中国汉族人群印记SNP甄

发布时间：2021-10-05 05:28

　　目的：本课题旨在充分利用人类基因组印记基因图谱及国际人类基因组单倍型图（Hapmap）、中国人遗传背景的基因组多态性等大型基因组计划的最新研究成果,初步筛选在中国汉族人群中具有良好频率分布的亲源特异性甲基化遗传标记印记SNP位点；建立甲基化敏感酶切结合单碱基延伸技术,验证印记SNP等位基因的亲代来源；并用建立的方法对所验证的亲源特异性甲基化遗传标记印记SNP进行法医学个体识别和亲缘鉴定应用学研究。方法：从人类基因组印记基因图谱中初步筛选出候选印记基因,在Hapmap数据库中获取其单核苷酸多态性（SNP）相关数据,所选印记基因的SNP经Haploview分析软件分析后,筛选出符合实验要求的11个SNP位点（IGF2AS rs1003483、SNURF rs220028、 rs4906939、DLGAP2rs6558478、PKP3rs11748、CHMP2A rs873104、COL9A3rs760087、 SIM2rs737380、TP73rs3765730、SOX8rs9931183、APBA1rs11139063）;由于优化扩增条件的限制,进行了8个SNP （IGF2AS rs10... 

【文章来源】：山西医科大学山西省

【文章页数】：55 页

【学位级别】：硕士

【部分图文】：

Snapshot微测序基本步骤

A :绿 色 ； G: 蓝色 ； C: 黑 色 ； T :红 色 图 1- 3 单 位点 Sn a p sh ot 分型 结果 图 2 .3 8 个 SN P s (I G F2 A S r s 1 0 0 34 8 3 、SN U R F rs 2 2 0 02 8 、r s 4 9 0 69 3 9 D LG A P2 rs 6 5 5 8 4 78 rs 11 74 8、 CH MP 2 A rs 8 7 3 10 4 、C O L9 A 3 rs 7 6 0 0 8 7、 SI M 2 rs 7 3 7 38 0) 复 合 Sn pa s h ot 果图 1 -4

A :绿 色 ； G: 蓝色 ； C: 黑 色 ； T :红 色 图 1- 3 单 位点 Sn a p sh ot 分型 结果 图 2 .3 8 个 SN P s (I G F2 A S r s 1 0 0 34 8 3 、SN U R F rs 2 2 0 02 8 、r s 4 9 0 69 3 9 D LG A P2 rs 6 5 5 8 4 78 、PK Prs 11 74 8、 CH MP 2 A rs 8 7 3 10 4 、C O L9 A 3 rs 7 6 0 0 8 7、 SI M 2 rs 7 3 7 38 0) 复 合 Sn pa s h ot 分型 结果图 1 -4

【参考文献】：
期刊论文
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[2]人体脱落上皮细胞DNA检验2例[J]. 郭燕霞,陈松,刘开会,郭红玲,郝金萍,彭建雄,路志勇.  刑事技术. 2007(01)
[3]全基因组扩增法应用于低拷贝数DNA检测[J]. 周怀谷,张晨.  法医学杂志. 2006(01)
[4]DNA甲基化标记法医学应用探讨[J]. 赵贵森,杨庆恩.  法医学杂志. 2005(01)
[5]消化后片段长度差异等位基因特异性PCR技术——印记SNP rs220028多态性和甲基化模式研究[J]. 赵贵森,黄代新,冯文芳,杨庆恩.  中华医学遗传学杂志. 2005(01)
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[7]一种快速、高通量的基因分型新方法[J]. 吴刚,李梅.  临床检验杂志. 2003(06)



本文编号：3419092