Hsa-miR-181b-5p在急性Stanford A型主动脉夹层发病的作用及机制探索
发布时间:2024-01-26 22:08
目的:通过对前期急性Stanford A型主动脉夹层病例对照研究的主动脉血管壁组织基因芯片检测结果进行分析,选取miRNA差异表达谱中表达差异明显且具有研究价值的hsa-miR-181b-5p,通过生物信息学分析来探讨其在急性Stanford A型主动脉夹层发病可能参与的分子机制。方法:选取2018年1月至2019年3月期间中国医学科学院阜外医院深圳医院(深圳市孙逸仙心血管医院)收治的急性Stanford A型患者,收集手术切取的升主动脉夹层破口处血管壁组织10例,同一患者非主动脉夹层破口处升主动脉血管壁组织10例;另行选取同时期行心脏移植手术或主动脉瓣置换术患者主动脉血管壁组织5例。前期运用基因芯片检测技术获取血管壁组织miRNAs表达谱。综合分析后选出目标miRNA,通过在线数据库microBase、David等分析网站进行相关生物信息学分析,研究hsa-miR-181b-5p参与急性Stanford A型主动脉夹层可能的信号通路及发病机制。结果:基因芯片初筛结果进行组间分析,在同一筛选标准下,A/C有193种miRNAs明显差异表达,其中48中上调表达,145种下调表达;A/B共...
【文章页数】:79 页
【学位级别】:硕士
【文章目录】:
摘要
Abstract
主要英文缩略词表
第一章 绪论
第二章 实验研究材料与方法
2.1 研究材料
2.1.1 研究标本来源与分组
2.1.2 伦理审核和临床资料收集
2.1.3 研究所用试剂、相关仪器及设备
2.1.4 研究样本制作流程
2.2 实验研究方法
2.2.1 预存样本totalRNA的提取以及质量检测
2.2.2 预存样本totalRNA的去磷酸化及标记
2.2.3 芯片洗涤及扫描
2.2.4 数据提取及分析
2.3 数据统计和生信分析
2.3.1 一般临床资料统计
2.3.2 miRNA的筛选与生物信息学分析
第三章 实验研究结果
3.1 入选者临床资料的统计结果
3.2 样本totalRNA质检结果
3.2.1 totalRNA纯度、浓度与总量测定结果
3.2.2 totalRNA完整性测定结果
3.2.3 基因芯片扫描图
3.3 miRNA芯片扫描结果
3.3.1 三组样本miRNA差异表达结果
3.3.2 筛选结果绘制表格与图片
3.3.3 目标miRNA的选取
3.4 生物信息学分析结果
3.4.1 目标miRNA下游靶基因预测
3.4.2 绘制靶基因网络图谱
3.4.3 关键基因的筛选
3.4.4 目标miRNA下游靶基因的GO分析结果
3.4.5 KEGG通路分析
3.5 miRNAs/lncRNA互作网络
第四章 讨论
4.1 研究样本质量检测
4.2 芯片初筛结果以及目标miRNA的选取
4.3 目标miRNA的靶基因预测以及GO分析
4.4 目标miRNA靶基因KEGG pathway分析
4.4.1 PI3K-Akt信号通路
4.4.2 MAPK信号通路
4.4.3 黏合连接(Adherens junction)
4.5 不足及展望
第五章 结论
第六章 参考文献
第七章 文献综述
参考文献
研究生期间发表的论文
致谢
本文编号:3885779
【文章页数】:79 页
【学位级别】:硕士
【文章目录】:
摘要
Abstract
主要英文缩略词表
第一章 绪论
第二章 实验研究材料与方法
2.1 研究材料
2.1.1 研究标本来源与分组
2.1.2 伦理审核和临床资料收集
2.1.3 研究所用试剂、相关仪器及设备
2.1.4 研究样本制作流程
2.2 实验研究方法
2.2.1 预存样本totalRNA的提取以及质量检测
2.2.2 预存样本totalRNA的去磷酸化及标记
2.2.3 芯片洗涤及扫描
2.2.4 数据提取及分析
2.3 数据统计和生信分析
2.3.1 一般临床资料统计
2.3.2 miRNA的筛选与生物信息学分析
第三章 实验研究结果
3.1 入选者临床资料的统计结果
3.2 样本totalRNA质检结果
3.2.1 totalRNA纯度、浓度与总量测定结果
3.2.2 totalRNA完整性测定结果
3.2.3 基因芯片扫描图
3.3 miRNA芯片扫描结果
3.3.1 三组样本miRNA差异表达结果
3.3.2 筛选结果绘制表格与图片
3.3.3 目标miRNA的选取
3.4 生物信息学分析结果
3.4.1 目标miRNA下游靶基因预测
3.4.2 绘制靶基因网络图谱
3.4.3 关键基因的筛选
3.4.4 目标miRNA下游靶基因的GO分析结果
3.4.5 KEGG通路分析
3.5 miRNAs/lncRNA互作网络
第四章 讨论
4.1 研究样本质量检测
4.2 芯片初筛结果以及目标miRNA的选取
4.3 目标miRNA的靶基因预测以及GO分析
4.4 目标miRNA靶基因KEGG pathway分析
4.4.1 PI3K-Akt信号通路
4.4.2 MAPK信号通路
4.4.3 黏合连接(Adherens junction)
4.5 不足及展望
第五章 结论
第六章 参考文献
第七章 文献综述
参考文献
研究生期间发表的论文
致谢
本文编号:3885779
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