一个桥本氏甲状腺炎家系的致病基因研究及SNP rs12532、rs870142与藏族先心病发病风险的关联分析

发布时间：2022-02-26 21:42

　　背景:桥本氏甲状腺炎（HT）是一类复杂的自身免疫性甲状腺疾病,其发病与环境暴露和特异性易感基因有关。该疾病中女性发病率高于男性。到目前为止,前期研究虽已阐明了一些易感位点,包括有PTPN22、FOXP3和CD25等,但该疾病的病因和发病机制仍未研究清楚。方法:我们收集到一个HT三代家系,其中有6名成员患病,均为女性。选取该家系中先证者及其3名患病亲属进行了全外显子组测序（WES）,根据已设计的严格标准对测序结果进行检测和筛选,识别该家系致病基因突变。利用采集到的该家系中所有成员的外周血样本进行Sanger测序,以验证候选致病基因和突变,并通过在线网站对相关蛋白进行有害性分析。结果:经过全外显子组测序和生物信息分析,我们识别出一个PTPN22基因罕见错义突变（NM₀15967.5;c.77A>G;p.Asn26Ser）。PTPN22 是该疾病的一个易感基因,与多种自身免疫性疾病的发生风险显著相关。公共数据库均显示该错义突变是极其罕见的。Sanger测序显示该家族中所有女性患者均携带有该突变。保守性分析显示该位点在蛋白中较为保守,并且突变导致该位点的氨基酸疏水性... 

【文章来源】：北京协和医学院北京市211工程院校985工程院校

【文章页数】：69 页

【学位级别】：硕士

【文章目录】：
主要英文缩略词对照表
第一部分 一个桥本氏甲状腺炎家系的致病基因研究
    摘要
    Abstract
    一、前言
    二、材料与方法
        2.1 材料
        2.2 实验方法
    三、实验结果
        3.1 家系描述及其临床表现
        3.2 外显子组测序质量
        3.3 家系候选变异筛选
        3.4 PTPN22罕见错义突变
        3.5 家系成员PTPN22突变验证
        3.6 有害性分析及其蛋白结构
    四、讨论
    五、小结
第二部分 单核苷酸多态性位点rs12532和rs870142与藏族人群先天性心脏病发病风险的关联分析
    摘要
    Abstract
    一、前言
    二、材料与方法
        2.1 材料
        2.2 实验方法
    三、实验结果
        3.1 临床特征
        3.2 rs12532与CHD发病相关性的分析
        3.3 rs870142与CHD发病相关性的分析
        3.4 单体型分析
    四、讨论
    五、小结
参考文献
文献综述 先天性心脏病的遗传学研究
    参考文献
致谢
研究生简历


【参考文献】：
期刊论文
[1]高原眼病[J]. 律鹏,张文芳.  高原医学杂志. 2004(02)



本文编号：3645029