鸡血藤及其混伪品的DNA条形码分子鉴定研究
发布时间:2021-03-17 13:37
目的采用分子生物学鉴定技术,筛选合适的DNA条形码序列,建立快速、准确鉴定鸡血藤的方法。方法采集72份鸡血藤及其混伪品的样本,分别提取样品DNA,对ITS2、matK、psbA-trnH、ITS和rbcL序列扩增、测序;计算各序列扩增成功率和测序成功率,利用MEGA7.0分析比对序列特征;基于Kimura-2-Parameter(K2P)双参数模型计算种内、种间的遗传距离评估Barcoding gap;利用Phylosuite软件构建ITS2、matK和psbA-trnH和多基因(I-M-P)联合系统发育树。结果 ITS2的扩增成功率和测序成功率最高,均为100%,matK和psbA-trnH的测序成功率亦有94.4%、91.7%,而rbcL和ITS仅为69.4%和61.1%;ITS2较其他条形码序列具有明显的Barcoding gap,且种内、种间重叠少;系统发育树显示,ITS2和psbA-trnH可将鸡血藤及其混伪品明显聚为不同分支,matK不能把滇鸡血藤和南五味子分开;I-M-P系统发育树同ITS2和psbA-trnH结果相同。结论以ITS2为主、psbA-trnH序列为辅的鉴定...
【文章来源】:中草药. 2020,51(12)北大核心
【文章页数】:10 页
【部分图文】:
扩增成功率和测序成功率
ITS2(A)、matK(B)和psbA(C)的遗传距离分布
多基因联合(I-M-P)贝叶斯系统发育树
【参考文献】:
期刊论文
[1]鸡血藤、滇鸡血藤、大血藤等血藤类药材的psbA-trnH条形码分子鉴定[J]. 周红,马双姣,陈贝贝,韩正洲,姚辉. 世界科学技术-中医药现代化. 2016(01)
[2]中药材DNA条形码分子鉴定指导原则[J]. 陈士林,姚辉,韩建萍,辛天怡,庞晓慧,石林春,罗焜,宋经元,侯典云,石上梅,钱忠直. 中国中药杂志. 2013(02)
[3]鸡血藤与其常见混淆品的薄层色谱鉴别研究[J]. 翟明,刘军民. 广州中医药大学学报. 2012(03)
[4]鸡血藤的品种与考证[J]. 郑立雄,丁艳芬,杨崇仁. 中国现代中药. 2012(02)
[5]鸡血藤化学成分及药理作用研究进展[J]. 符影,程悦,陈建萍,王冬梅. 中草药. 2011(06)
[6]鸡血藤的性状鉴定[J]. 陈道峰,徐国钧,徐珞珊,金蓉鸾. 中药材. 1993(08)
本文编号:3087224
【文章来源】:中草药. 2020,51(12)北大核心
【文章页数】:10 页
【部分图文】:
扩增成功率和测序成功率
ITS2(A)、matK(B)和psbA(C)的遗传距离分布
多基因联合(I-M-P)贝叶斯系统发育树
【参考文献】:
期刊论文
[1]鸡血藤、滇鸡血藤、大血藤等血藤类药材的psbA-trnH条形码分子鉴定[J]. 周红,马双姣,陈贝贝,韩正洲,姚辉. 世界科学技术-中医药现代化. 2016(01)
[2]中药材DNA条形码分子鉴定指导原则[J]. 陈士林,姚辉,韩建萍,辛天怡,庞晓慧,石林春,罗焜,宋经元,侯典云,石上梅,钱忠直. 中国中药杂志. 2013(02)
[3]鸡血藤与其常见混淆品的薄层色谱鉴别研究[J]. 翟明,刘军民. 广州中医药大学学报. 2012(03)
[4]鸡血藤的品种与考证[J]. 郑立雄,丁艳芬,杨崇仁. 中国现代中药. 2012(02)
[5]鸡血藤化学成分及药理作用研究进展[J]. 符影,程悦,陈建萍,王冬梅. 中草药. 2011(06)
[6]鸡血藤的性状鉴定[J]. 陈道峰,徐国钧,徐珞珊,金蓉鸾. 中药材. 1993(08)
本文编号:3087224
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