基于网络药理学和分子对接技术预测复方绞股蓝胶囊治疗口腔扁平苔藓的分子机制

发布时间：2021-01-24 09:06

　　目的运用网络药理学及分子对接方法研究复方绞股蓝胶囊治疗口腔扁平苔藓的物质基础与潜在的分子机制。方法从TCMSP数据库中得出复方绞股蓝胶囊治疗口腔扁平苔藓的作用靶标,对共有基因构建PPI网络。构建"疾病-活性成分-靶点网络"图,并通过基于R语言的clusterprofiler进行GO和KEGG通路富集分析。将筛选出的复方绞股蓝胶囊活性成分与主要靶点进行分子对接。结果从复方绞股蓝胶囊中筛选出15个活性成分,包括绞股蓝皂苷类成分、灯盏乙素、槲皮素和鼠李素等,这些活性成分可与口腔扁平苔藓相关的54个潜在靶点发生相互作用,可能通过调节内分泌抵抗、丝裂原活化蛋白激酶信号通路、低氧诱导因子1信号通路、细胞因子-细胞因子受体相互作用等信号通路来发挥治疗作用。结论应用网络药理学和分子对接方法可揭示复方绞股蓝胶囊治疗口腔扁平苔藓的潜在作用机制,为进一步深入研究提供了理论参考。 

【文章来源】：广东药科大学学报. 2020,36(04)

【文章页数】：7 页

【部分图文】：

复方绞股蓝胶囊治疗OLP疾病-活性成分-靶点网络图

通过KEGG分析复方绞股蓝胶囊治疗OLP预测靶点的通路分布，结果共有14条KEGG代谢通路参与其中，如图3b所示，主要涉及内分泌抵抗(endocrine resistance)、丝裂原活化蛋白激酶信号通路(MAPK signaling pathway)、低氧诱导因子1信号通路(HIF-1 signaling pathway)、细胞因子-细胞因子受体相互作用(cytokine-cytokine receptor interaction)和EGFR酪氨酸激酶抑制剂耐药(EGFR tyrosine kinase inhibitor resistance)等。由此可见，复方绞股蓝胶囊通过调节多条代谢通路共同发挥治疗OLP的作用。2.6 复方绞股蓝胶囊活性成分与靶蛋白分子对接结果

将筛选出的复方绞股蓝胶囊中的15个活性成分与排名前4的靶点VEGFA、IL6、AKT1和EGF进行分子对接，选取打分最高(affinity数值最低)的构象作为对接构象，并利用pymol程序对其进行可视化分析[10]。每种活性成分产生10种对接结果，结合能越小说明受体与配体之间的亲和力越大，因而选取结合能较低且构象较好的结果作为分子对接结果。所有成分与靶点的结合能均小于-5 kcal/mol，如表3所示。Scutellarin、Gypenoside XII、ginsenoside f2和Gypentonoside A＿qt与4种靶蛋白对接的平均结合能值最低，其典型对接结果如图4所示。图4 复方绞股蓝胶囊治疗OLP的4个重要靶点的对接分析

【参考文献】：
期刊论文
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本文编号：2996979