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广西地区丙型肝炎病毒的基因分型及其临床意义

发布时间:2017-05-18 03:12

  本文关键词:广西地区丙型肝炎病毒的基因分型及其临床意义,由笔耕文化传播整理发布。


【摘要】:目的了解广西地区丙型肝炎病毒(Hepatitis C Virus,HCV)基因型的分布特征,探讨HCV基因型与民族、性别、年龄、感染途径及HCN-RNA载量的关系。 方法收集广西地区2011年2月~2013年5月158例HCV-RNA阳性患者的血清,采用逆转录巢式PCR(RT nested-PCR)法扩增HCV NS5B区段,对PCR产物进行纯化后测序,测序结果与Genbank中已注册的标准株全基因序列比对共同构建系统进化树;分别分析HCV基因型与民族、性别、年龄、感染途径及HCN-RNA载量的关系。 结果158例样本中,共有150例成功扩增并分型,分型结果显示:广西地区HCV基因型以1b型为主,占54.7%(82/150),其次是6a型占13.3%(20/150)、1a型占10%(15/150)、3b型占9.3%(14/150)、2a型占6.7%(10/150)、3a型占5.3%(8/150)、6d型占0.7%(1/150)。分析表明,HCV基因型与民族、性别无明显相关(P>0.05),而与年龄、感染途径及HCV-RNA载量相关(P<0.05)。HCV基因6型有21例(20例6a亚型,1例6d亚型),占分析总数14%(21/150)。进化分析表明,广西地区HCV6型病毒株与来自越南的标准株在进化上相似。 结论1、构建HCV NS5B区段系统进化树能得到准确的HCV基因型和亚型;2、包括早期报道的2b、6b亚型,广西地区目前至少存在9种HCV基因亚型,本研究检出7种亚型(1a、1b、2a、3a、3b、6a、6d),其中以1b型为主,6a型次之;3、较以往的研究报道,1b型的流行率似乎呈下降趋势,而6a型的流行率似乎逐渐上升;4、1b型多见于≥40岁的患者,主要通过输血感染,其HCV-RNA载量高于其它基因型,3型与6a型多见于有静脉药瘾史的年轻患者;5、随着感染途径的变迁,HCV基因型的分布也将发生改变;6、广西地区HCV6型病毒株与越南标准株进化距离很近,有很高的同源性。
【关键词】:广西地区 丙型肝炎病毒 基因型 系统进化树
【学位授予单位】:广西医科大学
【学位级别】:硕士
【学位授予年份】:2014
【分类号】:R512.63
【目录】:
  • 中英文缩略词4-6
  • 摘要6-8
  • ABSTRACT8-10
  • 前言10-12
  • 材料和方法12-18
  • 结果18-27
  • 讨论27-36
  • 结论36-37
  • 参考文献37-46
  • 综述46-65
  • 参考文献58-65
  • 致谢65

【参考文献】

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本文编号:375027

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