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利用Y-STR单倍型推断样品间亲缘关系

发布时间:2021-10-18 18:59
  目的通过对Y-STR单倍型的分析,推测不同样品间的亲缘关系远近。方法对郑州地区某单一姓氏男性182人取外周血,以Yfiler Plus试剂盒进行Y-STR基因座分型;以Arlequin分析单倍型多态性;以Network软件构建各样品间关系网络;以SPSS软件构建各样品间远近关系树状结构。结果单倍型分析发现,182例样品中共存在164种单倍型;Network软件分析显示,大部分样品间的网络距离呈均匀分布,但少部分样品距离较近;SPSS软件聚类分析发现,164个单倍型呈现出多个层级,大部分在短期内就发生了第一次聚集,再往根部又发生7次较大的汇集,最终全部汇集到两个分支上。结论即使在同姓男子中,Yfiler Plus试剂盒所包含的Y-STR基因座仍然有较高的基因差异度;以Y-STR检测结果进行Network分析及进化树分析,有助于揭示群体内个体间近代亲缘关系和遗传层级关系。该思路有望在法医学法医个体识别、亲权鉴定及族群迁徙等研究中发挥作用。 

【文章来源】:中国法医学杂志. 2020,35(03)CSCD

【文章页数】:4 页

【文章目录】:
1材料和方法
    1.1实验样品
    1.2方法
        1.2.1 Y-STR基因座检测
        1.2.2 Arlequin分析单倍型
        1.2.3 Network分析构建亲缘关系图
        1.2.4 SPSS进行聚类分析构建进化树
        1.2.5取样结果与软件分析结果的对照
2结果与讨论


【参考文献】:
期刊论文
[1]应用Y-STR遗传标记进行家系排查侦破案件1例[J]. 徐志成,裘羽,杨晓波,陈新星.  中国法医学杂志. 2018(06)
[2]湖南浏阳客家人25个Y-STR基因座遗传多态性[J]. 赵霖,付永,李花,何海军,邵俊,汪林木,黄笃厚.  中国法医学杂志. 2017(04)
[3]郑州市Y-STR DNA数据库建设及应用的调查研究[J]. 陈振乾,黄书琴.  中国人民公安大学学报(自然科学版). 2017(01)
[4]河南汉族人群27个Y-STR基因座遗传多态性[J]. 刘亚举,张俊涛,史绍杏,刘海,郭利红,张毅,李效阳.  刑事技术. 2014(04)
[5]人类Y染色体36个新STR位点的筛选与鉴定[J]. 彭冬铂,姜正文,孙斯平,李才华,卢大儒.  遗传. 2012(11)
[6]云南汉族家系Y-STR基因座突变率研究[J]. 李貌,程宝文,杨忠保,杨彦梅,刘浩东,何玮,翟滇,曾发明.  中国法医学杂志. 2009(02)
[7]聚类分析和主成分分析方法在人类学研究中价值的判定[J]. 吴秀杰,张全超,李海军.  人类学学报. 2007(04)



本文编号:3443319

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