苯对C3H/He小鼠骨髓细胞转录组表达的影响:基于转录组测序技术

发布时间：2021-10-13 09:57

　　[目的]应用转录组测序（RNA sequencing,RNA-seq）技术,研究苯对小鼠骨髓细胞转录组表达和信号通路的影响,为苯对小鼠骨髓细胞毒性的可能作用机制提供科学线索。[方法]将C3H/He小鼠随机分为苯暴露组[160 mg/（kg·d）]与对照组[0 mg/（kg·d）],每组10只,以皮下注射的方式染毒,每周5次,连续4周。分离小鼠的骨髓细胞,应用RNA-seq技术对苯暴露和对照组小鼠的骨髓细胞进行转录组测序,并对测序结果进行基因差异表达、基因功能与信号通路富集以及基因共表达分析。[结果]RNA-seq结果显示,苯染毒后共有227个基因的表达发生明显变化,其中122个基因下调,105个基因上调。基因功能与信号通路富集分析结果显示,这些差异基因主要富集在免疫、凋亡、代谢、氧化应激、造血谱系等功能和通路上。差异基因共表达分析显示,调控度大于10的基因有14个,其中Ccr9、Xaf1、Flt3、Cd72分别是细胞免疫、细胞凋亡、造血细胞谱系、造血细胞分化等通路上的重要基因。[结论]苯暴露可导致小鼠骨髓细胞基因表达谱发生变化,可引起小鼠骨髓细胞免疫、凋亡、代谢、氧化应激、造血谱系等功... 

【文章来源】：环境与职业医学. 2017,34(07)北大核心CSCD

【文章页数】：9 页

【部分图文】：

苯染毒4周后小鼠骨髓细胞差异表达基因的共表达调控网络图

lism）3<0.05<0.05Gpx1、Gstm5、Gpx4急性髓性白血病（Acutemyeloidleukemia）3<0.05<0.05Flt3、Ccnd1、Pim1［注］红色代表在染毒组中高表达，绿色代表在染毒组中低表达，点越大调控能力相对越强，实线代表基因间呈正相关，虚线代表基因间呈负相关。［Note］Redrepresentshighexpressionintheexposuregroup，greenrepresentslowexpressionintheexposuregroup，andlargersizesuggestsstrongerdegree.Thesolidlinesrepresentapositivecorrelationbetweenthegenes，andthedashedlinesrepresentanegativecorrelationbetweenthegenes.图2苯染毒4周后小鼠骨髓细胞差异表达基因的共表达调控网络图Figure2Co-expressionnetworkofdifferentiallyexpressedgenesinbonemarrowcellsofmiceexposedtobenzeneforfourweeks

【参考文献】：
期刊论文
[1]低水平职业性苯接触人群健康效应及生物标志物研究[J]. 陈铿铿,黄振烈,赖关朝,吴邦华,杨爱初,曾丽海,罗巧,周珊宇,陈雯,黄汉林.  中国职业医学. 2015(06)
[2]苯致血液毒性遗传易感性与外源化合物代谢酶基因多态性[J]. 陈艳.  卫生研究. 2002(02)

博士论文
[1]基于RNA-seq与small RNA-seq进行奶牛产奶性状功能基因挖掘及生物信息学预测牛新miRNA[D]. 崔晓钢.中国农业大学 2015
[2]SM22α敲除小鼠血管转录组学分析及差显基因的功能验证[D]. 陈荣.河北医科大学 2014
[3]DNA损伤修复基因多态与苯作业工人遗传损伤易感性关系的研究[D]. 张静.新疆医科大学 2012

硕士论文
[1]葡萄糖-6-磷酸脱氢酶缺陷对苯造血毒性的易感性与机制研究[D]. 杨文文.东南大学 2016
[2]基于RNA-Seq技术的人转录组分析研究[D]. 陈超.中南大学 2011



本文编号：3434436