基于网络药理学探讨朱日亨滴丸治疗大鼠急性心肌缺血再灌注损伤
发布时间：2020-12-07 01:35
目的:基于网络药理学方法探讨朱日亨滴丸体内、体外对大鼠心肌缺血再灌注损伤的干预作用。方法:实验一:基础方（三味檀香散）治疗冠心病的网络药理学研究。通过文献挖掘、多个中药材成分数据库检索收集整理三味檀香散中化学成分并经OB（Oral bioavailability,口服生物利用度）和DL（Drug-likeness,类药性）分析筛选;利用PharmMapper、SWISS、Superpred在线平台预测化合物潜在靶点;OMIM数据库收集冠心病的相关靶标;利用STRING做蛋白互作分析;通过DAVID在线工具对关键靶标做通路富集;应用Cytoscape软件建立该方剂的“药材-化合物-靶标-通路”网络模型,并对网络模型进行拓扑学分析;采用Schrodinger分子对接技术对网络模型分析的部分结果进行验证。实验二:朱日亨滴丸对大鼠心肌缺血再灌注损伤的干预作用及体内实验验证。大鼠随机分为:正常组（Control）、模型组（Model）、广枣组（GZ）、广枣-肉豆蔻药对组（GZ-RDK）、三味檀香散组（SWTX）和朱日亨滴丸组（ZRH）。各给药组连续灌胃给药10天后,除正常组外,其余各组均通过结扎...
【文章来源】：内蒙古医科大学内蒙古自治区
【文章页数】：128 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
三味檀香散网络药理学研究技术路线图
内蒙古医科大学硕士研究生学位论文（2019） 8 Calcium 信号通路 0.0091049129 MAPK 信号通路 0.009695571注：根据 P 值排序。3.3 三味檀香散“化合物-靶标-蛋白互作-通路”网络模型3.3.1 采用 Cytoscape 软件建立三味檀香散“药材-疾病-靶标-通路”网络模型，材、靶标以及通路结果的关联直观地呈现于图 1.2。通过 Network Analyzer 分析三檀香散药物分子与靶蛋白的 D-T 网络特征，如连接度、介度、紧密度，观察化合物靶标的作用情况以及靶标在生物通路中的分布情况，相关靶标的网络拓扑学参数见1.7。网络模型分析发现，高网络度化合物往往有较高的介度，而这些具有较高介度连接度和紧密度的靶标提示可能在生物网络系统中发挥重要作用。
（注： 表示广枣化合物； 表示肉豆蔻化合物； 表示檀香化合物； 表示草药； 表示共靶； 表示化合物靶标）图 1.4 连接度(Degree)分析相关网络模型3.4 化合物与相应靶标蛋白分子对接结果对上述图 1.3（PI3K-Akt- FoxO 信号通路相关网络模型）进行分析，结合表 1.7及表 1.8 网络拓扑学参数，可以发现在 PI3K-Akt 信号通路和 FoxO 信号通路这两条通路中 AKT1、MAPK14、PIK3R1 为关键靶标，与其相对应的化合物分别为广枣中的鞣花酸（gallogen）、槲皮素(quercetin)；肉豆蔻中的肉豆蔻木酚素(macelignan)、甲基丁香酚(methyleugenol)和檀香中的檀醇（santol）。经 RCSB PDB 网站查询并整理出上述关键靶标的 PDB 编码：MAPK14（3hv3）、AKT1（4ejn）、PIK3R1（5t8f）。应用Schrodinger 分子对接技术进行对接，分析它们与周围关键氨基酸的相互作用方式及其在活性位点结合情况见图 1.5-1.9，对接结果显示化合物能量值列于表 1.9。
【参考文献】：
期刊论文
[1]栀子的化学成分、药理作用研究进展及质量标志物预测分析[J]. 史永平,孔浩天,李昊楠,李晓彬,张云,韩利文,田青平,刘可春. 中草药. 2019(02)
[2]缺血再灌注对大鼠心肌损伤及氧化应激的影响[J]. 王雅枫,周璐,雷少青,夏中元. 中华实用诊断与治疗杂志. 2018(12)
[3]基于多波长HPLC-DAD比较栀子不同部位化学成分差异[J]. 肖日传,罗光明,董丽华,朱玉野,朱继孝,张风波,伍珊娜. 中国中药杂志. 2017(23)
