中国北方人群阿尔茨海默病易感基因的分子流行病学研究
本文关键词：中国北方人群阿尔茨海默病易感基因的分子流行病学研究
【摘要】：目的探索八个基因的变异在中国北方人群阿尔茨海默病中的分子流行病学特征。 方法经文献检索和生物信息学研究分析，将欧美和日本人群中部分阿尔茨海默病(Alzheimer's disease,AD)的易感SNPs位点确定为在北京人群中复制的候选位点,选取8个基因的12个SNPs，分别是CR1(rs3818361, rs6656401)、SORCS3(rs10786828,rs7894737)、 FRMD4A (rs2446581)、 KCNMA1(rs16934131)、 SORL1(rs6589885,rs3781834)、PICALM (rs10792832, rs561655)、NTF3(rs6332)、AR (rs139374285)。通过病例-对照设计，使用PCR-HRM技术进行基因分型并结合测序验证基因分型结果，对选自北京人群的250例AD患者和438例正常对照12个SNPs进行基因分型检测。比较各SNP基因型与等位基因在病例和对照组间的分布频率,在不同遗传模型中的基因型分布情况，确定可能与北京人群AD发生关联的变异位点。通过累积效应分析及采用广义多因子降维法（GMDR）进行基因-基因交互作用分析以期了解AD发生的遗传流行病学病因。通过ApoE基因分层分析各关联位点与其危险基因型是否有关。 结果1）CR1SNP rs3818361等位基因和基因型在病例和对照组间的分布均有显著性差异（P=0.007，OR=1.374，，95%CI:1.090-1.733; P=2.3×10-6）,等位基因G在病例组中的分布频率显著高于在对照组中的分布频率。在遗传模型分析中，隐性和超显遗传模型在病例和对照组间均有显著性差异(P=4.9×10-6, OR=2.123，95%CI:1.533-2.940;P=4.6×10-7, OR=0.444，95%CI:0.323-0.611)；加法模型也具有显著性差异(P=0.003,OR=1.492，95%CI:1.149-1.937)；共显模型中AG/AA在两组间有显著性差异(P=0.018,OR=0.522，95%CI:0.302-0.901)。 2）SORCS3SNP rs7894737等位基因和基因型在病例和对照组间的分布均有显著性差异（P=0.011，OR=1.470，95%CI：1.091-1.980；P=9.4×10-5）。在遗传模型分析中，隐性遗传模型在病例和对照组间有显著性差异(P=1.8×10-5, OR=12.84，95%CI:2.893-56.970),加法模型也有显著性差异(P=0.011, OR=1.474，95%CI:1.091-1.990)；共显模型中CC/AA在两组间有显著性差异(P=1.6×10-5, OR=13.09，95%CI:2.941-58.29)，CC在病例中的频率明显高于对照。 3）AR SNP rs139374285等位基因和基因型在病例和对照组间的分布均有显著性差异（P=0.001，OR=2.542，95%CI：1.406-4.597；P=0.037）。显性和隐性遗传模型在两组间均有显著性差异(P=0.010, OR=3.708，95%CI:1.275-10.779；P=0.043，OR=2.076，95%CI:1.010-4.268),加法模型也具有显著性差异(P=0.037, OR=1.576，95%CI:1.027-2.420)；共显模型中TT/CC在两组间有显著性差异(P=0.010, OR=3.707，95%CI:1.275-10.779）。 4）本组前期工作中ApoE SNP rs429358等位基因和基因型在病例和对照组间的分布均有显著性差异（P=1.2×10-9，OR=3.516，95%CI：2.302-5.369；P=3.4×10-8）。显性、隐性和超显遗传模型在两组间均有显著性差异(P=8.0×10-9, OR=3.796，95%CI:2.374-6.069；P=0.004, OR=6.656，95%CI:1.504-29.45；P=1.8×10-6, OR=3.154，95%CI:1.942-5.122),加法模型也具有统计学差异（P=4.2×10-8，OR=3.296，95%CI：2.152-5.048）；共显模型中CC/TT在两组间有显著性差异(P=0.001, OR=8.783，95%CI:1.977-39.02)；CT/TT在两组间有显著性差异(P=3.2×10-7, OR=3.426，95%CI:2.104-5.580）。 5）危险基因型累积效应分析结果发现：随着个体携带危险基因型数目的增多，OR值逐渐增大，即含有的危险基因型数目的越多，个体患AD的风险越大。 6）采用GMDR方法分析CR1SORCS3和AR上三个多态性位点的交互作用，结果发现：模型下未见明显的基因-基因间的交互作用(P0.05)。 7）以ApoE SNP rs429358CC+CT和TT基因型进行分层分析，3个关联位点中只发现SORCS3rs7894737在不携带ApoE基因rs429358C等位基因的分层中CC/CA+AA有显著性差异(P=0.048, OR=8.295，95%CI:1.009-68.20)。 结论1）CR1rs3818361, SORCS3rs7894737和AR基因rs139374285可能是AD的易感风险位点；2）患者携带的危险基因型数目越多，个体患AD的风险越大；3）交互作用说明AR、CR1和SORCS3这三个基因之间可能不存在基因-基因的交互作用。
【关键词】：北京人群 阿尔茨海默病 基因 分子流行病学
【学位授予单位】：宁夏医科大学
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2014
【分类号】：R749.16;R181.3
【目录】：
- 摘要4-7
- ABSTRACT7-10
- 中英文缩略词表10-13
- 前言13-17
- 材料与方法17-29
- 结果29-50
- 讨论50-56
- 参考文献56-61
- 文献综述61-68
- 参考文献66-68
- 附录68-75
- 致谢75-76
- 个人简历76
【参考文献】
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本文编号：585181
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