基于分子描述符的中草药化合物类药性预测及应用研究
发布时间:2020-12-14 18:54
目前,中草药已经在世界范围内得到了广泛的关注。中草药的治病机制与西药的治病机制在分子水平上比较起来,大多数中草药的治病机制却尚不清晰。如何让中草药与现代医学接轨,中草药的计算机辅助现代化研究就显得尤为重要。虚拟筛选、药效团模型、机器学习等中草药化合物类药性预测方法都是极为重要的计算机辅助中草药现代化研究方法。当下越来越多的中草药化合物被广泛应用为候选类药化合物。制药公司开发药物的一个重要途径就是从中草药中发现具有相关靶点的潜在活性化合物。在众多中草药化合物类药性预测方法中,虚拟筛选技术可靠性强、预测速度快、预测精度好,因此一直处于中草药化合物类药性预测方法中的核心地位。特殊医学用途配方食品采取直接食用或胃肠导管给药的途径对营养缺乏的临床病人进行营养支持,是一种全新的应用于临床患者营养支持的产品。特殊医学用途配方食品由于具备防止患者胃肠功能退化、易于存储运输、价格低廉的优势,逐渐被临床医生和营养师所推崇。但目前市面上的特殊医学用途配方食品成分较为简单,营养素来源单一。论文首先综合研究了以上几种基于生物信息学的类药性预测方法,基于生物信息学的类药性预测方法在对整体数据库的类药性分析和对特定...
【文章来源】:哈尔滨商业大学黑龙江省
【文章页数】:62 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
图2年发布化合物结构与总结构数jft统计图??Fig?2?Statistics?of?compound?structure?and?total?structure?released?in??
对来自化学品目录数据库中的228362个化合物,来自药物数据库中的153365个化??合物和来自中药化合物数据库中的64352个化合物进行基于相对分子质量的分布分析,??得到如图5所示的分布结果。??010?B@*ACD1??S3MDDR1??nOITCMCOI??0.08??¥?0?.06??:L?I?I??0?100?200?300?400?500?600?700??图5相对分子质量分布图??Fig?5?Relative?molecular?mass?distribution?map??上表2和图5中数据表明,Ml与A1数据库中的化合物存在着明显的和对分子质??量差异,Ml数据库中化合物的平均分子质量力410,而A1数据库屮化合物的平均分子??质量为275。M1数据库中化合物平均相对分子质量较之A1数据庠中的化合物平均相对??分子质M大,而T1数据库中化合物的相对分子质量介于二者之间,丁1数据库中化合物??的平均相对分子质量368。而且,相对于A1数据库中的化合物来说,TI数据库中的化??合物与Ml数据库中的平均相对分子质量更为接近。如图5所示,相对TA1数据库中??化合物的相对分子质量的分布来说,Ml数据库中的化合物的相对分子质跫分布与T1数??据库中的相对分子质量分布从形态学上来讲更加接近。根据以上分析,可以发现,T1??数据库屮的化合物与Ml数据库中的化合物从相对分子质量这一性质上来讲较为相似。??由于相对分子质量与药物的人体吸收度联系密切
图7?PH=7.4情况下的表观脂水分配系数分布图??Fig?7?Distribution?of?apparent?lipid?water?distribution?coefficient?under??
【参考文献】:
期刊论文
[1]中药临方炮制现状与技术规范构建探讨[J]. 戴莹,翟华强,王宁宁,刘国秀,李丝雨,李宁宁,金世元. 中国中医药信息杂志. 2019(03)
[2]代谢组学技术在抗结核新药研发中的应用研究进展[J]. 古秀娟,曾娅莉,邓建军,霍婷婷,王玉琳,杨洁. 中国药房. 2019(04)
[3]不同类型丙烯酸酯压敏胶中右旋酮洛芬的体内外释药行为研究及原因探究[J]. 童想柳,杨雅丽,林国钡,武余波,罗华菲. 中国医药工业杂志. 2019(01)
[4]木质素的高附加值应用研究进展[J]. 黄曹兴,何娟,梁辰,唐硕,勇强. 林业工程学报. 2019(01)
[5]水液相环境下α-丙氨酸分子的旋光异构及氢氧根和羟基自由基的作用[J]. 杨晓翠,高峰,佟华,闫红彦,王佐成. 武汉大学学报(理学版). 2019(01)
[6]浅谈中药炮制中的整体观念与辩证论治观[J]. 陈磊收. 世界最新医学信息文摘. 2018(A5)
[7]生物活性测定法替代方法验证研究[J]. 李震,张媛,高华. 中国新药杂志. 2018(24)
[8]大叶种茶叶中游离氨基酸的提取条件研究[J]. 陈春月,钏相龙,曹喜念,陈圆圆,肖涵. 昆明学院学报. 2018(06)
[9]Luteolin与Galactose之间氢键相互作用的理论研究[J]. 罗冬梅,张贺,李可心,李明汉,高天,王俊丽. 赤峰学院学报(自然科学版). 2018(12)
[10]国内药食同源的产生与应用[J]. 范保瑞,张悦,刘红玉,薛玉菡,赵燕燕. 医学研究与教育. 2018(06)
博士论文
[1]民国时期(1912-1949)中药文献及其学术考察与研究[D]. 李楠.中国中医科学院 2014
硕士论文
[1]C-O单键官能团在半焦-NO反应中的作用[D]. 赵彤.中国科学院大学(中国科学院过程工程研究所) 2018
[2]复合薏仁油(C-ASO)防治皮肤癌变功效与机制研究[D]. 张真真.河南大学 2018
[3]相溶解度法结合分子模拟计算研究环糊精对六种天然药物的增溶机理[D]. 李昊原.沈阳师范大学 2018
[4]精氨酸对改善肝胆术后病人氮平衡的研究[D]. 许晓红.青岛大学 2014
本文编号:2916850
【文章来源】:哈尔滨商业大学黑龙江省
【文章页数】:62 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
图2年发布化合物结构与总结构数jft统计图??Fig?2?Statistics?of?compound?structure?and?total?structure?released?in??
