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冠状动脉立体分割算法研究

发布时间:2020-04-09 15:19
【摘要】:随着冠心病诊断需求的不断增加,基于医学图像的辅助诊断已成为提高诊断效率的重要手段。基于CTA数据的冠状动脉立体分割是冠心病辅助诊断的关键技术,已成为研究的热点。受不同设备、不同病人和造影剂分布不均匀等因素的影响,冠状动脉在CTA数据中的清晰度不同,冠状动脉立体分割成为一项具有挑战的任务。本文针对冠状动脉CTA数据,从准确性、自动性和运行速度三个方面,展开了对冠状动脉分割算法的研究,具体工作如下:(1)提出一种基于多特征约束的区域生长分割算法。该算法考虑到冠状动脉粗细不同的管状特性,使用管状滤波器提取不同尺度下的血管相似性特征,同时结合冠状动脉在CTA数据中的密度特征共同作为区域生长的约束条件。本算法很好的解决了单特征区域生长算法容易出现的欠分割现象,提高分割算法的精度。在有先验阈值的情况下,其测试Dice系数为0.88,比单特征方法提高0.2;在没有先验阈值情况下,其测试Dice系数为0.6(同样比单特征方法高),算法运行时间为460秒左右。(2)提出一种结合3D全卷积网络和生长思想的自动分割算法。该分割算法主要有起始种子点定位、局部数据块的分割和种子点搜索策略三个部分:●起始点定位:根据升主动脉和冠状动脉的连通性质,通过分割升主动脉来自动定位冠状动脉根节点,为实现冠状动脉自动分割提供条件;●局部数据块的分割:提出一种多感受野融合的3D分割网络。该部分用尺寸为64×64×64的局部数据块和Dice损失函数解决冠状动脉立体分割中出现的标签分布极不平衡的问题。在网络结构设计上,该网络在编码器末端加入金字塔池化,多感受野融合的结构更好的结合了数据块中的全局信息和局部信息,很好的抑制了其他组织的干扰;此外,在编-解码的全卷积网络结构中加入残差模块、批归一化、Dropout等操作,抑制网络过拟合的同时保证网络的快速收敛;●种子点搜索策略:提出一种基于生长思想的种子点搜索策略,通过分析上一次数据块的分割结果确定下一次选择数据块的中心,提取冠状动脉附近的数据块,实现了高效使用训练好的分割网络;该分割算法在测试集上平均Dice系数为0.76,运行时间在40秒左右。(3)根据本文分割算法实现了冠状动脉的狭窄测量。通过对血管拉直、细化、分段、计算横截面积等操作后,初步可以实现冠状动脉狭窄测量,为冠状动脉狭窄检测和量化分级等应用提供可行性分析。综上所述,本文提出的两种冠状动脉分割算法在测试集上的Dice系数从60%提升到了76%,运行时间从460秒减少到40秒,同时实现了冠状动脉的自动分割。基于本文分割算法的分割结果初步实现了血管狭窄测量,证明了算法的有效性。
【图文】:

数据,冠状动脉,样本,血管成像


的信号经过重建后形成CT图像。当需要研究血管成像时,因为血液的密度和水逡逑很接近不容易在普通CT图像上显示,所以需要注射造影剂对血管进行增强,然逡逑后利用计算机重建算法恢复血管的立体影像。不同视角下的CTA如图2-1所示。逡逑(d)样本二横断位逦(e)样本二矢状位逦(f)样本二冠状位逡逑图2-1不同视角下的CTA数据逡逑冠状动脉分为左冠状动脉和右冠状动脉两个大的分支;目前大部分研究人员逡逑采用美国心脏病协会(AHA)提出的冠状动脉划分标准,该标准将直径大于1.5mm逡逑7逡逑

分布图,冠状动脉,分布图,数据


第二章冠状动脉数据介绍逡逑的冠状动脉分成了邋17段,如图2-2所示。逡逑OM?逡逑图2-2冠状动脉划分解剖图逡逑左冠状动脉分支共丨2段,主要包括左循环支(1丨,13),左对角支(16),逡逑左前降支(6,邋7,,邋8)等大的分支;右冠状动脉分支共5段,主要包括后降支(4)、逡逑右冠(1,2,3)等大的分支。冠状动脉各个分支在CTA图像横断位中如图2-3逡逑所示。逡逑000逡逑图2-3冠状动脉在CTA数据横断位中的分布图逡逑为了存储CTA数据,通常使用固定的编码方式将重建的图像存储在计算机逡逑中。医学图像常用的编码格式有6种,分别为:ANALYZE(Mayo医学成像)、NRRD逡逑(近原始栅格数据)、DICOM(医学数字成像核通讯)、NIFTI(神经影像信息技术)、逡逑PAR/REC(Philips磁共振扫描格式)和MNIC。下面对本文中常使用的两种格式进逡逑行介绍。逡逑NRRI):邋“国家医学图像计算联盟”(NA-MIC)开发的一种存储编码方式,逡逑8逡逑
【学位授予单位】:北方工业大学
【学位级别】:硕士
【学位授予年份】:2019
【分类号】:R816.2;TP391.41

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本文编号:2620928

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