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基于香农熵原理为目标人群筛选合适的法医学Y-STR基因座组合的初步研究

发布时间:2021-10-29 05:59
  研究背景及目的Y染色体短串联重复(short tandem repeat,STR)标记作为法医DNA检验中广泛使用的常染色体STR的有效补充方法之一,经过近三十年的发展,Y-STR检验已经发展成为一种非常成熟的,刑事案件侦查中不可或缺的辅助技术手段。近年来,联合应用Y-STR标记和毛细管电泳检测平台,在一系列恶性案件和陈年积案的侦破中取得了十分显著的成效。因此,Y-STR标记越来越受到法医科研人员和一线办案民警的关注和重视。2017年,Y-STR单倍型数据库(Y库)建设在全国各地纷纷启动。目前,我国已拥有全世界规模最大的Y库。我国的Y库建设和应用工作可谓如火如荼,Y-STR在辅助刑事案件侦查等方面也有着极为广泛的应用和独特的应用价值。然而,我们对Y-STR标记进行基础研究的速度和深度却远不及我国Y库建设的速度和应用的广度。因此,无论是在Y库建设还是在实际应用过程中一系列问题也接踵而至。一方面,在决定选择用什么样的Y-STR基因座和多少个基因座进行案件检验和Y库建设时,可能存在一定的依袭性和盲目性。几乎从来没有以科学的基础研究数据为依据,也没有考虑基因座间等位基因的关联关系以及不同群体间... 

【文章来源】:南方医科大学广东省

【文章页数】:147 页

【学位级别】:博士

【部分图文】:

基于香农熵原理为目标人群筛选合适的法医学Y-STR基因座组合的初步研究


图1-5?Y-STR?34plex反)、V:休积变化??Fig.?1-5?Reaction?volumes?variation?of?the?Y-STR?34plex??2.3.1.2.?Reac?

循环次数,退火温度,峰高,荧光


?Irk?S?fli?U??m?n?i??.n??m?m??mc??i.*???i?a??<w?h???-f ̄— ̄'?J? ̄—T????M?*?'?1?**?^?U?"?U?^??1*m*??B ̄?Ivk?S?^li?In??M?N?t|??IN?Jt??JJO?a〇?MO????4H????0????:r?i?:?,?..?i?..?,!.?.?—n??@?1?1???i??图1-9?Y-STR?34plex退火温度变化(以63?°C为例)??F:ig.?1-9?Annealing?temperature?variations?of?the?Y-STR?34plex?(63?°C)??2.3.丨.6.?PCR循环次数变化??在以Control?DNA?9948为模板DNA,总样本量为1.0?ng的PCR循环次数??变化实验中,无论循环次数设置为27、28、29、30还是31,所有实验都能获??得完整的基因分型结果。可读范围内无可见非特异峰,基因座平均峰高随着循??环次数的增加而逐渐升高,峰高范围约3000-20000?RFUs。相同荧光标记纟II内??和不同荧光标记组间等位鋪冈的平均_高无明显变化(阁M0)。??31??

样本,分型,男性


???低时,常染色体STR检验很难获得理想的混合DNA分型结果。甚至会因受害??人DNA浓度过高而导致施害人基因分型彻底失败。此时需要通过Y-STR检验,??获取男性Y-STR分型,并以此为线索追查、确定或排除犯罪嫌疑人。在用50?ng??9947A?分别与?500、250、125、62.5?和?31.25?pg?Control?DNA?9948?混合而成的??男女混合样本模拟实验中,Y-STR?34plex能够从500-125?pg模板DNA的所有??实验中获得完整DNA分型(图1-14)。但是,当模板浓度减少到62.5和31.25?pg??时,等位基因的检出率分别为95%和57%。这一结果与Y-STR?34plex灵敏度实??验中的结果类似(图1-12)。实验结果表明,只要男性样本DNA的总量达到??Y-STR?34plex灵敏度下限以上,即使女性DNA与男性DNA的比例达到400:1,??似乎也不会对Y-STR?34plex检测能力产生明显地影响。??51〇〇〇?50000?pg?of?Femal?DNA?Input?Permanently?12〇??D)?CS*??^?50500?1?〇〇?100?-???100-—?—?—*.?100??^?■■■?'95、?T3??!50000?III?■、、、'、■'■??49600?I?I?I?■、画?6。???|?■?|?|?■?|?f??48500?■?■?■?■?■??l?l?|?|?|?1??100:1?200:1?400:1?800:1?1600:1??Female?DNA?Input?Male?DNA?Input?Perce

【参考文献】:
期刊论文
[1]Y chromosomal clue successfully facilitated the arrest of Baiyin serial killer[J]. Hongbing Yao,Shaoqing Wen,Xinzhu Tong,Boyan Zhou,Panxin Du,Meisen Shi,Li Jin,Hui Li.  Science Bulletin. 2016(22)
[2]中国Y-STR数据库建设相关问题探讨[J]. 葛建业,严江伟,谢群,孙宏钰,周怀谷,李斌.  法医学杂志. 2013(03)



本文编号:3464101

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