苯并芘暴露大鼠海马组织的全基因组DNA甲基化差异分析
发布时间：2022-01-24 01:32
目的研究苯并芘暴露大鼠海马组织的DNA甲基化差异,探讨苯并芘对海马功能损伤的机制。方法将大鼠分为对照组和苯并芘染毒组,每组10只;染毒结束后,采用Morris水迷宫检测大鼠的空间记忆学习能力,随后对大鼠海马进行HE染色与简化表观亚硫酸氢盐测序法（reduced representation bisulfite sequencing, RRBS）测序,对测序结果进行GO和KEGG分析,用qRT-PCR检测Tnr基因与Pla2g2a基因mRNA的表达。结果 Morris水迷宫与HE染色发现苯并芘暴露导致了大鼠空间学习记忆能力的障碍与海马组织损伤;RRBS测序后检测到差异性甲基化区域32个,GO分析富集到871条GO条目,KEGG分析得到52条通路,其中145条GO条目和11条通路显著富集（P<0.05）,苯并芘染毒组与对照组相比,Tnr基因相对表达量减少,而Pla2g2a基因相对表达量增加（P<0.05）。结论与未染毒的大鼠相比,苯并芘染毒后大鼠海马组织存在一定数量的甲基化差异位点,这些甲基化差异位点可能对研究苯并芘导致海马损伤的机制具有重要指导意义。
【文章来源】：第三军医大学学报. 2020,42(04)北大核心CSCD
【文章页数】：8 页
【部分图文】：
不同功能元件区域的甲基化水平分布
表3 差异甲基化基因的KEGG富集分析 通路 通路编号 候选基因数量 P值 基因名称 Ras信号通路 rno04014 3 0.001 Ikbkg; Fgf14; Pla2g2a B细胞受体信号通路 rno04662 2 0.002 Cr2; Ikbkg 凝血与补体级联反应信号通路 rno04610 2 0.003 Plg; Cr2 PI3K-Akt信号通路 rno04151 3 0.004 Ikbkg; Fgf14; Tnr EB病毒感染 rno05169 2 0.021 Cr2; Ikbkg α-亚麻酸代谢 rno00592 1 0.025 Pla2g2a MAPK信号通路 rno04010 2 0.026 Ikbkg; Fgf14 脂肪的消化吸收 rno04975 1 0.039 Pla2g2a 原发性免疫缺陷 rno05340 1 0.039 Ikbkg 亚油酸代谢 rno00591 1 0.040 Pla2g2a 醚脂质代谢 rno00565 1 0.042 Pla2g2a2.5 Tnr与Pla2g2a基因甲基化状态与mRNA的表达
通过Morris水迷宫实验观察两组大鼠的空间记忆和学习能力,结果显示:随着训练时间的增加,两组大鼠的逃避潜伏期时间总体趋势是减少的;从第3天开始,对照组比B[a]P染毒组逃避潜伏期缩短(P<0.05,图1A),对照组与B[a]P染毒组在定位巡航实验时代表性的游泳路径如图1B所示;空间探索实验结果显示:对照组在目标象限时间百分比明显长于B[a]P染毒组(P<0.05,图1C)。2.2 苯并芘对海马的损害作用
【参考文献】：
期刊论文
[1]大鼠BMSCs与ADSCs全基因组DNA甲基化差异分析[J]. 陈旭涛,万卓,韦梦影,杨国栋,宋应亮. 实用口腔医学杂志. 2019(02)
[2]长期负性情绪应激对D-gal大鼠认知功能及海马NR2B基因甲基化表达的影响[J]. 李宁,刘紫阳,詹向红,李伟,刘永,侯俊林. 中国中西医结合杂志. 2019(06)
[3]苯并芘致肺癌的研究进展[J]. 代文娟,黄海燕,胡恭华. 毒理学杂志. 2018(06)
[4]孕期外源物暴露致DNA甲基化异常与发育源性疾病的关系研究[J]. 金灵,张元珍. 中华生殖与避孕杂志. 2018(06)
[5]MAPKs信号通路与阿尔兹海默病的研究进展[J]. 王一夫,刘爽. 世界中医药. 2016(09)
[6]人类基因组DNA甲基化数据分析的研究现状[J]. 凡时财,李承哲,裴云飞. 中国科学:生命科学. 2015(05)
