云南省部分地区蜱携带弹状病毒的调查研究
本文选题:云南省 + 高通量测序 ; 参考:《大理大学》2017年硕士论文
【摘要】:目的:为了了解云南省蜱携带病毒的现状,掌握蜱携带病毒的分布、感染和遗传进化情况,为相关疾病的防治提供科学指导。方法:首先采用高通量测序方法获得样品中的病毒谱,再根据病毒的核苷酸序列设计特异性引物,用RT-PCR的方法来检测蜱携带病毒的感染现状,并对阳性样品进行病毒分离。对重要病毒扩增病毒基因组序列,用生物信息学软件进行遗传进化分析;原核细胞表达病毒核衣壳蛋白,并免疫兔子制备表达蛋白的抗体。结果:高通量测序获得的样品的核酸读数总数为12596条,获得6株病毒,其中1株病毒被命名为云南蜱携带病毒2(Yunnan Tick Virus2,YNTV2),其与在武汉发现的武汉蜱携带病毒1(Wuhan Tick virus 1,WHTV1)的同源性为96%,属于未分类的迪玛弹状病毒1类(Unclassified Dimarhabdovirus 1);YNTV2在云南省4个县蜱中的感染率由高到低分别为:怒江州泸水县45.24㳠(38/84)、大理州宾川县16.13%(5/31)、红河州泸西县9.09%(4/44)和大理州洱源县5.26㳠(1/19)。对YNTV2进行病毒分离,未获得成功。用原核细胞表达和纯化了YNTV2的核衣壳蛋白,并制备了抗体。结论:云南省4县蜱携带的病毒主要是布尼亚病毒科、弹状病毒科和其它一些未分类的病毒,呈现病毒遗传多样性的特点。YNTV2在云南4个调查的县中,泸水县的感染率最高。原核细胞表达和纯化的YNTV2核衣壳蛋白可用于血清流行病学调查。
[Abstract]:Objective : To understand the present situation of tick - borne viruses in Yunnan province , to grasp the distribution , infection and genetic evolution of tick - borne viruses , and to provide scientific guidance for the prevention and treatment of related diseases .
【学位授予单位】:大理大学
【学位级别】:硕士
【学位授予年份】:2017
【分类号】:R181.3
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,本文编号:1817343
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