见于有静脉药瘾史的年轻患者;5、随着感染途径的变迁,HCV基因型的分布也将发生改变;6、广西地区HCV6型病毒株与越南标准株进化距离很近,有很高的同源性。
【关键词】:广西地区 丙型肝炎病毒 基因型 系统进化树
【学位授予单位】:广西医科大学
【学位级别】:硕士
【学位授予年份】:2014
【分类号】:R512.63
【目录】:
- 中英文缩略词4-6
- 摘要6-8
- ABSTRACT8-10
- 前言10-12
- 材料和方法12-18
- 结果18-27
- 讨论27-36
- 结论36-37
- 参考文献37-46
- 综述46-65
- 参考文献58-65
- 致谢65
【参考文献】
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1 张帆,王小红,王宇明,熊瑜琳,陈嵩,谭朝霞;重庆地区HCV基因亚型的分布状态[J];第四军医大学学报;2005年14期
2 余晶;石清兰;陈月桥;曾芳;杨爱水;毛德文;;广西慢性丙型肝炎感染病毒基因型和治疗分析[J];广东医学;2012年10期
3 ;Hepatitis C virus infections and genotypes in China[J];Hepatobiliary & Pancreatic Diseases International;2002年02期
4 葛宪民,王树声,李丹亚,黄果勇,吴蓉蓉,潘海东,章玲珠,王缨,周开姣,钱小燕,曹坤,,李茵,沟上雅史,折户悦郎,铃木馨,大野智仪,大羽健一;广西吸毒成瘾者丙型肝炎病毒的感染及其分子生物学研究[J];广西预防医学;1996年01期
5 张瑞,杜绍财,邱国华,刘峰,魏来;中国丙型肝炎病毒基因型研究新进展[J];中国生物工程杂志;2004年09期
6 李峥;高玉红;台虹;毕胜;杨曦;张桂前;;云南省丙型肝炎病毒基因的分型[J];中华传染病杂志;2007年04期
7 龙桂芳,梁学恩,李卫,林伟雄,唐霞;儿童丙型肝炎病毒感染状况及基因型308例分析[J];中华儿科杂志;1999年08期
8 王云,张希成,谭欣成,李小平,刘志华,王乐农;新疆地区不同民族HCV基因酶切分型研究[J];中华肝脏病杂志;1998年02期
9 杜绍财,孙南雄,范晓峰,邱国华,尤鹏,张永祥,魏来;中国HCV5′-非编码区复合酶切分型及其3b基因型序列分析[J];中华检验医学杂志;2004年10期
10 夏文杰;叶欣;付涌水;王怡仲;许茹;徐秀章;陈扬凯;贝春花;;广州地区人类白细胞抗原-Ⅰ类与丙型肝炎病毒-6a型感染相关性的研究[J];中国免疫学杂志;2011年04期
本文关键词:广西地区丙型肝炎病毒的基因分型及其临床意义,由笔耕文化传播整理发布。
本文编号:375027
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