模拟微重力环境对牙龈卟啉单胞菌全基因表达影响研究

发布时间：2017-08-30 08:11

  本文关键词：模拟微重力环境对牙龈卟啉单胞菌全基因表达影响研究

  更多相关文章： 牙龈卟啉单胞菌 模拟微重力 转录组测序

【摘要】：目的：本课题通过观察牙周致病菌牙龈卟啉单胞菌ATCC33277在模拟微重力环境下细菌生长和全基因表达,研究相关差异基因在牙龈卟啉单胞菌模拟微重力环境中参与应答、代谢过程的变化,旨在揭示模拟微重力环境对牙龈卟啉单胞菌增殖、全基因表达的影响,为指导和维护航天员的口腔健康提供实验依据。材料和方法：本研究使用美国NASA研发的旋转细胞培养系统RCCS-4地面模拟系统模拟微重力环境以牙龈卟啉单胞菌.ATCC33277为研究对象,设为实验组(模拟微重力)和对照组,分别培养、记录生长曲线,利用高通量转录组测序的方法根据有生物学重复实验标准设定padj0.05为阈值筛选差异表达的基因,分析差异基因聚类和GO、KEGG富集功能集团。结果：1.模拟系统模拟微重力环境下牙龈卟啉单胞菌生长曲线,静止期和平台期实验组和对照组变化无统计学意义(P0.05),对数生长期两组差异有统计学意义(P0.05),实验组较对照组细菌增殖加快。2.转录组测序发现,实验组71个基因差异表达,12个上调的基因包括参与编码血细胞凝集素HagA的基因,编码结合转座子TraG的基因等。59个下调的基因有包括编码细菌鞭毛fimA、fimC、fimD、fimE、mfal的基因等。3.通过对差异基因的富集和GO、KEEG聚类分析发现在模拟微重力环境下,牙龈卟啉单胞菌通过调整DNA复制、氧化物/超氧化物代谢活性、宿主间和细胞间的信号传播和运动、ATP酶跨膜转运活动。结论：1.构建了模拟微重力环境下牙龈卟啉单胞菌的培养模型2.模拟微重力环境对牙龈卟啉单胞菌全基因组表达的影响为双向调节基因差异表达多与牙龈卟啉单胞菌粘附和侵入牙龈上皮以及生物膜形成相关；3.根据本实验基因检测结果初步推断,模拟微重力环境下牙龈卟啉单胞菌的定植、生物膜形成和氧化应激等能力减弱,人侵牙龈上皮的能力、毒力因子转移和环境响应等能力增强。
【关键词】：牙龈卟啉单胞菌 模拟微重力 转录组测序
【学位授予单位】：中国人民解放军医学院
【学位级别】：博士
【学位授予年份】：2016
【分类号】：R852.22
【目录】：

• 中文摘要5-7
• 英文摘要7-9
• 前言9-11
• 第一部分：构建模拟微重力环境牙龈卟啉单胞菌培养模型11-19
• 1.1 实验材料11-12
• 1.2 方法12-13
• 1.3 结果13-15
• 1.4 讨论15-19
• 第二部分：模拟微重力环境牙龈卟啉单胞菌全基因表达的初步研究19-66
• 2.1 实验材料19-20
• 2.2 方法20-26
• 2.3 结果26-60
• 2.4 讨论60-66
• 全文总结66-67
• 参考文献67-77
• 文献综述77-86
• 参考文献83-86
• 附录86-88
• 个人简历86
• 攻读学位期间发表文章情况86-88
• 致谢88

【参考文献】

中国期刊全文数据库 前1条

1 祝昊丹;顾宏伟;陆承平;;体内表达新基因trag在猪链球菌的分布及其免疫反应性分析[J];微生物学报;2008年12期

，

本文编号：758174