WES筛查RP致病基因PRPF31新位点及RP候选基因EMC9的功能研究

发布时间：2021-08-20 19:51

　　视网膜色素变性（retinitis pigmentosa,RP）是一种遗传性眼部疾病,它最终会导致失明。目前已鉴定了超过70个RP基因,但仍有35%⁴5%的RP病人无法用已知基因解释,根据该疾病的相关研究提示还有很多未知RP基因等待鉴定。基于我们对RP复杂发病机制的认识不清晰,目前尚缺乏并且公认有效的干预手段来防治RP。对RP致病基因新突变及新型候选基因的发现是首要目的,对RP分子诊断、治疗方向和分子遗传学研究具有重要意义。然而传统Sanger测序已经无法满足需求,其费用高额、耗时巨大、且无法获取未知致病基因,随着二代测序技术的发展,全外显子测序（whole exome sequencing,WES）运用在疾病研究中成功案例越来越多,它们逐渐成为疾病研究中极为常用的筛查手段,它们具有高的灵敏度,低成本投入等优点,值得一提的是WES可以检测到未知致病基因。在此研究中,我们利用WES对收集到的家系及散发患者筛查,得到RP已知致病基因的一个新致病突变位点、一个候选致病突变位点和一个常染色体隐性遗传（arRP）候选基因:（1）在中国人群中,我们检测到常染色体显性遗传（ad... 

【文章来源】：电子科技大学四川省 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校

【文章页数】：73 页

【学位级别】：硕士

【文章目录】：
摘要
abstract
第一章 绪论
    1.1 视网膜色素变性的临床研究
        1.1.1 视网膜与视网膜色素变性
        1.1.2 典型RP的临床特征及鉴定
    1.2 视网膜色素变性的治疗方向
    1.3 视网膜色素变性的遗传异质性
        1.3.1 遗传方式多样化
        1.3.2 致病基因多样化
        1.3.3 基因突变多样化
    1.4 视网膜色素变性相关疾病
    1.5 NGS和WES
    1.6 本论文的主要工作
    1.7 本论文的结构安排
第二章 实验与方法
    2.1 WES筛查RP致病基因PRPF31新位点
        2.1.1 研究对象
        2.1.2 实验材料
        2.1.3 主要的实验方法与步骤
    2.2 RP候选基因EMC9的功能研究
        2.2.1 实验材料
        2.2.2 实验方法和步骤
    2.3 本章小结
第三章 结果
    3.1 WES筛查RP致病基因PRPF31新位点
        3.1.1 WES测序及Sanger测序验证
        3.1.2 突变位点的生物信息学分析
    3.2 RP候选基因EMC9的功能研究
        3.2.1 EMC9基因及其致病位点生物信息学分析
        3.2.2 EMC9基因突变型表达载体的构建
        3.2.3 EMC9基因突变型蛋白表达和定位的检测
        3.2.4 EMC9基因在人和小鼠各组织中的表达情况
    3.3 本章小结
第四章 讨论
    4.1 WES筛查RP致病基因PRPF31新位点
    4.2 RP候选基因EMC9的功能研究
    4.3 本章小结
第五章 结论与展望
    5.1 WES筛查RP致病基因PRPF31新位点
        5.1.1 本文的主要贡献
        5.1.2 展望
    5.2 RP候选基因EMC9的功能研究
        5.2.1 本文的主要贡献
        5.2.2 展望
致谢
参考文献
攻读硕士学位期间取得的成果


【参考文献】：
期刊论文
[1]A novel mutation in PRPF31, causative of autosomal dominant retinitis pigmentosa, using the BGISEQ-500 sequencer[J]. Yu Zheng,Hai-Lin Wang,Jian-Kang Li,Li Xu,Laurent Tellier,Xiao-Lin Li,Xiao-Yan Huang,Wei Li,Tong-Tong Niu,Huan-Ming Yang,Jian-Guo Zhang,Dong-Ning Liu.  International Journal of Ophthalmology. 2018(01)
[2]A COMPLETE SCREEN FOR MUTATIONS OF THE RHODOPSIN GENE IN A PANEL OF CHINESE PATIENTS WITH AUTOSOMAL DOMINANT RETINITIS PIGMENTOSA[J]. Xiao-li Zhang1,Ming Liu2,Xiao-hong Meng3,Wei-ling Fu1*,Zheng-qin Yin3,Xue Zhang1,and Jun-fu Huang11Clinical Laboratory Center,2Department of Cardio-thoracic Surgery,3Department of Ophthalmology and Visual Sciences,Affiliated South-West Hospital,Third Military Medical University,Chongqing 400038.  Chinese Medical Sciences Journal. 2005(01)
[3]几种主要眼遗传病在我国的发病情况与遗传规律[J]. 胡诞宁.  遗传学报. 1988(03)



本文编号：3354123