钦州市HIV-1流行状况及亚型分析

发布时间：2020-07-15 07:53

【摘要】：目的:流行病学与分子生物学方法相结合,了解掌握钦州市HIV-1的流行状况及其亚型分布特征,为今后钦州乃至广西地区的HIV-1的防控工作提供资料和依据。方法:以调查问卷的形式收集50例钦州市HIV-1感染者的人口学及流行病学资料,每例感染者采集抗凝全血5-10毫升,提取血浆病毒RNA,用逆转录%q巢式PCR法扩增gag区核酸片段,对PCR扩增产物进行鉴定,将阳性扩增产物送北京军事医学科学院微生物流行病研究所进行基因测序,用BioEdit、MEGA5.03软件、Distance程序及在线分析工具Genotyping对所测得序列进行裁剪、校正、比对、构建系统进化树和亚型分析。结果:1.本实验共收集血液样本50例,其人口学及流行病学特征如下:(1)50例感染者的居住地包含钦州市钦南区,钦北区及下辖的浦北县、灵山县。(2)感染者的男女比例为1.38:1,小于40岁的感染者31例,汉族及壮族感染者48例。(3)异性传播和静脉吸毒两种传播途径所占的比例为96%。2.50例血液样本经血浆病毒RNA提取,逆转录%q巢式PCR扩增,基因测序最终获得36条基因序列,扩增率为72%。3.经美国NCBI进行在线初步分型,及MEGA5.03软件构建系统树进一步验证,最终确定36条序列包含01_ae、07_bc、08_bc3种重组毒株,其中01_ae亚型32例(88.90%),07_bc亚型2例(5.55%),08_bc亚型2例(5.55%),各亚型间的基因离散率分别为8.62%,6.47%,5.73%。4.系统进化分析:32例01_ae亚型重组毒株与来自泰国的参考株01_ae.th.91.tn240.l11761聚在一起,两者的基因离散率最小,为(9.12±1.76)%,2例07_bc亚型重组毒株与来自中国的参考株07_bc.cn.97.97.cn001_c54.af286226聚在一起,两者的基因离散率最小,为(7.31±2.43)%,2例08_bc亚型重组毒株与中国广西的bc重组代表株08_bc.cn.97.97.cngx_9f.ay008717聚在一起,两者的基因离散率最小,为(6.64±2.58)%。5.不同亚型的传播途径分布:在32例01_ae亚型感染者中,有30例有不安全性行为史,2例有静脉吸毒史,在各2例07_bc和08_bc亚型感染者中,均有不安全性行为史。结论:1.hiv-1已在钦州市各个区县全面流行,男女构成比趋于平衡,感染者以汉族及壮族为主,小于40岁的青壮年居多,以性传播和静脉吸毒为主要传播途径。2.钦州市hiv-1感染者中存在01_ae、07_bc、08_bc三种流行毒株,以01_ae亚型为主,且01_ae亚型已从高危人群向普通人群扩散,并成为钦州乃至广西地区的主流亚型。3.由基因离散率推测各亚型在钦州市的流行时间约为01_ae亚型9-15年、07_bc亚型8-12年,08_bc亚型6-10年。4.从分子生物学角度揭示了钦州市HIV-1的流行毒株的多样性,钦州市的HIV-1防控工作已不容小觑。
【学位授予单位】：桂林医学院
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2015
【分类号】：R512.91;R181.3

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本文编号：2756205