[7]间歇低氧大鼠细胞外信号调节激酶与认知功能变化[J]. 张盼盼,韩晓庆,李琳,王红阳,王玲,郭秀华,雷军旗,杨林. 中国神经精神疾病杂志. 2014(09)
[8]下一代测序技术在表观遗传学研究中的重要应用及进展[J]. 沈圣,屈彦纯,张军. 遗传. 2014(03)
[9]分泌型磷脂酶A2亚家族:结构与功能[J]. 杨武,郭薇,黄春洪. 中国生物化学与分子生物学报. 2013(10)
[10]环境因素对DNA甲基化的影响[J]. 曹家雪,张红平,杜立新. 遗传. 2013(07)
本文编号：3605566
【文章来源】：第三军医大学学报. 2020,42(04)北大核心CSCD
【文章页数】：8 页
【部分图文】：
不同功能元件区域的甲基化水平分布
表3 差异甲基化基因的KEGG富集分析 通路 通路编号 候选基因数量 P值 基因名称 Ras信号通路 rno04014 3 0.001 Ikbkg; Fgf14; Pla2g2a B细胞受体信号通路 rno04662 2 0.002 Cr2; Ikbkg 凝血与补体级联反应信号通路 rno04610 2 0.003 Plg; Cr2 PI3K-Akt信号通路 rno04151 3 0.004 Ikbkg; Fgf14; Tnr EB病毒感染 rno05169 2 0.021 Cr2; Ikbkg α-亚麻酸代谢 rno00592 1 0.025 Pla2g2a MAPK信号通路 rno04010 2 0.026 Ikbkg; Fgf14 脂肪的消化吸收 rno04975 1 0.039 Pla2g2a 原发性免疫缺陷 rno05340 1 0.039 Ikbkg 亚油酸代谢 rno00591 1 0.040 Pla2g2a 醚脂质代谢 rno00565 1 0.042 Pla2g2a2.5 Tnr与Pla2g2a基因甲基化状态与mRNA的表达
通过Morris水迷宫实验观察两组大鼠的空间记忆和学习能力,结果显示:随着训练时间的增加,两组大鼠的逃避潜伏期时间总体趋势是减少的;从第3天开始,对照组比B[a]P染毒组逃避潜伏期缩短(P<0.05,图1A),对照组与B[a]P染毒组在定位巡航实验时代表性的游泳路径如图1B所示;空间探索实验结果显示:对照组在目标象限时间百分比明显长于B[a]P染毒组(P<0.05,图1C)。2.2 苯并芘对海马的损害作用
【参考文献】：
期刊论文
[1]大鼠BMSCs与ADSCs全基因组DNA甲基化差异分析[J]. 陈旭涛,万卓,韦梦影,杨国栋,宋应亮. 实用口腔医学杂志. 2019(02)
[2]长期负性情绪应激对D-gal大鼠认知功能及海马NR2B基因甲基化表达的影响[J]. 李宁,刘紫阳,詹向红,李伟,刘永,侯俊林. 中国中西医结合杂志. 2019(06)
[3]苯并芘致肺癌的研究进展[J]. 代文娟,黄海燕,胡恭华. 毒理学杂志. 2018(06)
[4]孕期外源物暴露致DNA甲基化异常与发育源性疾病的关系研究[J]. 金灵,张元珍. 中华生殖与避孕杂志. 2018(06)
[5]MAPKs信号通路与阿尔兹海默病的研究进展[J]. 王一夫,刘爽. 世界中医药. 2016(09)
[6]人类基因组DNA甲基化数据分析的研究现状[J]. 凡时财,李承哲,裴云飞. 中国科学:生命科学. 2015(05)
[7]间歇低氧大鼠细胞外信号调节激酶与认知功能变化[J]. 张盼盼,韩晓庆,李琳,王红阳,王玲,郭秀华,雷军旗,杨林. 中国神经精神疾病杂志. 2014(09)
[8]下一代测序技术在表观遗传学研究中的重要应用及进展[J]. 沈圣,屈彦纯,张军. 遗传. 2014(03)
[9]分泌型磷脂酶A2亚家族:结构与功能[J]. 杨武,郭薇,黄春洪. 中国生物化学与分子生物学报. 2013(10)
[10]环境因素对DNA甲基化的影响[J]. 曹家雪,张红平,杜立新. 遗传. 2013(07)
本文编号：3605566
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