旋转细胞培养系统模拟微重力环境对小鼠成纤维细胞lncRNA表达的影响

发布时间：2018-07-22 15:05

【摘要】：目的研究旋转细胞培养系统(RCCS)模拟微重力环境对小鼠成纤维细胞株L929 lncRNA表达的影响。方法体外培养L929细胞,随机分为模拟微重力组(SMG组)和正常重力组(NG组),每组3个样本。SMG组回转器轴心与地面平行旋转,NG组回转器轴心与地面垂直旋转,两组转速一致。RCCS培养7d,收集样本,提取样本总RNA,进行荧光标记和芯片杂交。利用Agilent Mouse lncRNA芯片分别检测SMG组和NG组L929细胞的lncRNA和mRNA表达,筛选差异表达显著的lncRNA,RT-q PCR验证芯片结果;利用GO和Pathway分析差异表达lncRNA的功能分布,结合mRNA差异表达谱,进行lncRNA-mRNA联合分析。结果 lncRNA芯片检测分析发现,RCCS模拟微重力环境下小鼠成纤维细胞L929共有238条差异表达的lncRNA,其中134条表达上调,104条表达下调;差异表达的mRNA共有237条,其中53条表达上调,184条表达下调。获取差异表达lncRNA的聚类分析图,对差异表达显著的4条lncRNA芯片结果进行RT-q PCR验证,结果相吻合。GO分析结果显示差异表达的lncRNA与巨噬细胞分化、伤口愈合的负性调节等生物学过程相关,Pathway分析结果显示差异表达的lncRNA与系统性红斑狼疮、TGF-β等信号通路相关。同时成功构建了lncRNA-mRNA-TF可视化网络图。结论 RCCS模拟微重力环境显著影响L929细胞的lncRNA及mRNA表达谱,基于芯片技术的lncRNA靶基因预测和功能富集分析可为失重应激损伤机制探讨和修复措施建立提供理论依据。
[Abstract]:Objective to study the effect of rotating cell culture system (RCCS) on the expression of L929 lncRNA in mouse fibroblasts. Methods L929 cells were cultured in vitro and randomly divided into simulated microgravity group (SMG group) and normal gravity group (NG group). The two groups were cultured at the same speed for 7 days. The samples were collected, the total RNAs were extracted, and the fluorescence labeling and chip hybridization were performed. Agilent mouse lncRNA chip was used to detect the expression of L929 cells in SMG group and NG group, to screen the differentially expressed L929 cells to verify the microarray results, to analyze the functional distribution of differentially expressed L929 cells by go and Pathway, and to combine the differential expression profiles of L929 cells. Combined analysis of lncRNA-mRNA was performed. Results L929 mouse fibroblasts under simulated microgravity environment had 238 differentially expressed lncRNAs, 134 of which up-regulated and 104 down-regulated, and 237 differentially expressed mRNA. Among them, 53 were up-regulated and 184 were down-regulated. Cluster analysis of differentially expressed lncRNA was obtained, and the results of four differentially expressed lncRNA microarrays were verified by RT-q PCR. The results of .go analysis showed that the differentially expressed lncRNA differentiated from macrophages. The differential expression of lncRNA was associated with signal pathways such as TGF- 尾 in systemic lupus erythematosus. At the same time, the visual network diagram of lncRNA-mRNA-TF was constructed successfully. Conclusion RCCS simulated microgravity environment significantly affects L929 cell L929 mRNA expression profile. The prediction of L929 L929 cell line target gene and functional enrichment analysis based on microarray technology can provide a theoretical basis for the study of weightlessness stress injury mechanism and the establishment of repair measures.
【作者单位】： 安徽医科大学解放军306医院临床学院普通外科;解放军306医院普通外科;解放军306医院特种医学实验研究中心;解放军306医院病理科;
【基金】：全军医学科研十二五重点项目(BWS11J051) 全军试验技术研究计划重点项目(SYFD1500128)~~
【分类号】：R852.22

【相似文献】

相关期刊论文 前10条

1 贾秀志;张凤蕴;张华;任欢;郭蓉娇;孙野青;;模拟微重力对人脐静脉内皮细胞血管生成素产生的影响[J];国际免疫学杂志;2007年06期

2 康春燕;刘长庭;邹琳;袁明;章烨;李天志;王洋;王德龙;刘岩;;模拟微重力对人肺微血管内皮细胞凋亡的影响[J];解放军医学杂志;2010年11期

3 康春燕;袁明;邹琳;章烨;李天志;王俊锋;刘长庭;;模拟微重力对肺微血管内皮细胞窖蛋白-1和内皮型一氧化氮合酶表达的影响[J];解放军医学杂志;2010年11期

