ConA诱导小鼠暴发型肝炎分子机制的生物信息学研究

发布时间：2024-03-31 16:53

　　目的：运用基因芯片及生物信息学技术,研究刀豆蛋白A(ConA)诱导的小鼠暴发型肝炎(暴肝)在病情发展早期的内在分子机制,寻找主导其进展的关键生物学过程或通路,同时探索MicroRNA (miRNA)在该过程中的调控作用,为临床对暴肝的诊治探索可供借鉴的思路。 方法：将12只Bald/C小鼠分为4组,一组在注射磷酸缓冲液(PBS)后立即处死作为0h对照组,而另外三组分别于ConA注射后1 h,3 h和6 h处死。取肝组织行表达谱和miRNA芯片实验。对芯片实验数据在归一化处理(normalization)后通过显著性检验对相邻实验组进行两两比较,得到差异表达基因/miRNA列表。通过查询数据库得到miRNA的靶基因信息。通过富集分析(enrichment analysis)找出差异表达的基因所显著富集的功能类别,特别是通路信息。以卡方检验对差异表达miRNA的靶基因与实际差异表达基因的重合度进行检验。 结果：在0-1 h、1-3 h和3-6 h三个时间段,依次发现393、8354和11344个差异表达基因。并且在前两个时间段,大多数为差异表达基因所富集的通路直接与免疫和炎症反应相关。其中...

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【学位级别】：博士

【部分图文】：

图2.1实验总体技术路线图

对每一个被检测为差异表达的miRNA，我们都其靶基因同各阶段差异表达基因一一进行上述富集测试，最后以卡方值之和排序。方法学部分总体技术路线如图2.1所示:图2.1实验总体技术路线图

本文编号：3944227