肠炎和肠炎相关结直肠癌miRNA表达检测及生物信息学分析

发布时间：2017-09-17 12:23

  本文关键词：肠炎和肠炎相关结直肠癌miRNA表达检测及生物信息学分析

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【摘要】：背景与目的:炎症性肠病(inflammatory bowel diseases,IBD)为一组慢性肠道疾病,包括溃疡性结肠炎(ulcerative colitis,UC)与克罗恩病(Crohn’s disease,CD)。肠炎相关性结直肠癌(colitis-associated colorectal cancers,CAC)是由IBD癌化形成的一种恶性肿瘤。该研究通过检测UC、CD和CAC组织中相关微小核糖核酸(mi RNA)的水平,初步探讨其作为肠炎癌转化分子标志物的可能性,并对在肠炎和CAC中显著变化的一组mi RNAs进行靶基因归集和生物信息学分析,为以mi RNAs为靶点的基因治疗提供理论和实验基础。方法:采用实时荧光定量聚合酶链反应(real-time fluorescent quantitative polymerase chain reaction,RTFQ-PCR)技术,检测13例UC组织、3例CD患者组织、12例CAC组织及8例正常肠组织中16种mi RNAs的表达。通过生物信息学对显著变化的一组mi RNA进行靶基因分析,将文献中已报导的所有靶基因进行汇总,并利用DAVID数据库对靶基因进行功能富集分析(GO-analysis)和信号转导通路富集分析(KEGG-analysis,BIOCARTA-analysis)。结果:炎症相关mi R-146a和癌症相关mi R-27a、mi R-29a、mi R-20a、mi R-21在UC、CD和CAC中的表达都显著高于正常结肠组织,且这一组mi RNA的靶基因都富集在癌症相关通路、免疫信号相关通路和炎癌转换相关通路上。结论:mi R-146a、mi R-27a、mi R-29a、mi R-20a和mi R-21可能是参与肠炎向结直肠癌转化的一组mi RNA。
【作者单位】： 江南大学附属医院肿瘤研究所;南京军区南京总医院检验科;美世大学药学院制药科学系癌症纳米医学实验室;
【关键词】： 微小核糖核酸 溃疡性结肠炎 克罗恩病 肠炎相关结直肠癌 实时荧光定量聚合酶链反应 GO分析 KEGG分析 BIOCARTA分析
【基金】：国家自然科学基金(81301784,81272299,81000867)
【分类号】：R735.34;R574
【正文快照】： 3.美世大学药学院,制药科学系,癌症纳米医学实验室,佐治亚州亚特兰大30341炎症性肠病(inflammatory bowel diseases,I B D)为一组慢性肠道疾病,包括溃疡性结肠炎(ulcerative colitis,UC)与克罗恩病(Crohn’sdisease,CD)[1-2]。IBD是一类病因不明的肠道慢性非特异性炎症,其诊断

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