对来自化学品目录数据库中的228362个化合物,来自药物数据库中的153365个化??合物和来自中药化合物数据库中的64352个化合物进行基于相对分子质量的分布分析,??得到如图5所示的分布结果。??010?B@*ACD1??S3MDDR1??nOITCMCOI??0.08??¥?0?.06??:L?I?I??0?100?200?300?400?500?600?700??图5相对分子质量分布图??Fig?5?Relative?molecular?mass?distribution?map??上表2和图5中数据表明,Ml与A1数据库中的化合物存在着明显的和对分子质??量差异,Ml数据库中化合物的平均分子质量力410,而A1数据库屮化合物的平均分子??质量为275。M1数据库中化合物平均相对分子质量较之A1数据庠中的化合物平均相对??分子质M大,而T1数据库中化合物的相对分子质量介于二者之间,丁1数据库中化合物??的平均相对分子质量368。而且,相对于A1数据库中的化合物来说,TI数据库中的化??合物与Ml数据库中的平均相对分子质量更为接近。如图5所示,相对TA1数据库中??化合物的相对分子质量的分布来说,Ml数据库中的化合物的相对分子质跫分布与T1数??据库中的相对分子质量分布从形态学上来讲更加接近。根据以上分析,可以发现,T1??数据库屮的化合物与Ml数据库中的化合物从相对分子质量这一性质上来讲较为相似。??由于相对分子质量与药物的人体吸收度联系密切
图7?PH=7.4情况下的表观脂水分配系数分布图??Fig?7?Distribution?of?apparent?lipid?water?distribution?coefficient?under??
【参考文献】:
期刊论文
[1]中药临方炮制现状与技术规范构建探讨[J]. 戴莹,翟华强,王宁宁,刘国秀,李丝雨,李宁宁,金世元. 中国中医药信息杂志. 2019(03)
[2]代谢组学技术在抗结核新药研发中的应用研究进展[J]. 古秀娟,曾娅莉,邓建军,霍婷婷,王玉琳,杨洁. 中国药房. 2019(04)
[3]不同类型丙烯酸酯压敏胶中右旋酮洛芬的体内外释药行为研究及原因探究[J]. 童想柳,杨雅丽,林国钡,武余波,罗华菲. 中国医药工业杂志. 2019(01)
[4]木质素的高附加值应用研究进展[J]. 黄曹兴,何娟,梁辰,唐硕,勇强. 林业工程学报. 2019(01)
[5]水液相环境下α-丙氨酸分子的旋光异构及氢氧根和羟基自由基的作用[J]. 杨晓翠,高峰,佟华,闫红彦,王佐成. 武汉大学学报(理学版). 2019(01)
[6]浅谈中药炮制中的整体观念与辩证论治观[J]. 陈磊收. 世界最新医学信息文摘. 2018(A5)
[7]生物活性测定法替代方法验证研究[J]. 李震,张媛,高华. 中国新药杂志. 2018(24)
[8]大叶种茶叶中游离氨基酸的提取条件研究[J]. 陈春月,钏相龙,曹喜念,陈圆圆,肖涵. 昆明学院学报. 2018(06)
[9]Luteolin与Galactose之间氢键相互作用的理论研究[J]. 罗冬梅,张贺,李可心,李明汉,高天,王俊丽. 赤峰学院学报(自然科学版). 2018(12)
[10]国内药食同源的产生与应用[J]. 范保瑞,张悦,刘红玉,薛玉菡,赵燕燕. 医学研究与教育. 2018(06)
博士论文
[1]民国时期(1912-1949)中药文献及其学术考察与研究[D]. 李楠.中国中医科学院 2014
硕士论文
[1]C-O单键官能团在半焦-NO反应中的作用[D]. 赵彤.中国科学院大学(中国科学院过程工程研究所) 2018
[2]复合薏仁油(C-ASO)防治皮肤癌变功效与机制研究[D]. 张真真.河南大学 2018
[3]相溶解度法结合分子模拟计算研究环糊精对六种天然药物的增溶机理[D]. 李昊原.沈阳师范大学 2018
[4]精氨酸对改善肝胆术后病人氮平衡的研究[D]. 许晓红.青岛大学 2014
本文编号:2916850
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