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线粒体基因组测序揭示G3460A合并G9804A导致Leber遗传性视神经病

发布时间:2017-04-10 11:20

  本文关键词:线粒体基因组测序揭示G3460A合并G9804A导致Leber遗传性视神经病,由笔耕文化传播整理发布。


【摘要】:目的:本实验拟通过检测线粒体基因组G3460A、G9804A在Leber遗传性视神经病变中位点突变情况,进而探讨基因组G346A、G9804A在Leber遗传性视神经病变中致病机制,以及线粒体母系遗传在Leber遗传性视神经病变中作用。方法:一个LHON家系中,先证者有1个舅舅发病,其他均正常。调查该家系所有健在人员共11人,包括先证者、先证者的外婆、母亲、父亲、2个舅舅(1个舅舅未婚单身)、舅妈、舅舅的女儿和儿子、先证者的弟弟和妹妹,并采集10ml抗凝血,采用Ficoll分离液分离外周血单个核细胞(PBMC),一部分PBMC用来分离线粒体并提取线粒体基因组DNA,根据目前报导的LHON相关mtDNA突变位点设计PCR引物,并进行PCR扩增,然后将PCR产物进行测序。另外一部分PBMC用来构建线粒体DNA文库,然后根据线粒体基因组设计叠瓦状探针对DNA文库中的线粒体基因进行捕获,将捕获后的DNA进行柱子纯化,然后采用Illumina引物进行PCR扩增,将PCR产物纯化后,在2代测序仪Hisiq2500进行测序,并采用生物信息学分析软件对测序结果进行分析,寻找与LHON相关的mtDNA突变位点。 结果:采用抽提的线粒体基因组DNA进行常见的mtDNA突变位点PCR检测,发现先证者、发病的舅舅、外婆以及母亲存在G3460A突变位点,并且,先证者的弟弟也存在该突变位点,但没有发病。为进一步探讨该家系LHON发病的原因,对线粒体全基因组进行测序,发现先证者、以及发病的舅舅存在G9804A突变位点,但是,先证者的弟弟在该位点不存在突变。并且,发现先证者另1个表型正常的舅舅存在G9804A突变位点。同时,在这个家系中还发现了39个共同的非热点突变位点。文献查阅和生物信息学分析发现G3460A位点突变(氨基酸突变为A52T)导致电子呼吸链酶复合体I中的亚单位(NADH脱氢酶)的活性降低,复合物I在光诱导的神经传导通路中具有非常重要作用;G9804A位点突变(氨基酸突变为A200T)会导致电子呼吸链酶复合体IV中的亚单位(线粒体细胞色素C氧化酶亚基Ⅲ,MTCO3)产生缺陷,影响细胞的功能。 结论:1)线粒体基因组G3460A合并G9804A位点突变导致Leber遗传性视神经病变;2)线粒体母系遗传会在子代中存在个体差异,并且,子代线粒体基因组DNA可能会产生新的突变。
【关键词】:Leber遗传性视神经病 线粒体DNA 多聚酶链式反应 线粒体电子呼吸链
【学位授予单位】:南华大学
【学位级别】:硕士
【学位授予年份】:2014
【分类号】:R774.6
【目录】:
  • 中文摘要4-6
  • Abstract6-8
  • 前言8-11
  • 研究对象与材料11-13
  • 1、研究对象11
  • 2、主要试剂和材料11-12
  • 3、主要仪器设备12-13
  • 研究方法13-19
  • 1、线粒体基因PCR扩X,

    本文编号:296613

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