常见天然产物以大麻素受体CB2为靶点的同源建模及其分子对接研究
发布时间:2020-04-16 10:35
【摘要】:背景计算机辅助药物设计(Computer Aided Drug Design,CADD)日益成为现代药物研发过程中重要的工具,它以低成本、高效率及目标集中的巨大优势在国内外的药物设计研究中得到了广泛的应用,尤其在先导化合物的发现和优化过程中发挥着越来越重要的作用。大麻素受体是非常重要的药物靶点,目前研究得知,大麻素受体存在两种受体亚型CB1和CB2,以CB1受体为作用靶点的药物虽然在临床应用上有着不错的镇痛效果,但却容易成瘾,产生一系列中枢神经性毒副作用;而以CB2受体为靶点的激动剂不仅具有良好的镇痛效果,而且不会产生依赖、成瘾等中枢神经性毒副作用。因此,研究以CB2受体为作用靶点的药物具有更好的临床应用前景。目的构建CB2受体蛋白晶体结构,通过分子对接方法筛选出具有激动CB2受体活性的化合物,在此基础上,进行生物活性的实际测试,为新型CB2受体激动剂类药物的研发提供帮助。方法1根据已知的CB1受体蛋白晶体结构,通过同源建模的方式构建出CB2受体的蛋白晶体结构;2以常见的1000个中药小分子库为基础,采用分子对接虚拟筛选的方式,从中筛选出具有大麻素受体CB2激动作用的小分子化合物;3通过实验室测试所筛选出的小分子化合物对HEK 293细胞cAMP生成的抑制率来检验其药理活性。结果与结论根据分子对接结果,筛选出了6个可能具有CB2受体激动活性的化合物,实验室测试结果显示,木通苯乙醇苷B(CalceolariosideB)和西伯利亚远志糖A6(SibiricoseA6)具有较高的荧光抑制率,说明这两种化合物对CB2受体有激动活性。
【图文】:
Fig 8 同源建模的流程图概况种亚型 CB1 和 CB2 都属于 G 蛋白膜蛋白,直接得到其蛋白晶体的 X 到 CB2 受体三维结构的实验数据。涂白偶联受体,以牛视紫红质的晶体结三维结构进行了模拟,并采用分子动基础上,分析了活性位点的组成和结对接,明确了 CB1 受体与利莫那班结那班与 CB1 受体残基 Lys192 形成氢键作用基础。邝光林在其硕士论文中研药物设计,利用 CADD 的相关技术对大[37]
Fig 13 大麻素受体 CB2 蛋白晶体 3D 结构模型图大麻素受体 CB2 的蛋白晶体结构的检验模型提交 SAVES 服务器(Structural Analysisand Verif蛋白模型进行检验,得到 RamachandranPlot 图和 E5,结果表明,RamachandranPlot 中 90.51%氨基酸所在合要求,,蛋白晶体结构整体打分为 94.545,说明构建靠,可用于后续的分子对接研究。
【学位授予单位】:新乡医学院
【学位级别】:硕士
【学位授予年份】:2017
【分类号】:R285
本文编号:2629686
【图文】:
Fig 8 同源建模的流程图概况种亚型 CB1 和 CB2 都属于 G 蛋白膜蛋白,直接得到其蛋白晶体的 X 到 CB2 受体三维结构的实验数据。涂白偶联受体,以牛视紫红质的晶体结三维结构进行了模拟,并采用分子动基础上,分析了活性位点的组成和结对接,明确了 CB1 受体与利莫那班结那班与 CB1 受体残基 Lys192 形成氢键作用基础。邝光林在其硕士论文中研药物设计,利用 CADD 的相关技术对大[37]
Fig 13 大麻素受体 CB2 蛋白晶体 3D 结构模型图大麻素受体 CB2 的蛋白晶体结构的检验模型提交 SAVES 服务器(Structural Analysisand Verif蛋白模型进行检验,得到 RamachandranPlot 图和 E5,结果表明,RamachandranPlot 中 90.51%氨基酸所在合要求,,蛋白晶体结构整体打分为 94.545,说明构建靠,可用于后续的分子对接研究。
【学位授予单位】:新乡医学院
【学位级别】:硕士
【学位授予年份】:2017
【分类号】:R285
【参考文献】
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1 郭薇薇;姚磊;熊伟;;大麻镇痛机制[J];中国疼痛医学杂志;2015年08期
2 涂国刚;李少华;;大麻素受体CB1三维结构的同源模建及其对接研究[J];化学学报;2011年08期
3 李洪林,沈建华,罗小民,沈旭,朱维良,王希诚,陈凯先,蒋华良;虚拟筛选与新药发现[J];生命科学;2005年02期
4 侯廷军,徐筱杰;遗传算法在计算机辅助药物分子设计中的应用[J];化学进展;2004年01期
5 杨永红;大麻属植物分类研究史[J];中国麻业;2003年01期
6 于德泉;展望从天然产物创新药物研究[J];中国医学科学院学报;2002年04期
本文编号:2629686
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