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计算化学方法在基于受体结构的药物分子设计中的基础理论及应用

发布时间:2017-05-24 06:03

  本文关键词:计算化学方法在基于受体结构的药物分子设计中的基础理论及应用,由笔耕文化传播整理发布。


【摘要】:近年来生物学领域的研究进展极大地加深了对疾病密切相关的靶标分子的结构和功能的认识。然而,如何有效地利用生物大分子的结构信息,进而合理地设计出具有特异性结合活性的小分子药物,还需要进一步开发精确计算受体配体结合自由能的方法。近年来计算能力迅猛增长及研究大分子体系的理论和算法日趋成熟,基于物理学原理的计算化学方法在药物分子设计中的重要作用日益凸显。本文就计算化学在基于受体结构的药物分子设计中的方法及典型应用实例进行了系统的综述,包括小分子结合位点的成药性评估、化合物数据库的虚拟筛选、先导化合物的结构优化等,同时对目前的应用方法存在的主要问题进行了探讨,提出了切实可行的处理策略。
【作者单位】: 北京生命科学研究所;
【关键词】基于受体结构的药物分子设计 计算化学 分子力学 分子动力学 结合自由能 成药性 分子对接
【基金】:国家重点基础研究发展计划(973计划)资助项目(2011CB812402)
【分类号】:R917
【正文快照】: 众所周知,化学小分子药物是通过与体内的生物大分子靶点结合,进而影响其生物功能来发挥药效[1]。药物分子的几何形状和药效基团配置与其受体蛋白上的结合位点的空间形状和功能基团分布是互补的,这种互补性的好坏决定了受体和药物分子的相互识别和相互结合的强弱程度。随着人

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