致扩张型心肌病LMNA突变的下游基因筛选与分析

发布时间：2024-04-28 02:12

　　核纤层蛋白A(Lamin A)是核纤层的主要结构成分,位于核内膜下方,主要起结构支架和支撑作用。编码Lamin A的基因LMNA位于1号染色体,含12个外显子,主要编码蛋白Lamin A和Lamin C。LMNA基因的突变可导致多种疾病,主要影响横纹肌组织、周围神经及脂肪组织,还有的突变同时影响几种组织,引起严重的表型变化。LMNA突变引起的效应主要包括:细胞核结构的改变、相互作用蛋白的定位与表达错误、多种不同细胞信号通路的激活以及基因表达的改变等。目前,LMNA基因突变的致病机制尚未完全清楚,且不同突变的致病的分子机制并不完全相同。我们前期在伴房室传导阻滞的扩心病家系中鉴定出一个新的LMNA基因突变,该突变位于9号内含子末端,突变后基因缺失10号外显子。为探究该突变引起的基因表达变化及致病机制,进行以下实验:(1)HEK-293-TSA细胞在转染LMNA野生及突变质粒后,进行转录组测序;(2)分析差异性表达的基因,并在细胞水平进行验证。转录组测序结果显示,差异表达的基因为52个,其中上调6个,下调46个;其中,编码蛋白的基因35个,上调2个,下调33个。依据差异倍数和显著水平两个参数...

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图1.1LMNA基因编码的四种A型核纤层蛋白（图片来源：http://www.umd.be/LMNA/）

图1.1LMNA基因编码的四种A型核纤层蛋白（图片来源：http://www.umd.be/LMNA/Figure1.1FourAtypeLaminsencodedbyLMNAgene.2核纤层蛋白结构核纤层蛋白在整个进化过程中高度保守，蛋白结构主要由3....

图1.2核纤层蛋白的结构示意图

图1.2核纤层蛋白的结构示意图[9]Figure1.2ThestructureofLaminproteinsaminA（646aa）首先由基因LMNA翻译为PrelaminA（664aa），然后工。（1）法尼基转移酶在羧基末端CaaX盒中添加十五....

图1.3LaminA的翻译后加工过程

图1.2核纤层蛋白的结构示意图[9]Figure1.2ThestructureofLaminproteins（646aa）首先由基因LMNA翻译为PrelaminA（664aa），然1）法尼基转移酶在羧基末端CaaX盒中添加十五碳的法尼基化盒进行....

图3.1LMNA的RNA水平表达变化与差异表达基因的分析图

图3.1LMNA的RNA水平表达变化与差异表达基因的分析图）对细胞转染质粒后的LMNA转录水平表达量，与对照组相比，野生和突变组的LMNA表300多倍（n=3，**=P<0.01，Mean±SD）。（B）样本间基因差异性表达分析热图(n=1代表样本，纵坐标代表基因聚类，颜....

本文编号：3966022