溃结口服方治疗湿热内蕴型溃疡性结肠炎的药效及机制研究
【图文】:
4 MOL000006 luteolin 36.16 0.25 MOL000098 quercetin 46.43 0.21.2 虚拟预测溃结口服方中的潜在的药效分子靶标,构建“C-T”network运用药效团模型,基于支持向量机(SVM)算法和随机森林(RF)算法计算出各分跟其相对应的靶点间的相互作用强度,以 SVM≥0.8,RF≥0.7 为作筛选条件,虚拟测丁氏溃结口服方中的各种活性成分的潜在作用靶点。在筛选的 175 种活性成分中有种成分没有找到相应的靶点;其余成分都通过有效方法预测出了各自的潜在作用靶尽管组方中药各自具有不同的靶点,,但其中有很多靶点是多种组方中药所共有的,这在一定程度上提示了丁氏溃结口服方中各中药之间的协同整合效应。进一步构建成靶点相互作用网络,即“C-T” network,课题组及本人经过初步筛选,结果如下图“C-T” network(图 2-1)。其中成分的 degrees 大于平均值,提示了组方中药中大数成分可以通过“多靶点”的作用模式来实现复方整合作用的最终效应。
Cytoscape 软件的插件 Bisogenet,并选择 InAct(www.ebi.ac.uk/inotein Reference Database(http://www.hprd.org/)、Molecular ine (http://mint.bio.uniroma2.it/mint/download.do)等 6 个 PPI结口服方的潜在作用靶点和已知的 UC 相关靶点分别做 PPI,构建相互作用网络中“degree”值大于平均值的节点定义为有显著性意义的靶ytoscape 软件的插件 CytoNAC,计算显著性作用靶点相互作用网络每entrality (DC)、Betweenness centrality (BC)、Closeness centralictor centrality (EC)、Network centrality (NC)、和 Local avertivity (LAC)六大拓扑参数,从而分析其在相互作用网络中的拓扑重扑参数值大于2倍平均值的靶点作为丁氏溃结口服方治疗UC的潜在IL-17 以及 TNF-α蛋白及相关信号通路密切相关(图 2-2)。
【学位授予单位】:辽宁中医药大学
【学位级别】:硕士
【学位授予年份】:2018
【分类号】:R285.5
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本文编号:2708451
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