基于网络药理学和分子对接技术的藏药三味龙胆花片用于新型冠状病毒肺炎（COVID-19）的作用机制探讨
发布时间：2021-01-01 22:45
目的:初步探寻藏药三味龙胆花片治疗新型冠状病毒肺炎（COVID-19）的活性化合物及作用机制。方法:通过文献及中药系统药理学分析平台（TCMSP）检索藏药三味龙胆花片中白花龙胆、甘草、蜂蜜干膏的化学成分。通过Swiss Target Prediction数据库查询化学成分对应靶点,采用Cytoscape3.7.2构建化合物-靶点网络;结合DAVID基因本体GO功能富集分析和KEGG通路富集分析,预测其作用机制;对核心成分与抗COVID-19药物靶点进行分子对接验证。结果:化合物-靶点网络包含101个化合物,共对应168个靶点。GO功能富集分析得到GO条目291个（P<0.05）,其中生物过程（BP）条目186个,细胞组成（CC）条目33个,分子功能（MF）条目72个。KEGG通路富集筛选得到56条信号通路（P<0.05）,涉及钙离子信号通路、花生四烯酸代谢通路、MAPK信号通路等相关信号通路。分子对接结果显示,甘草香豆酮、槲皮素、山柰酚等核心成分与抗COVID-19药物潜在作用靶点的亲和力可能较推荐用药更强。结论:藏药三味龙胆花片可通过多成分、多靶点、多通路的协同作用发挥疗...
【文章来源】：中药药理与临床. 2020年03期 北大核心
【文章页数】：7 页
【部分图文】：
“三味龙胆花片药物-化合物-靶点”网络图
将2.2中得到的168 个靶标蛋白导入STRING 11.0数据库中进行分析,得到蛋白-蛋白相互作用网络图(见图2)。其中节点代表靶标蛋白,边代表蛋白之间的相互作用关系,图中含有168 个靶蛋白和889 条互作边,导入cytoscape3.7.2 软件分析得到degree值排名前5的靶点为MAPK3、EGFR、CASP3、STAT3、ESR1。2.4 靶点通路分析
GO功能富集分析得到GO条目291 个(P<0.05),其中生物过程(BP)条目186 个,细胞组成(CC)条目33 个,分子功能(MF)条目72 个,根据保留P<0.05的结果,并分别对前10 个条目进行可视化分析,见图3。由图3可知,涉及的主要生物过程富集条目为凋亡过程的负调控(negative regulation of apoptotic process)、蛋白质磷酸化(protein phosphorylation)、炎症反应(inflammatory response)等;涉及的主要细胞组成为质膜(plasma membrane)、细胞外泌体(extracellular exosome)、核质(nucleoplasm)等;涉及的主要分子功能为类固醇激素受体活性(steroid hormone receptor activity)、蛋白激酶活性(protein kinase activity)、转录因子结合(transcription factor binding)等。KEGG通路富集筛选得到56 条信号通路(P<0.05),对前20条通路进行分析,其中涉及的主要信号通路有钙离子信号通路、花生四烯酸代谢通路、MAPK信号通路、TRP通道、肾素血管紧张素系统等,见图4。图3 三味龙胆花片靶标的GO功能富集分析
【参考文献】：
期刊论文
[1]民族医药对新型冠状病毒肺炎的认识及防治措施[J]. 张吉仲,降拥彭措(噶布),纳顺达来,库尔班·艾力,李凤珍,王孝蓉,梅花·尼合买提,张之道,田华咏,祚穆-喏姿擀佈（杨福寿）,单于德,李文兵,刘圆. 中草药. 2020(06)
[2]抗新型冠状病毒肺炎药物靶点的研究进展[J]. 邓卫宁,王利娜,崔艳丽. 现代药物与临床. 2020(03)
[3]抗新型冠状病毒方剂基于花生四烯酸代谢通路防治“细胞因子风暴”的研究[J]. 任越,姚美村,霍晓乾,谷宇,朱卫星,乔延江,张燕玲. 中国中药杂志. 2020(06)
[4]融合“成分-靶点-共有通路”网络和分子对接技术的清肺口服液抗新型冠状病毒肺炎的活性成分初探[J]. 姚卫峰,翟园园,林丽丽,杨斌,庄莉,张丽,谢彤,赵霞,单进军,汪受传. 南京中医药大学学报. 2020(02)
[5]氨溴索治疗2019新型冠状病毒肺炎的研究现状[J]. 李敏,王进. 中国临床药理学杂志. 2020(09)
[6]中西医结合治疗新型冠状病毒肺炎的应用分析[J]. 韩园园,赵梦冉,石垚,宋兆辉,周水平,何毅. 中草药. 2020(04)
[7]基于肾素-血管紧张素系统评析新冠病毒致多脏器损伤作用及中药干预作用[J]. 张岩,唐德志,舒冰,李文雄,张佳莉,李钺,赫明超,沙南南,施杞,王拥军. 世界科学技术-中医药现代化. 2020(02)
