深圳地区哨点监测医院五岁以下儿童病毒性腹泻的分子流行病学研究

发布时间：2022-11-06 19:00

　　研究目的比较分析轮状病毒（Rotavirus,RV）、诺如病毒（Norovirus,NoV）、人副肠孤病毒（ParechovirusA,PeV-A）、星状病毒（Astrovirus,AstV）和肠道腺病毒（Adenovirus,AdV）在深圳地区哨点检测医院儿科门诊和住院病毒性腹泻患儿中的流行病学特征,以期进一步明确深圳地区病毒性腹泻患儿病原谱构成,旨在为病毒性腹泻的科学防治提供依据。研究方法1.收集2017年1月至2018年12月深圳地区哨点监测医院五岁以下1003例门诊和497例住院腹泻患儿病例信息和粪便样本。2.粪便样本经致病菌检测结果阴性后,进行病毒检测和基因分型:提取粪便样本总核酸,设计探针和引物,采用荧光PCR检测5种腹泻病毒;再采用PCR和RT-PCR扩增5种病毒基因分型片段,并进行双向测序,测序结果经BioEdit、MEGA软件剪切比对后,与NCBI中的参考序列比对分型。3.统计分析:数据录入使用EpiData 3.1软件,数据统计分析使用SPSS 22.0软件。结果1.总体检出情况:1500例五岁以下病毒性腹泻患儿中,检测出至少一种腹泻病毒共715例,总检出率为47.... 

【文章页数】：93 页

【学位级别】：硕士

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摘要
ABSTRACT
第一章 前言
    1.1 感染性腹泻概况
    1.2 腹泻病毒病原学特征
    1.3 研究目的和意义
第二章 材料和方法
    2.1 实验材料
        2.1.1 样本来源
        2.1.2 病例定义
        2.1.3 主要仪器
        2.1.4 主要试剂耗材
    2.2 实验方法
        2.2.1 病例信息收集
        2.2.2 样本的前处理
        2.2.3 全自动核酸提取仪(MagNA Pure LC 2.0)提取病毒总核酸
        2.2.4 病毒引物合成
        2.2.5 A组轮状病毒核酸检测和基因分型
        2.2.6 诺如病毒(GⅠ/GⅡ)核酸检测和基因分型
        2.2.7 肠道腺病毒核酸检测和基因分型
        2.2.8 星状病毒核酸检测和基因分型
        2.2.9 人副肠孤病毒核酸检测和基因分型
        2.2.10 问卷录入和统计学分析
第三章 结果
    3.1 5种腹泻病毒阳性患儿流行特征
        3.1.1 5种病毒总体检测情况
        3.1.2 性别分布情况
        3.1.3 年龄分布情况
        3.1.4 时间分布情况
    3.2 轮状病毒检测结果及流行特征
        3.2.1 轮状病毒检测结果
        3.2.2 轮状病毒的性别分布
        3.2.3 轮状病毒的年龄分布
        3.2.4 轮状病毒的时间分布
        3.2.5 轮状病毒G/P基因分型
    3.3 诺如病毒检测结果及流行特征
        3.3.1 诺如病毒检测结果
        3.3.2 诺如病毒的性别分布
        3.3.3 诺如病毒的年龄分布
        3.3.4 诺如病毒的时间分布
        3.3.5 诺如病毒基因分型
    3.4 肠道腺病毒检测结果及流行病学特征
        3.4.1 肠道腺病毒检测结果
        3.4.2 肠道腺病毒的性别分布
        3.4.3 肠道腺病毒的年龄分布
        3.4.4 肠道腺病毒的时间分布
        3.4.5 肠道腺病毒基因分型
    3.5 星状病毒检测结果及流行特征
        3.5.1 星状病毒检测结果
        3.5.2 星状病毒的性别分布
        3.5.3 星状病毒的年龄分布
        3.5.4 星状病毒的时间分布
        3.5.5 星状病毒基因分型
    3.6 人副肠孤病毒检测结果及流行特征
        3.6.1 人副肠孤病毒检测结果
        3.6.2 人副肠孤病毒的性别分布
        3.6.3 人副肠孤病毒的年龄分布
        3.6.4 人副肠孤病毒的时间分布
        3.6.5 人副肠孤病毒基因分型
    3.7 混合感染情况
第四章 讨论
    4.1 5种病毒检出情况比较
    4.2 不同性别5种病毒检出率比较
    4.3 不同年龄5种病毒检出率比较
    4.4 不同月份5种病毒检出率比较
    4.5 5种病毒混合感染情况
    4.6 5种病毒基因型分析
        4.6.1 轮状病毒基因型分析
        4.6.2 诺如病毒基因型分析
        4.6.3 肠道腺病毒基因型分析
        4.6.4 星状病毒基因型分析
        4.6.5 人副肠孤病毒基因型分析
第五章 全文小结
本文的创新点和不足之处
参考文献
攻读学位期间成果
致谢


【参考文献】：
期刊论文
[1]2018年北京市西城区5岁以下儿童病毒性腹泻监测分析[J]. 张军颖,刘潇潇,初艳慧,孙景異,秦京宁,乔富宇.  公共卫生与预防医学. 2019(06)
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[3]天津市2015—2017年5岁以下腹泻病例感染谱及临床特征[J]. 高璐,李佳萌.  中国热带医学. 2019(12)
[4]2017年苏州市5岁以下住院儿童病毒性腹泻病原学分析[J]. 包林,刘成,庞媛媛,覃江纯,崔鹏伟,谭亚运,杭惠.  江苏预防医学. 2019(06)
[5]哈尔滨市腹泻患者星状病毒感染的分子流行病学研究[J]. 石鑫,许军,舒畅,冷焱,曹博,华华.  现代预防医学. 2019(21)
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[9]小儿病毒性腹泻病原谱及临床特征分析[J]. 姜洪波,孟婷玉,王承训,黎伟明,李响,杨显达,孙利伟.  中国实用儿科杂志. 2019(07)
[10]天津地区急性胃肠炎患儿诺如病毒分子流行病学分析[J]. 方玉莲,王维,王萍,赵煜,张同强,李璇,范超萌,林书祥.  中国当代儿科杂志. 2019(02)

硕士论文
[1]重庆地区门诊儿童急性腹泻相关病毒的流行特征与基因特征研究[D]. 赵进.中国人民解放军军事医学科学院 2014



本文编号：3704047