青黛作用于急性幼粒细胞白血病的可视化“药靶蛋白模型”分析

发布时间：2021-01-19 05:17

　　目的:目前青黛已是治疗急性幼粒细胞白血病（APL）的临床有效药物,但其分子机制与物质基础仍不明确。基于此本研究构建青黛与APL可视化药靶蛋白模型,以探究青黛作用于APL的分子机制。方法:通过GEO数据库检索APL微阵列芯片分析APL差异表达基因,使用TCMSP数据库筛选青黛活性成分,结合PubChem和SwissTargetPrediction匹配活性成分的靶基因并进行富集分析。String用于挖掘并构建APL可视化蛋白互作数据,将其读入Cytoscape,通过Centiscape实现网络拓扑分析。综合APL差异表达基因,通过Sybyl与青黛活性成分构建药靶蛋白模型。结果:筛选出3张APL微阵列芯片,164个差异表达基因,9种青黛活性成分,541个靶基因,这些靶点较多地参与细胞凋亡、药物结合、癌症途径、慢性粒细胞白血病等,这些都在APL中起重要作用。拓扑分析显示ELANE,CTSS为核心基因,将其与青黛9种活性成分进行药靶蛋白模型预测,显示靛玉红和靛蓝与核心基因结合度最佳。结论:APL是受多基因调控的复杂疾病,而青黛成分中靛玉红和靛蓝可通过结合ELANE,CTSS作用于APL的发生发展... 

【文章来源】：世界中医药. 2020,15(12)

【文章页数】：8 页

【部分图文】：

对青黛作用靶基因进行GO富集分析

通过将2个核心基因ELANE、CTSS与青黛9种活性成分构建药靶蛋白模拟发现,青黛的活性成分靛玉红、靛蓝与ELANE,CTSS结合度较高,提示靛玉红、靛蓝干预ELANE,CTSS可能在青黛治疗APL中起重要作用。见图5。图4 APL网络拓扑属性分析

APL网络拓扑属性分析

【参考文献】：
期刊论文
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硕士论文
[1]中药系统药理学数据库和分析平台的构建和应用[D]. 汝锦龙.西北农林科技大学 2015



本文编号：2986409