[8]三味龙胆花片对克雷伯菌急性肺炎大鼠中NF-κB信号通路的影响[J]. 李彦桥,黄婉奕,高玥,赵学勇,古锐,曾勇,张静波,江勇. 中药新药与临床药理. 2018(06)
[9]槲皮素药理作用研究进展[J]. 马纳,李亚静,范吉平. 辽宁中医药大学学报. 2018(08)
[10]浅谈藏医对疫病的认识、预防及治疗[J]. 俄措卓玛. 西藏科技. 2016(09)
博士论文
[1]臭灵丹黄酮及倍半萜类化合物抗流感药效研究[D]. 何家扬.广州中医药大学 2018
本文编号：2952128
【文章来源】：中药药理与临床. 2020年03期 北大核心
【文章页数】：7 页
【部分图文】：
“三味龙胆花片药物-化合物-靶点”网络图
将2.2中得到的168 个靶标蛋白导入STRING 11.0数据库中进行分析,得到蛋白-蛋白相互作用网络图(见图2)。其中节点代表靶标蛋白,边代表蛋白之间的相互作用关系,图中含有168 个靶蛋白和889 条互作边,导入cytoscape3.7.2 软件分析得到degree值排名前5的靶点为MAPK3、EGFR、CASP3、STAT3、ESR1。2.4 靶点通路分析
GO功能富集分析得到GO条目291 个(P<0.05),其中生物过程(BP)条目186 个,细胞组成(CC)条目33 个,分子功能(MF)条目72 个,根据保留P<0.05的结果,并分别对前10 个条目进行可视化分析,见图3。由图3可知,涉及的主要生物过程富集条目为凋亡过程的负调控(negative regulation of apoptotic process)、蛋白质磷酸化(protein phosphorylation)、炎症反应(inflammatory response)等;涉及的主要细胞组成为质膜(plasma membrane)、细胞外泌体(extracellular exosome)、核质(nucleoplasm)等;涉及的主要分子功能为类固醇激素受体活性(steroid hormone receptor activity)、蛋白激酶活性(protein kinase activity)、转录因子结合(transcription factor binding)等。KEGG通路富集筛选得到56 条信号通路(P<0.05),对前20条通路进行分析,其中涉及的主要信号通路有钙离子信号通路、花生四烯酸代谢通路、MAPK信号通路、TRP通道、肾素血管紧张素系统等,见图4。图3 三味龙胆花片靶标的GO功能富集分析
【参考文献】：
期刊论文
[1]民族医药对新型冠状病毒肺炎的认识及防治措施[J]. 张吉仲,降拥彭措(噶布),纳顺达来,库尔班·艾力,李凤珍,王孝蓉,梅花·尼合买提,张之道,田华咏,祚穆-喏姿擀佈（杨福寿）,单于德,李文兵,刘圆. 中草药. 2020(06)
[2]抗新型冠状病毒肺炎药物靶点的研究进展[J]. 邓卫宁,王利娜,崔艳丽. 现代药物与临床. 2020(03)
[3]抗新型冠状病毒方剂基于花生四烯酸代谢通路防治“细胞因子风暴”的研究[J]. 任越,姚美村,霍晓乾,谷宇,朱卫星,乔延江,张燕玲. 中国中药杂志. 2020(06)
[4]融合“成分-靶点-共有通路”网络和分子对接技术的清肺口服液抗新型冠状病毒肺炎的活性成分初探[J]. 姚卫峰,翟园园,林丽丽,杨斌,庄莉,张丽,谢彤,赵霞,单进军,汪受传. 南京中医药大学学报. 2020(02)
[5]氨溴索治疗2019新型冠状病毒肺炎的研究现状[J]. 李敏,王进. 中国临床药理学杂志. 2020(09)
[6]中西医结合治疗新型冠状病毒肺炎的应用分析[J]. 韩园园,赵梦冉,石垚,宋兆辉,周水平,何毅. 中草药. 2020(04)
[7]基于肾素-血管紧张素系统评析新冠病毒致多脏器损伤作用及中药干预作用[J]. 张岩,唐德志,舒冰,李文雄,张佳莉,李钺,赫明超,沙南南,施杞,王拥军. 世界科学技术-中医药现代化. 2020(02)
[8]三味龙胆花片对克雷伯菌急性肺炎大鼠中NF-κB信号通路的影响[J]. 李彦桥,黄婉奕,高玥,赵学勇,古锐,曾勇,张静波,江勇. 中药新药与临床药理. 2018(06)
[9]槲皮素药理作用研究进展[J]. 马纳,李亚静,范吉平. 辽宁中医药大学学报. 2018(08)
[10]浅谈藏医对疫病的认识、预防及治疗[J]. 俄措卓玛. 西藏科技. 2016(09)
博士论文
[1]臭灵丹黄酮及倍半萜类化合物抗流感药效研究[D]. 何家扬.广州中医药大学 2018
本文编号：2952128
本文链接：https://www.wllwen.com/yixuelunwen/zhongyaolw/2952128.html
