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基于网络药理学和分子对接探讨肿节风的活性成分及药效机制

发布时间:2020-10-17 06:35
   目的:运用网络药理学方法预测中药肿节风的药效物质基础与潜在机制。方法:选用TCMSP等数据库搜集肿节风的化学成分,并筛选活性成分;预测活性成分潜在的靶点;应用CTD匹配靶点对应的疾病;采用Cytoscape构建和分析网络;采用STRING进行靶点蛋白质相互作用(PPI)分析;应用GlueGO行基因本体(GO)及京都基因组百科全书(KEGG)通路富集分析;采用iGEMDOCK进行分子对接。结果:筛选出22个肿节风活性成分,可作用于116个靶点治疗18类疾病。淫羊藿素、苯二甲酸等8种活性成分为肿节风的主要药效物质基础;ALB、EGFR、CASP3及MAPK8等为其关键靶点;分子对接验证了大部分关键活性成分能与关键靶点紧密结合;肿瘤、心血管及消化系统疾病是其主要针对的疾病。靶点富集到92个GO条目和43个KEGG通路上,功能涉及激素相关通路、VEGF信号通路和血小板功能等。结论:本研究运用网络药理学方法探究了肿节风的药效物质基础及其多维药理作用机制,为推广其临床应用和进一步的研究提供了思路。
【部分图文】:

分子对接,富集


ALB-beta-sitosterol分子对接

网络图,活性成分,靶点


度值指网络中某一节点与其他节点的连接数目,一个节点的度值越大,其影响力越大,超过网络平均度值的节点有重要地位[6]。图1网络中所有活性成分的平均度值为14.82,超过平均度值的节点共8个,分别是淫羊藿苷、苯二甲酸、金粟兰内酯A、β-谷甾醇、谷甾醇、咖啡酸、金粟兰内酯B及6,7-二甲氧基香豆素,它们是肿节风的药效物质基础,活性成分对应度值见表1。对于靶点而言,超过平均度值2.47的靶点有44个,意味着有44个靶点均有至少3个活性成分与之对应,说明肿节风活性成分间有普遍的协同效应。图2 靶点-疾病(T-D)网络图

网络图,靶点,网络图,疾病


靶点-疾病(T-D)网络图
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本文编号:2844428

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