磷酸三苯酯致大鼠肝脏代谢紊乱的生物信息学分析

发布时间：2021-10-09 05:52

　　[背景]磷酸三苯酯（TPHP）是目前应用最广泛的有机磷酸酯类阻燃剂之一,已在多种环境介质中被检测到。由于该化合物的多重毒性,近年来TPHP的健康风险引起了广泛的关注。然而,有关TPHP暴露对肝脏代谢影响的研究较少。[目的]基于转录组测序数据,采用生物信息学方法探讨TPHP暴露对大鼠肝脏代谢紊乱的效应。[方法]基于基因表达数据库（GEO）获得基因表达谱数据集。采用主成分分析和层次聚类分析方法,依据不同剂量组的基因表达模式的相似程度将样本归类至对照组（0 mg·kg-1,含5个样本）、低剂量组（55.0、110.0、220.0 mg·kg-1,含9个样本）和高剂量组（441.0、881.0 mg·kg-1,含6个样本）;利用R 3.5.3软件中limma包筛选差异表达基因（DEGs）。运用cluster Profiler包对DEGs进行基因本体（GO）、京都基因和基因组数据库（KEGG）富集分析。利用STRING网络数据库建立蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）网络,并运用Cytoscape 3.7.1软件的网络分析插件Cyto Hubba筛选中心基因。最后,运用cluster Profile... 

【文章来源】：环境与职业医学. 2020,37(02)北大核心CSCD

【文章页数】：10 页

【部分图文】：

GSE121134数据集样本分组信息

Arntl基因高表达组和低表达组的GSEA结果显示，一共有25条通路被富集，其中Arntl基因高表达组有19条通路，涉及精氨酸和脯氨酸代谢、背腹轴线形成、朊病毒疾病、扩张型心肌病、造血细胞系、致病性大肠杆菌感染、细胞外基质受体相互作用、黏着斑、细胞黏附分子、细胞间隙连接、利什曼原虫感染、转化生长因子-β（transforming growth factor-beta,TGF-β）信号通路、血管平滑肌收缩、哮喘、不饱和脂肪酸的生物合成、PPAR信号通路、细胞因子-受体相互作用、白细胞跨内皮迁移、系统性红斑狼疮生物途径；低表达组有6条通路，包括甾体生物合成、同源重组合、DNA复制、其他甘氨酸降解、萜类骨架生物合成和丁酸甲酯代谢生物途径，详见图6。GSEA结果提示，Arntl基因可能通过以上生物学通路影响TPHP的代谢紊乱效应。图4 低剂量组（A）和高剂量组（B）的KEGG通路富集分析结果

低剂量组（A）和高剂量组（B）的KEGG通路富集分析结果

【参考文献】：
期刊论文
[1]塑胶跑道中有机磷酸酯的含量及健康风险[J]. 印红玲,刘琴,廖林群,王震,罗怡,邓旭,丁浚刚,唐铭.  环境科学. 2017(11)



本文编号：3425766