基于KEGG通路和基因互作网络对溃疡性结肠炎药靶基因的筛选

发布时间：2017-08-19 02:19

  本文关键词：基于KEGG通路和基因互作网络对溃疡性结肠炎药靶基因的筛选

  更多相关文章： 溃疡性结肠炎 基因互做网络 KEGG通路 药物靶点

【摘要】：目的:筛选与溃疡性结肠炎(ulcerative colitis,UC)相关的药靶基因,利用DAVID通路数据库和基因互做网络分析目标基因的分布和功能,促进UC的研究和新药靶点开发。方法:以ulcerative colitis检索NCBI gene数据库,提取UC相关基因数据,用DAVID分析工具提取基因富集的通路数据。对103个非冗余基因所显著富集的9条KEGG通路进行了分析,同时对富集通路中的基因同HPRD人类蛋白互作网络进行匹配。建立通路中关键基因的基因互做网络。并对所建立的相关子网进行比较,筛选和UC相关的药靶基因。结果:CD40、FAS、TNF、CD86、HLA-DRA、IL2和IL10等20个UC相关基因需要完善研究,AKT1和TNFRSF1A两个基因可能是UC治疗药物间接作用的重要靶点。结论 UC发病与细胞因子-受体相互作用通路、Ig A生产肠道免疫网络等多个通路相关。其中免疫相关通路是UC发病机制中的重要信号传导通路。CD40、FAS、TNF、CD86、HLA-DRA、IL2和IL10等20个UC相关基因在病理和治疗中都占有重要的地位。通过分析疾病相关基因的代谢通路和互作网络,有助于了解疾病的分子病理基础,并为新药设计提供可靠靶点。
【作者单位】： 浙江省中医药研究院;浙江省肿瘤医院;杭州致远医学检验所有限公司;中国人民解放军军事医学科学院;
【关键词】： 溃疡性结肠炎 基因互做网络 KEGG通路 药物靶点
【基金】：浙江省科技计划项目(2014C33209)
【分类号】：R574.62
【正文快照】： 溃疡性结肠炎(ulcerative colitis,UC)是一种病因尚不十分清楚的直肠和结肠慢性非特异性炎症性疾病[1]。以反复发生的肠道溃疡为主要特征,以腹泻、血便、腹痛等症状为主要特点。UC和大肠癌关系密切,尤其是全结肠炎其发生大肠癌的机会比正常人高上数倍,成为我国消化道慢性病的，

本文编号：698107