中国中小学生微量营养素缺乏风险关联SNP位点民族分布特征

发布时间：2022-04-26 22:13

　　目的初步探索中国中小学生微量营养素缺乏风险的关联SNP位点地域特征,为评估微量元素缺乏风险提供基础依据。方法搜集以往研究中报道的143个SNP位点,研究对象来自于2016年中国贫困地区营养健康调查项目义务教育中一至九年级1 130名中小学生的凝固血细胞,采用磁珠法提取DNA,竞争性等位基因法进行分型检测。对差异基因进行GO显著性富集,采用R软件包进行PCA、kinship和SNP位点之间连锁不平衡分析,分析候选SNP位点的特征。如有种群结构的存在,采用Fa ST-LMM模型进行关联分析。结果差异表达基因在生物过程分组中主要富集在催化活性、转运活性、能量代谢途径、类固醇激素、辅酶、维生素A、维生素D和水溶性维生素的代谢等生物学过程中,涉及转录、翻译以及能量代谢相关基因。143个SNP位点分型结果在民族分布上差异有统计学意义,3号染色体上的基因多态性位点在民族间差异有统计学意义。主成分分析PC1显示,位于RAB6B基因上的rs2280673解释效度在25%以下,位于TF基因上的rs1799852解释效度为25%～50%,位于RBP2基因上的rs2118981位点和SRPRB基因上的rs18... 

【文章页数】：4 页

【文章目录】：
1 资料来源与方法
    1.1 MDR-SNPs纳入原则及相关基因功能注释分析
    1.2 样本来源
    1.3 基因分型
    1.4 统计分析
2 结果
    2.1 基因功能注释及富集分析结果
    2.2 连锁不平衡和亲缘关系分析结果
    2.3 主成分分析结果
3 讨论


【参考文献】：
期刊论文
[1]中国不同地区群体遗传结构差异及调整策略研究[J]. 朱猛,吕筠,余灿清,靳光付,郭彧,卞铮,Robin Walters,Iona Millwood,陈铮鸣,沈洪兵,胡志斌,李立明.  中华流行病学杂志. 2019 (01)
[2]母亲MTRR和MTR基因多态性与子代神经管畸形易感性Meta分析[J]. 张春红,霍军生,孙静,黄建.  中国预防医学杂志. 2018(10)
[3]中国人群母亲5,10-亚甲基四氢叶酸还原酶基因C677T多态性与子代神经管畸形易感性关系的Meta分析[J]. 张春红,霍军生,孙静,黄建,朴玮,殷继永.  卫生研究. 2018(02)
[4]《中国居民营养与慢性病状况报告（2015）》解读[J]. 顾景范.  营养学报. 2016(06)
[5]精准医学时代下的精准营养[J]. 陈培战,王慧.  中华预防医学杂志. 2016 (12)



本文编号：3648824