[4]新疆阿魏化学成分及药理活性研究进展[J]. 黄雅婷,岳丽君,申翔宇,王坤,刘春兰. 国际药学研究杂志. 2017(06)
[5]PI3K/Akt/FoxO3a/Bim信号通路介导硫化氢后处理对缺氧H9c2心肌细胞的保护作用[J]. 周波,钱坤,胡明珠,季永. 中国药理学通报. 2017(07)
[6]栀子化学成分研究(Ⅵ)[J]. 左月明,严欢,张忠立,徐元利. 中药材. 2017(03)
[7]基于网络药理学分析丹参山楂组分配伍抗动脉粥样硬化的作用机制研究[J]. 张建永,王岚,梁日欣,杨滨. 中国中药杂志. 2016(23)
[8]广枣舒心丸治疗慢性心肌缺血综合征66例临床观察[J]. 布仁吉日嘎拉,乌日嘎,萨仁高娃. 世界最新医学信息文摘. 2016(61)
[9]蒙古族药朱日很滴丸对缺血再灌注损伤及凝血功能的影响[J]. 陆景坤,那生桑,高甜,尚颖,徐彩霞,王跃武,王旭瑞,王义冲. 中国实验方剂学杂志. 2016(10)
[10]PPAR-α通过PI3K/Akt/FoxO1信号通路对心肌细胞肥大的负性调控作用[J]. 王玉琴,王宝霞,郭媛媛,吴扬. 南通大学学报(医学版). 2016(02)
博士论文
[1]基于“广枣—冰片”配伍设计的没食子酸冰片酯体内外代谢研究[D]. 兰薇.西北大学 2013
[2]广枣抗心肌缺血再灌注损伤的物质基础及作用机制研究[D]. 汤喜兰.北京中医药大学 2013
[3]檀香精油成分组成、分布及人工促成心材形成的研究[D]. 刘小金.中国林业科学研究院 2012
[4]檀香叶综合利用物质基础研究[D]. 闫冲.广州中医药大学 2011
[5]蒙药山沉香挥发油成分分析及抗心肌缺血作用研究[D]. 颜彦.华中科技大学 2011
[6]白花油麻藤和香花崖豆藤化学成分及生物活性研究[D]. 巩婷.中国协和医科大学 2010
硕士论文
[1]基层农村心血管病高危人群早期筛查与饮食习惯研究[D]. 毛丛林.山东大学 2018
[2]栀子豉汤神经保护作用及其化学物质基础研究[D]. 果卉.中国人民解放军海军军医大学 2018
[3]广枣核化学成分与广枣质量控制研究[D]. 向萍.内蒙古医科大学 2017
[4]基于“广枣—冰片”配伍的原儿茶酸冰片酯的体内代谢研究[D]. 吴一振.西北大学 2014
[5]PI3K/Akt/FoxO3a信号通路在FGF-2拮抗心肌细胞凋亡中的作用研究[D]. 刘米华.南华大学 2014
[6]檀香挥发油质控及其对PC12细胞氧化损伤的保护作用研究[D]. 李丽月.广州中医药大学 2013
[7]羧甲司坦对慢性气道炎症大鼠肺组织中PI3K/AKT和γ-GCS表达的影响[D]. 李国吾.郑州大学 2012
本文编号：2902378
【文章来源】：内蒙古医科大学内蒙古自治区
【文章页数】：128 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
三味檀香散网络药理学研究技术路线图
内蒙古医科大学硕士研究生学位论文（2019） 8 Calcium 信号通路 0.0091049129 MAPK 信号通路 0.009695571注：根据 P 值排序。3.3 三味檀香散“化合物-靶标-蛋白互作-通路”网络模型3.3.1 采用 Cytoscape 软件建立三味檀香散“药材-疾病-靶标-通路”网络模型，材、靶标以及通路结果的关联直观地呈现于图 1.2。通过 Network Analyzer 分析三檀香散药物分子与靶蛋白的 D-T 网络特征，如连接度、介度、紧密度，观察化合物靶标的作用情况以及靶标在生物通路中的分布情况，相关靶标的网络拓扑学参数见1.7。网络模型分析发现，高网络度化合物往往有较高的介度，而这些具有较高介度连接度和紧密度的靶标提示可能在生物网络系统中发挥重要作用。
