机房环境表面金黄色葡萄球菌的表型和分子特征连续监测研究

发布时间：2023-04-11 18:12

　　目的:本研究旨在掌握某高校机房环境表面金黄色葡萄球菌(简称金葡菌)和耐甲氧西林金葡菌(简称MRSA)污染的流行特征及其持续污染情况,评估环境MRSA污染对人群的潜在威胁;掌握金葡菌和MRSA菌株的耐药谱、分子分型及毒素基因等分子特征,并分析菌株分子分型和分子特征间的潜在关联,掌握菌株的遗传背景。探索环境菌株与人群菌株遗传背景的相似性,揭示潜在的交叉传播风险。方法:采取连续监测研究设计,连续4天对某高校计算机实验室155台计算机的键盘和鼠标表面进行棉拭子采样。对所有金葡菌进行抗菌药物敏感性实验,通过多位点序列(MLST)进行分子分型,通过全基因测序拼接序列后进行毒素基因、耐药基因、Spa分型和SCCmec分型检测。组别间率的比较采用χ²检验。采用UPGMA聚类分析和χ²关联性检验探索菌株的分子型别与表型特征、分子特征之间的潜在关联。结果:(1)污染率:本项目共采集1240份样本,物体表面金葡菌的总污染率为4.1%(51/1240),MRSA的总污染率为0.5%(6/1240),多重耐药金葡菌(MDRSA)的总污染率为1.5%(19/1240);...

【文章页数】：80 页

【学位级别】：硕士

【文章目录】：
摘要
abstract
第一章 前言
第二章 对象与方法
    2.1 研究设计
        2.1.1 采样时间和采样方法
        2.1.2 样本量估算
    2.2 样本采集
    2.3 金葡菌的分离鉴定
        2.3.1 主要实验材料
        2.3.2 分离鉴定过程
    2.4 抗菌药物敏感性试验
        2.4.1 药敏试验方法
        2.4.2 药敏纸片选取
        2.4.3 实验过程
    2.5 金葡菌基因组DNA的提取
        2.5.1 主要实验材料
        2.5.2 实验步骤
    2.6 金葡菌生物学分析
        2.6.1 PCR扩增特异性基因
        2.6.2 全基因组测序
        2.6.3 MLST分型
        2.6.4 Spa分型
        2.6.5 耐药基因检测
        2.6.6 毒素基因检测
    2.7 质量控制
        2.7.1 采样员培训
        2.7.2 采样前物资准备
        2.7.3 实验室质量控制
    2.8 相关定义
    2.9 统计分析
第三章 结果
    3.1 机房环境鼠标和键盘表面金葡菌污染情况
    3.2 金葡菌耐药情况
        3.2.1 金葡菌对11类药物的耐药情况
        3.2.2 连续污染部位耐药情况
        3.2.3 键盘表面与鼠标表面的耐药情况比较
        3.2.4 机房环境表面51株金葡菌的多重耐药情况
        3.2.5 MDRSA与 non-MDRSA的耐药情况比较
    3.3 机房环境表面金葡菌分子分型
        3.3.1 SCCmec分型
        3.3.2 MLST分型
        3.3.3 Spa分型
        3.3.4 所有分型
        3.3.5 连续污染部位分子分型情况
    3.4 机房环境表面金葡菌分子特征
        3.4.1 耐药基因
        3.4.2 毒素基因
    3.5 关联性分析
        3.5.1 分子分型和耐药表型之间的关联
        3.5.2 分子分型和肠毒素基因之间的关联
        3.5.3 分子分型和其他毒素基因之间的关联
    3.6 机房环境与人群金葡菌株之间的比较
        3.6.1 一般情况
        3.6.2 机房环境与人群金葡菌株之间耐药情况的比较
        3.6.3 机房环境与人群金葡菌株之间分子特征的比较
        3.6.4 机房环境与人群金葡菌株之间的聚类分析
第四章 讨论
    4.1 机房环境金葡菌连续污染情况
    4.2 耐药情况
    4.3 分子分型
    4.4 分子特征的关联
    4.5 本研究的优缺点
第五章 结论
参考文献
综述
    参考文献
致谢
攻读硕士期间发表的论文



本文编号：3789531