4 张翠;李亮;王金福;;空间微重力环境及其地基模拟微重力条件对干细胞影响的研究[J];中华细胞与干细胞杂志(电子版);2013年04期

5 孙磊,向求鲁,汪德生,任维;微重力与模拟微重力条件下的肺循环变化[J];航天医学与医学工程;2000年04期

6 赵琦,李军 ,刘敏;模拟微重力对植物幼苗光合特性的影响(英文)[J];航天医学与医学工程;2002年02期

7 姚宇华,严洪,熊江辉,李莹辉,马永生;模拟微重力条件下心肌细胞骨架的灰度统计特征分析[J];中国生物医学工程学报;2005年03期

8 戢玉环;李呼伦;王丹丹;孙博;穆莉莉;吕桂香;金连弘;王菁华;;模拟微重力对神经细胞形态及其生长的影响[J];航天医学与医学工程;2007年05期

9 周艺;朱宝安;郭爱娟;谭信;;模拟微重力对大鼠睾丸中睾酮合成相关基因表达的影响[J];航天医学与医学工程;2008年06期

10 张录卫;刘阳;张红;王振华;武振华;赵卫平;;模拟微重力条件下C离子辐射对小鼠生殖器官的影响[J];原子核物理评论;2011年03期

相关会议论文 前10条

1 郑红霞;田维明;魏力军;岳磊;李钰;;模拟微重力效应对小鼠成纤维细胞和大鼠嗜铬瘤细胞形态和生物学特征的影响[A];中国空间科学学会第七次学术年会会议手册及文集[C];2009年

2 陈海龙;曲丽娜;李莹辉;;模拟微重力下黄酮类化合物对神经细胞的保护作用[A];中国空间科学学会第七次学术年会会议手册及文集[C];2009年

3 刘桂兰;刘宁;阮继生;黄英;;模拟微重力对链霉菌生长和代谢的影响[A];中国空间科学学会第七次学术年会会议手册及文集[C];2009年

4 杭晓明;刘聪;马雯雯;孙野青;;模拟微重力对斑马鱼胚胎骨形成影响的分析[A];“基因、进化与生理功能多样性”海内外学术研讨会暨中国生理学会第七届比较生理学学术会议论文摘要[C];2009年

5 于建茹;谭映军;聂捷琳;;双向多样本模拟微重力效应实验平台的研制[A];第二十三届中国（天津）2009IT、网络、信息技术、电子、仪器仪表创新学术会议论文集[C];2009年

6 杨芬;李莹辉;聂捷琳;毕蕾;黄增明;刘淑芳;熊江辉;;模拟微重力条件下新生大鼠心肌细胞三维培养体系的构建[A];全面建设小康社会：中国科技工作者的历史责任——中国科协2003年学术年会论文集（上）[C];2003年

7 宫喜魁;赵琦;;模拟微重力条件下拟南芥基因表达变化的研究[A];2011年空间生命与生命起源暨航天医学工程学术研讨会论文集[C];2011年

8 刘桂兰;刘宁;阮继生;黄英;;微重力对链霉菌的生物学效应初探[A];2008年中国微生物学会学术年会论文摘要集[C];2008年

9 刘竞争;王前;郑磊;;模拟微重力影响CD34+造血细胞转录因子GATA-1mRNA表达的实验研究[A];2008年全国生物流变学与生物力学学术会议论文摘要集[C];2008年

10 张宇;桑晨;赵子彦;庄逢源;;模拟微重力对人脐静脉内皮细胞ICAM-1及VCAM-1的影响[A];中国空间科学学会第七次学术年会会议手册及文集[C];2009年

相关博士学位论文 前2条

1 王海立;模拟微重力环境中肺炎克雷伯菌重要生理表型变化及其潜在机制研究[D];中国人民解放军军事医学科学院;2016年

2 康春燕;模拟微重力下人肺微血管内皮细胞凋亡信号通路及药物干预[D];中国人民解放军军医进修学院;2011年

相关硕士学位论文 前10条

1 张敏;模拟微重力恢复培养对HUVEC-C细胞增殖抑制的研究[D];大连海事大学;2015年

2 吴彬;模拟微重力对K562细胞红系分化及细胞骨架的影响研究[D];南方医科大学;2015年

3 曾凡;模拟微重力对哺乳动物不同脑区神经组织细胞的影响研究[D];北京理工大学;2016年

4 许崇玉;模拟微重力对猕猴肺组织结构及基质金属蛋白酶表达的影响[D];安徽医科大学;2016年

5 田西朋;RCCS模拟微重力对小鼠肝Kupffer细胞影响的实验研究[D];安徽医科大学;2016年

6 曲航;黑木耳肽钙螯合物对模拟微重力诱导骨流失防护作用研究[D];哈尔滨工业大学;2016年

7 马雯雯;模拟微重力下脊椎动物胚胎发育研究模型建立[D];大连海事大学;2010年

8 毛新建;模拟微重力对骨髓间充质干细胞增殖和迁移的影响及相关分子机理研究[D];重庆大学;2014年

9 谭雄进;模拟微重力对大鼠负重骨骨代谢及骨折愈合影响的实验研究[D];第一军医大学;2002年

10 王香寒;模拟微重力对人脑神经组织形态学影响的研究[D];北京理工大学;2015年

，

本文编号：2137851