（注： 表示广枣化合物； 表示肉豆蔻化合物； 表示檀香化合物； 表示草药； 表示共靶； 表示化合物靶标）图 1.4 连接度(Degree)分析相关网络模型3.4 化合物与相应靶标蛋白分子对接结果对上述图 1.3（PI3K-Akt- FoxO 信号通路相关网络模型）进行分析，结合表 1.7及表 1.8 网络拓扑学参数，可以发现在 PI3K-Akt 信号通路和 FoxO 信号通路这两条通路中 AKT1、MAPK14、PIK3R1 为关键靶标，与其相对应的化合物分别为广枣中的鞣花酸（gallogen）、槲皮素(quercetin)；肉豆蔻中的肉豆蔻木酚素(macelignan)、甲基丁香酚(methyleugenol)和檀香中的檀醇（santol）。经 RCSB PDB 网站查询并整理出上述关键靶标的 PDB 编码：MAPK14（3hv3）、AKT1（4ejn）、PIK3R1（5t8f）。应用Schrodinger 分子对接技术进行对接，分析它们与周围关键氨基酸的相互作用方式及其在活性位点结合情况见图 1.5-1.9，对接结果显示化合物能量值列于表 1.9。
【参考文献】：
期刊论文
[1]栀子的化学成分、药理作用研究进展及质量标志物预测分析[J]. 史永平,孔浩天,李昊楠,李晓彬,张云,韩利文,田青平,刘可春. 中草药. 2019(02)
[2]缺血再灌注对大鼠心肌损伤及氧化应激的影响[J]. 王雅枫,周璐,雷少青,夏中元. 中华实用诊断与治疗杂志. 2018(12)
[3]基于多波长HPLC-DAD比较栀子不同部位化学成分差异[J]. 肖日传,罗光明,董丽华,朱玉野,朱继孝,张风波,伍珊娜. 中国中药杂志. 2017(23)
[4]新疆阿魏化学成分及药理活性研究进展[J]. 黄雅婷,岳丽君,申翔宇,王坤,刘春兰. 国际药学研究杂志. 2017(06)
[5]PI3K/Akt/FoxO3a/Bim信号通路介导硫化氢后处理对缺氧H9c2心肌细胞的保护作用[J]. 周波,钱坤,胡明珠,季永. 中国药理学通报. 2017(07)
[6]栀子化学成分研究(Ⅵ)[J]. 左月明,严欢,张忠立,徐元利. 中药材. 2017(03)
[7]基于网络药理学分析丹参山楂组分配伍抗动脉粥样硬化的作用机制研究[J]. 张建永,王岚,梁日欣,杨滨. 中国中药杂志. 2016(23)
[8]广枣舒心丸治疗慢性心肌缺血综合征66例临床观察[J]. 布仁吉日嘎拉,乌日嘎,萨仁高娃. 世界最新医学信息文摘. 2016(61)
[9]蒙古族药朱日很滴丸对缺血再灌注损伤及凝血功能的影响[J]. 陆景坤,那生桑,高甜,尚颖,徐彩霞,王跃武,王旭瑞,王义冲. 中国实验方剂学杂志. 2016(10)
[10]PPAR-α通过PI3K/Akt/FoxO1信号通路对心肌细胞肥大的负性调控作用[J]. 王玉琴,王宝霞,郭媛媛,吴扬. 南通大学学报(医学版). 2016(02)
博士论文
[1]基于“广枣—冰片”配伍设计的没食子酸冰片酯体内外代谢研究[D]. 兰薇.西北大学 2013
[2]广枣抗心肌缺血再灌注损伤的物质基础及作用机制研究[D]. 汤喜兰.北京中医药大学 2013
[3]檀香精油成分组成、分布及人工促成心材形成的研究[D]. 刘小金.中国林业科学研究院 2012
[4]檀香叶综合利用物质基础研究[D]. 闫冲.广州中医药大学 2011
[5]蒙药山沉香挥发油成分分析及抗心肌缺血作用研究[D]. 颜彦.华中科技大学 2011
[6]白花油麻藤和香花崖豆藤化学成分及生物活性研究[D]. 巩婷.中国协和医科大学 2010
硕士论文
[1]基层农村心血管病高危人群早期筛查与饮食习惯研究[D]. 毛丛林.山东大学 2018
[2]栀子豉汤神经保护作用及其化学物质基础研究[D]. 果卉.中国人民解放军海军军医大学 2018
[3]广枣核化学成分与广枣质量控制研究[D]. 向萍.内蒙古医科大学 2017
[4]基于“广枣—冰片”配伍的原儿茶酸冰片酯的体内代谢研究[D]. 吴一振.西北大学 2014
[5]PI3K/Akt/FoxO3a信号通路在FGF-2拮抗心肌细胞凋亡中的作用研究[D]. 刘米华.南华大学 2014
[6]檀香挥发油质控及其对PC12细胞氧化损伤的保护作用研究[D]. 李丽月.广州中医药大学 2013
[7]羧甲司坦对慢性气道炎症大鼠肺组织中PI3K/AKT和γ-GCS表达的影响[D]. 李国吾.郑州大学 2012
本文编号：2902378
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