基于网络药理学和分子对接技术探索银翘散治疗小儿新型冠状病毒肺炎活性化合物的研究

发布时间：2021-03-19 21:03

　　目的:探寻银翘散治疗新型冠状病毒肺炎（coronavirus disease 2019,COVID-19）的活性化合物。方法:应用中药系统药理学分析平台（Traditional Chinese Medicine System Pharmacological,TCMSP）、PubChem数据库、SwissTargetPrediction数据库挖掘获取银翘散中金银花、连翘、桔梗、薄荷、牛蒡子、竹叶、荆芥穗、淡豆豉、甘草、芦根的活性成分和作用靶点;应用Cytoscape 3.7.2软件构建银翘散成分-靶点网络;利用String数据库构建银翘散作用靶标的PPI网络;通过WebGestalt数据库和KOBAS 3.0数据库对银翘散作用靶点进行GO分析和KEGG富集分析,筛选出潜在通路并分析其作用机制。结果:共筛选出153个银翘散生物活性成分和580个靶点,核心靶点为PTGS2、HSP90AA1、AR、PCP4、F7,主要涉及PI3K-Akt信号通路、MAPK信号通路、细胞凋亡途径、细胞衰老通路、非小细胞肺癌通路等信号通路。分子对接结果显示类黄酮、山柰酚等核心化合物与COVID-19推荐用药的亲和... 

【文章来源】：中医学报. 2020,35(09)

【文章页数】：10 页

【部分图文】：

化合物作用靶点的KEGG富集分析的前25条通路

由上述结果可知,银翘散中存在不同药物含有相同化合物,不同化合物中含有相同的作用靶点的情况,由此可映射出中医异病同治,同病异治的思想。为了解银翘散中化合物的分布情况,利用在线韦恩图排重后得到银翘散153种化合物,韦恩图结果见图2。其中MOL000006-木樨草素为薄荷、桔梗、金银花、荆芥穗、连翘、竹叶所共有,MOL000422-山柰酚为甘草、金银花、连翘、牛蒡子所共有,MOL000358-β-谷甾醇为金银花、连翘、牛蒡子所共有,MOL000098-槲皮素为甘草、金银花、连翘所共有,MOL000449-豆甾醇为金银花、荆芥穗、芦根所共有,MOL001689-金合欢素为薄荷、桔梗、荆芥穗所共有,MOL000359-β-谷甾醇为薄荷、甘草、荆芥穗所共有,MOL002773-β-胡萝卜素为金银花、牛蒡子所共有,MOL000522-牛蒡苷和MOL003290-二甲基苦参醇为连翘、牛蒡子所共有,MOL000211-丁子香萜为甘草、连翘所共有,MOL004328-柚皮素为薄荷、甘草所共有。2.4 构建银翘散活性成分的靶标蛋白互作网络

在string数据库对银翘散活性成分的作用靶点进行蛋白质与蛋白质之间相互作用关系的分析,将结果导入Cytoscape 3.7.2软件进行可视化分析,舍弃孤立节点得到485个节点,3 729条相互作用关系的蛋白质-蛋白质相互作用PPI网络图,见图3,节点大小代表其度值的大小,颜色冷暖代表连接强度的强弱。利用软件中NetworkAnalyzer工具PPI网络中出现的蛋白的频次进行统计得到排名前30的蛋白,排名较前的蛋白有APP、PIK3CA、PIK3R1、MAPK1、MAPK3、SRC、AKT1等,可能为治疗小儿新冠肺炎的靶点,结果见图4。2.5 GO和KEGG分析

【参考文献】：
期刊论文
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本文编号：3090225