与动脉粥样硬化靶点相关的中药化学成分虚拟筛选

发布时间：2020-12-07 05:01

　　西医治疗动脉粥样硬化包括药物治疗、介入治疗以及基因治疗;药物治疗毒副作用大、容易产生耐药性,介入治疗产生血栓及再狭窄等问题,基因治疗尚处于探索阶段。而中药毒副作用小,来源广泛,在临床治疗疾病中发挥着重要的作用,在现代药物研究中受到科研人员极大的关注和重视。因此,从中药中发现和研究治疗动脉粥样硬化的化学成分对于减少药物的毒副作用,扩大药物来源具有积极意义。传统的实验方法筛选药物消耗巨大,因此需要开发新的方法进行药物筛选。随着科学技术的不断发展,新的药物筛选方法应运而生,如虚拟筛选。本文采用两种不同的虚拟筛选策略对中药化学成分进行筛选,获得与动脉粥样硬化靶点相关的中药活性化学成分。方法一采用支持向量机结合分子对接从中药化学成分数据库TCMSP筛选出173个与动脉粥样硬化靶点相关的化学成分;方法二运用药物靶点相互配对关系从上述数据库中筛选出358个中药化学成分。分析两种方法的筛选结果及查阅文献可知:方法1中筛选出的部分化合物与动脉粥样硬化机制相关,如Procyanidin B4与炎症机制相关,Oxypaeniflora与氧化和炎症相关;方法2筛选出的化合物中1,22-docosanediol... 

【文章来源】：广东药科大学广东省

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【学位级别】：硕士

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（a）1dp9靶蛋白处理结构示意图

图 2-1（b）2ow2 靶蛋白处理结构示意图2 分子对接方法评价随着分子对接理论和方法的不断发展，分子对接软件也越来越多，但每种软方法自身也存在不足。根据不同的对接对象，我们需要采用不同的软件和算完成实验。如何确定对接方法适用于所处理的任务，就需要对对接方法的可进行评价。在筛选中药化学成分之前，我们采用以下方法来对对接方法进行评价，如果DB 数据库中获得的靶蛋白复合物中有小分子原配体，我们可以先将小分子蛋白中分离出来，再对接到活性位点，计算原始晶体中原配体小分子与对接分子对接构象的均方根偏差（RMSD），当 RMSD 值小于 2 时，则该对接可靠，可以用于中药化合物小分子的对接筛选；如果原始蛋白晶体中没有小配体，我们可从该靶蛋白的抑制剂与非抑制剂中抽取一部分，计算靶蛋白对剂和非抑制剂的区分能力 P-value 值，当 P-value 值小于或等于 10-20时，则该对接流程可靠[82]。

广东药科大学硕士研究生论文为得到到黄芪甲苷含量最高的提取工艺，按黄芪甲苷总量最大化进行优绘制响应面曲线图（图 4-1）。预测最优条件为 A=12，B=1.53，C=3.00，即加量为 12 倍药材量，煎煮时间为 1.53 h，煎煮次数为 3 次，预测结果为黄芪甲总量 25.16 mg（Solution Desirability 值 1.00）。


本文编号：2902674