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基于网络药理学联合GEO芯片探析培土清心方治疗特应性皮炎的分子机制

发布时间:2020-10-23 22:18
   目的 基于网络药理学方法联合GEO芯片差异基因分析,探析培土清心方治疗特应性皮炎的分子机制。方法 检索GEO数据库,获取特应性皮炎的基因芯片,绘制差异基因火山图与热图。运用TCMSP、BATMAN-TCM、Drugbank数据库,获取培土清心方治疗特应性皮炎的有效成分及基因,并利用cytoscape 3.7.2,构建培土清心方-特应性皮炎-分子基因网络,行拓扑网络分析。运用R软件,对基因进行GO功能与KEGG通路富集分析。结果 获得培土清心方治疗特应性皮炎的143个活性成分,治疗特应性皮炎的主要活性成分为槲皮素、豆甾醇、木犀草素。培土清心方对应疾病的核心基因共42个,其中重要候选基因为PPARG等。拓扑网络分析重要候选基因为TP53、NTRK1等。GO分析生物通路共516条,细胞成分8个,分子功能44个,主要涉及response to steroid hormone生物过程,nuclear receptor activity分子功能,condensed chromosome细胞过程。KEGG通路22条,主要涉及AGE-RAGE signaling pathway in diabetic complications。结论 培土清心方治疗特应性皮炎是通过多成分、多基因、多通路,发挥抗炎、调节细胞免疫、抑菌的作用,这将为进一步研究此方作用机制提供参考,也为培土清心方治疗AD的基础、临床研究及新药研制提供一定的理论依据。
【部分图文】:

特应性,皮炎,基因,患者


与特应性皮炎相关的中药活性成分共143个,其中灯芯草活性成分7个,茯苓8个,甘草72个,钩藤27个,连翘9个,山药7个,太子参4个,薏苡仁4个,淡竹叶3个,牡蛎2个。图2 正常组与特应性皮炎患者差异基因火山图

网络图,特应性,皮炎,基因


图1 正常组与特应性皮炎患者差异基因热图培土清心方-特应性皮炎-分子基因网络图中(见图3),大多数药物分子作用于多个疾病基因。对应疾病基因最多的前3个分子分别是MOL000098、MOL000006、MOL000449,其代表的活性分别为槲皮素、豆甾醇和木犀草素。特应性皮炎的基因中,PPARG对应多个药物分子。

网络图,特应性,皮炎,分子


培土清心方-特应性皮炎-分子基因网络图中(见图3),大多数药物分子作用于多个疾病基因。对应疾病基因最多的前3个分子分别是MOL000098、MOL000006、MOL000449,其代表的活性分别为槲皮素、豆甾醇和木犀草素。特应性皮炎的基因中,PPARG对应多个药物分子。2.3 培土清心方治疗特应性皮炎基因的拓扑网络图

本文编号:2853612

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