抗肝纤维化lncRNAs的转录组测序分析及青蒿琥酯抑制hHSC活化的机制研究
发布时间:2021-04-25 21:45
目的:首先,基于二代测序RNA-sequencing(RNA-seq)技术和高通量大数据分析方法鉴定和分析人类来源HSC细胞(human Hepatic Stellate Cell,hHSC)活化和静止过程中差异的长链非编码RNA(Long noncoding RNA,lncRNA)和mRNA表达谱改变。分析差异表达(Differentially Expressed,DE)的lncRNA可能的分子功能和参与调控的通路。鉴定出通过抑制hHSC活化的重要抗肝纤维化lncRNAs分子,为抗肝纤维化机制研究和药物治疗靶点研究提供潜在的lncRNA分子机制。最后,探讨中药单体青蒿琥酯对hHSC活化的影响,阐明青蒿琥酯参与hHSC活化或静息内在机制。从而发掘青蒿琥酯抗肝纤维的潜在药物机制,为其临床提供科学依据。方法:本研究采用丙戊酸(Valproic acid,VPA)诱导活化的hHSC静息,建立抗肝纤维化的细胞模型;提取活化和静止的hHSC样品中的Total RNA建RNA文库,应用RNA-seq技术对活化和静息的hHSC样品进行测序;利用HISAT对比软件和StringTie对测序得到的rea...
【文章来源】:广州中医药大学广东省
【文章页数】:78 页
【学位级别】:硕士
【文章目录】:
中文摘要
Abstract
引言
研究背景
实验部分
第一部分 丙戊酸逆转活化人肝星状细胞静息的细胞模型建立
1.1 实验材料
1.2 实验方法
1.3 结果
1.4 讨论
1.5 小结
第二部分 抗肝纤维化相关的lncRNAs的筛选与生物信息学分析研究
2.1 实验材料
2.2 实验方法
2.3 实验结果
2.4 讨论
2.5 小结
第三部分 青蒿琥酯通过阻止EMT转化抑制肝星状细胞活化
前言
3.1 实验材料
3.2 实验方法
3.3 结果
3.4 讨论
3.5 小结
结语和展望
参考文献
附录
附录1:所有样本RNA-seq测序数据的碱基分布图
附录2:所有样本RNA-seq测序数据的碱基质量分布图
附录3:本文使用的缩略语(按字母顺序排列)
附录4:硕士研究生在读期间的研究成果
致谢
附件
【参考文献】:
期刊论文
[1]青蒿琥酯抗肝纤维化作用机制的研究进展[J]. 钱鹏,陈剑群. 重庆医学. 2017(02)
[2]Global epidemiology of hepatitis C virus infection: an up-date of the distribution and circulation of hepatitis C virus genotypes[J]. Arnolfo Petruzziello,Samantha Marigliano,Giovanna Loquercio,Anna Cozzolino,Carmela Cacciapuoti. World Journal of Gastroenterology. 2016(34)
[3]青蒿琥酯对肝纤维化相关分子机制的影响研究进展[J]. 白瑞丹,张洪,黄萃园. 医学综述. 2016(17)
[4]Effect of artesunate supplementation on bacterial translocation and dysbiosis of gut microbiota in rats with liver cirrhosis[J]. Yun-Xia Chen,Li-Na Lai,Hui-Ying Zhang,Yang-Hui Bi,Li Meng,Xu-Jiong Li,Xiao-Xia Tian,Li-Min Wang,Yi-Min Fan,Zhong-Fu Zhao,De-Wu Han,Cheng Ji. World Journal of Gastroenterology. 2016(10)
[5]Chronic hepatitis C and liver fibrosis[J]. Giada Sebastiani,Konstantinos Gkouvatsos,Kostas Pantopoulos. World Journal of Gastroenterology. 2014(32)
[6]Mechanisms of fibrogenesis in liver cirrhosis:The molecular aspects of epithelial-mesenchymal transition[J]. Sun-Jae Lee,Kyung-Hyun Kim,Kwan-Kyu Park. World Journal of Hepatology. 2014(04)
