太赫兹辐射暴露引起小鼠视网膜基因表达改变

发布时间：2021-12-02 00:55

　　目的探讨太赫兹（terahertz,THz）辐射暴露后视网膜组织基因表达变化的整体情况,揭示THz暴露所致视觉系统损伤效应的关键信号通路及关键基因。方法通过平均功率密度80 mW/cm²的THz辐射暴露小鼠眼部,暴露时长2 min,取暴露后视网膜组织,采用RNA-seq测序分析基因表达变化的整体差异,采用聚类分析及富集分析揭示差异基因富集的信号通路和所揭示的生物功能;并进一步通过Real-time PCR揭示THz辐射暴露对视网膜损伤关键基因表达影响的时效关系。结果以P<0.05、|logFC|≥1为筛选条件对差异表达基因进行筛选,共筛选出上调基因625个,下调基因9个。GO分析差异基因主要分布于细胞外成分,分子功能主要为影响蛋白结合等,生物功能主要为细胞应激反应与细胞增殖等。KEGG信号通路分析结果显示,差异基因主要影响PPAR信号通路、癌症相关信号通路、钙离子信号通路及PI3K-Akt信号通路。通过Real-time PCR对视网膜损伤相关基因进行验证发现,在暴露后5 min及24 h,THz辐射暴露均上调Krt12、Cfd、Wnt3a及Adipoq表达... 

【文章来源】：第三军医大学学报. 2020,42(23)北大核心CSCD

【文章页数】：8 页

【部分图文】：

太赫兹辐射暴露后眼部升温曲线

为深入分析太赫兹辐射暴露所致差异基因主要影响细胞哪些功能,将全部差异基因进行了GO富集分析。GO富集分析结果按照分子功能、生物过程和细胞组分进行GO 分类,图3所示为每个GO分类中富集最显著的前10个GO子集条目。从该结果可以看出,细胞组分分类中主要是细胞外成分(细胞外区域部分、细胞外区域),表明强太赫兹暴露所影响的基因主要是编码细胞外成分的蛋白;分子功能分类中变化最为显著的子集主要包括蛋白结合(同型蛋白结合、蛋白结合)、钙离子通道蛋白结合以及蛋白二聚体活性等;生物过程分类中变化最为显著的为发育相关子集(组织发育、发育过程、系统发育)、与外界有害因素刺激反应相关子集(细胞外刺激反应、应激系统)、细胞增殖、细胞黏附等(图3)。图3 太赫兹辐射暴露后差异基因GO分析

太赫兹辐射暴露后差异基因GO分析


本文编号：3527397