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远志HMGR、CHS基因的克隆与表达研究

发布时间:2020-09-15 10:07
   目的:克隆远志3-羟基-3-甲基戊二酸单酰辅酶A还原酶(HMGR)基因与查尔酮合成酶(CHS)基因,分析其基因表达量对药用成分含量的影响,并从酶活性的角度验证HMGR的功能,为远志资源的可持续利用及种质改良提供借鉴。方法:(1)通过RT-PCR与RACE相结合的方法克隆远志HMGR、CHS基因的全长序列,并对其进行生物信息学分析,同时对HMGR、CHS基因编码的蛋白功能与结构进行预测与分析。(2)利用RT-qPCR技术、紫外分光光度法、高效液相色谱法分别测定了远志根、茎、叶不同部位HMGR基因及CHS基因表达量、远志总皂苷及总黄酮含量、细叶远志皂苷及远志口山酮Ⅲ含量,并对基因表达量与药用成分进行相关分析。(3)通过气相色谱质谱联用法对HMGR的功能进行验证。结果:(1)从远志中克隆获得HMGR、CHS基因的全序列,并分别命名为PtHMGR、PtCHS,(GenBank登录号分别为MK424118、MK424117)。PtHMGR cDNA序列为全长2323 bp,包含一个1782 bp的完整开放阅读框,共编码593个氨基酸;预测PtHMGR编码蛋白的理化性质,其分子式为C_(2781)H_(4486)N_(770)O_(853)S_(33),分子量为63414.84 Da,等电点PI为6.09。PtCHS cDNA序列为全长1634 bp,包含一个537 bp的完整开放阅读框,共编码178个氨基酸;预测PtCHS编码蛋白的理化性质,其分子式为C_(895)H_(1420)N_(244)O_(251)S_(12),分子量为19999.33 Da,等电点PI为9.25。(2)远志PtHMGR、PtCHS基因在根、茎、叶不同部位之间差异表达,其中PtHMGR基因在根部表达量最高,叶次之,茎部表达较低;PtCHS基因在茎部表达量最高,叶次之,根部最少。远志根、茎、叶不同部位总皂苷、总黄酮、细叶远志皂苷、远志口山酮Ⅲ的含量也存在差异,其中总皂苷、细叶远志皂苷、远志口山酮Ⅲ在根部含量较高,而总黄酮主要积累于茎部。远志PtHMGR、PtCHS基因表达量与药用成分相关分析显示,总皂苷及细叶远志皂苷含量与PtHMGR基因的表达呈正相关;总黄酮含量与PtCHS基因表达呈正相关,而远志口山酮Ⅲ含量与PtCHS基因表达量呈负相关。(3)HMGR经异丙基硫代半乳糖苷(IPTG)诱导后成功表达,并催化3-羟基-3-甲基戊二酸单酰辅酶A(HMG-CoA)生成甲瓦龙酸内酯。结论:本研究首次从远志中克隆获得HMGR、CHS基因的全序列,并分析了远志PtHMGR、PtCHS基因与药用成分的关联性,结果显示总皂苷及细叶远志皂苷含量与PtHMGR基因的表达量正相关;总黄酮含量与PtCHS基因表量正相关。利用气相色谱质谱联用法对PtHMGR的功能进行验证,结果显示,远志PtHMGR具有HMGR酶的催化功能,可催化3-羟基-3-甲基戊二酸单酰辅酶A(HMG-CoA)生成甲瓦龙酸内酯。因此可通过上调基因的表达来促进远志药效成分的积累,进而提高远志药材的质量。
【学位单位】:宁夏医科大学
【学位级别】:硕士
【学位年份】:2019
【中图分类】:R284.1
【部分图文】:

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28S 和 18S 条带清晰(图1)无明显拖尾现象,说明 RNA 完整性较好[23]。OD260/OD280比值是衡量蛋白质污染程度的指标,RNA 的 OD260/OD280读数一般在 2.0 左右,2.0 是高质量 RNA的标志。通过超微量分光光度计检测远志总 RNA 的 OD260/OD280比值为 1.94,说明 RNA 中蛋白质污染程度较低,纯度较高,因此提取的远志根部总 RNA 可用于后续 cDNA 第一链的合成。图 1 远志总 RNA 电泳图Fig.1 Total RNAelectropherogram of P. tenuifolia3.2 远志 HMGR、CHS 基因核心片段序列的获取将远志总 RNA 反转录为 cDNA,以 cDNA 第一链为模板,分别利用引物HMGR-F1、HMGR-R1 和 CHS-F1、CHS-R1

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2 远志 HMGR(a)、CHS(b)基因核心片段电泳图 (Mhe electropherogram of intermediate fragments of HMGRMGR、CHS 基因 5′RACE 实验得的远志 HMGR、CHS 基因核心片段设计三条特异性1 、 HMGR-GSP2 、 HMGR-GSP3 和 CHS-GSP1 、利用引物HMGR-GSP1和CHS-GSP1将远志总RNA反模板,利用引物HMGR-GSP2、HMGR-GSP3和CHS-GCR 扩增后,得到大小分别约为 500 bp、1000 bp 的两

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MGR(a)、CHS(b)基因 5'RACE 电泳图 (M: electrophoretogram of HMGR and CHS genes (、CHS 基因 5'片段长度分别为 456 bp、942 bCHS 基因 3'RACE 实验CHS 基因核心片段序列结果,设计两条特异和CHS-1、CHS-2。将远志总RNA反转录为3',利用两条引物进行两轮 PCR 扩增后,得到 的条带,如图 4 所示。得到的远志 HMGR、p、464 bp。

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本文编号:2818828

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