[7]肝纤维化的流行病学研究进展[J]. 范慧宁,陈尼维. 国际消化病杂志. 2014(01)
[8]中国人群乙型病毒性肝炎血清流行病学调查——乙型肝炎疫苗接种降低乙型肝炎病毒感染率[J]. 崔富强. 中国疫苗和免疫. 2010(04)
[9]江一平治疗慢性肝炎肝纤维化经验[J]. 刘翔. 江西中医药. 2007(04)
[10]汉防己甲素抗肝纤维化研究进展[J]. 李定国,陆汉明,陈颖伟. 世界华人消化杂志. 1999(02)
本文编号:3160147
【文章来源】:广州中医药大学广东省
【文章页数】:78 页
【学位级别】:硕士
【文章目录】:
中文摘要
Abstract
引言
研究背景
实验部分
第一部分 丙戊酸逆转活化人肝星状细胞静息的细胞模型建立
1.1 实验材料
1.2 实验方法
1.3 结果
1.4 讨论
1.5 小结
第二部分 抗肝纤维化相关的lncRNAs的筛选与生物信息学分析研究
2.1 实验材料
2.2 实验方法
2.3 实验结果
2.4 讨论
2.5 小结
第三部分 青蒿琥酯通过阻止EMT转化抑制肝星状细胞活化
前言
3.1 实验材料
3.2 实验方法
3.3 结果
3.4 讨论
3.5 小结
结语和展望
参考文献
附录
附录1:所有样本RNA-seq测序数据的碱基分布图
附录2:所有样本RNA-seq测序数据的碱基质量分布图
附录3:本文使用的缩略语(按字母顺序排列)
附录4:硕士研究生在读期间的研究成果
致谢
附件
【参考文献】:
期刊论文
[1]青蒿琥酯抗肝纤维化作用机制的研究进展[J]. 钱鹏,陈剑群. 重庆医学. 2017(02)
[2]Global epidemiology of hepatitis C virus infection: an up-date of the distribution and circulation of hepatitis C virus genotypes[J]. Arnolfo Petruzziello,Samantha Marigliano,Giovanna Loquercio,Anna Cozzolino,Carmela Cacciapuoti. World Journal of Gastroenterology. 2016(34)
[3]青蒿琥酯对肝纤维化相关分子机制的影响研究进展[J]. 白瑞丹,张洪,黄萃园. 医学综述. 2016(17)
[4]Effect of artesunate supplementation on bacterial translocation and dysbiosis of gut microbiota in rats with liver cirrhosis[J]. Yun-Xia Chen,Li-Na Lai,Hui-Ying Zhang,Yang-Hui Bi,Li Meng,Xu-Jiong Li,Xiao-Xia Tian,Li-Min Wang,Yi-Min Fan,Zhong-Fu Zhao,De-Wu Han,Cheng Ji. World Journal of Gastroenterology. 2016(10)
[5]Chronic hepatitis C and liver fibrosis[J]. Giada Sebastiani,Konstantinos Gkouvatsos,Kostas Pantopoulos. World Journal of Gastroenterology. 2014(32)
[6]Mechanisms of fibrogenesis in liver cirrhosis:The molecular aspects of epithelial-mesenchymal transition[J]. Sun-Jae Lee,Kyung-Hyun Kim,Kwan-Kyu Park. World Journal of Hepatology. 2014(04)
[7]肝纤维化的流行病学研究进展[J]. 范慧宁,陈尼维. 国际消化病杂志. 2014(01)
[8]中国人群乙型病毒性肝炎血清流行病学调查——乙型肝炎疫苗接种降低乙型肝炎病毒感染率[J]. 崔富强. 中国疫苗和免疫. 2010(04)
[9]江一平治疗慢性肝炎肝纤维化经验[J]. 刘翔. 江西中医药. 2007(04)
[10]汉防己甲素抗肝纤维化研究进展[J]. 李定国,陆汉明,陈颖伟. 世界华人消化杂志. 1999(02)
本文编号:3160147
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