我国柯萨奇病毒A组6型VP1区基因分子流行病学特征

发布时间：2024-03-13 00:40

　　目的分析我国2010―2018年柯萨奇病毒A组6型(Coxsackievirus A6,CV-A6)毒株VP1区基因流行和进化规律,为手足口病的防治提供科学依据。方法从GenBank获得2010―2018年我国CV-A6病毒全长VP1区核苷酸序列,用MEGA V7.0和Interactive Tree of Life V5 (iTOLV5)软件构建进化树,用DNAstar V8.1.3软件对核苷酸同源性进行分析。结果 880条序列来源的CV-A6毒株以D3亚型为主,占毒株总数的95.45%,不同基因型核苷酸同源性为80.8%～86.0%,同基因型内核苷酸同源性为88.1%～100.0%。D2亚型VP1区相对稳定,无整体氨基酸变异情况;而D3毒株VP1区发生多点氨基酸替换,其中A5T、T283A、N137S、V242I、A30V、I174V氨基酸替换循环出现,这种进化模式与越南地区相似,但与日本地区却不同。VP1区5T、30A、137N、242V比例逐年增加,可能与CV-A6引起我国手足口的轻症和重症病例比例上升有关。结论具有VP1区遗传多样性的CV-A6 D3株的出现可能是CV-A6在...

【文章页数】：6 页

【部分图文】：

图3CV-A6D3亚型VP1区6个氨基酸年度替换比例分布

表3CV-A10病毒VP1区核苷酸序列同源性比对分析Table3ThehomologyanalysisofCV-A6VP1nucleotideacidsequences参考株/各年度毒株基因型/亚型核苷酸同源性(%)2010年2011年2012年....

图12010―2018年我国CV-A6VP1区基因系统进化树

表22010―2018年不同省/自治区/直辖市CV-A6VP1区序列分布情况Table2CV-A6VP1sequencesindifferentprovincefrom2010to2018地区序列数量(条)合计(%)2010年2011年20....

图2CV-A6D2亚型和D3亚型毒株年度比例分布图

所有VP1区核苷酸同源性位于80.8%～100.0%之间;与A/B1/B2/C1/C2参考株相比,同源性为80.8%～86.0%,而与D1/D2/D3相比,同源性为88.1%～100.0%。不同年度VP1区核苷酸相比,同源性在86.1%～100.0%之间,2015―2018年同源....

本文编号：3926944