基于网络药理学研究柴胡疏肝散治疗急性胰腺炎的作用机制
发布时间：2021-07-11 00:11
目的:基于网络药理学,筛选柴胡疏肝散（CSS）化学成分和潜在作用靶点,探究其治疗急性胰腺炎（AP）可能的作用机制。方法:采用TCMSP数据库检索、筛选CSS中七味中药柴胡、川芎、香附、白芍、枳壳、陈皮、甘草的主要活性成分及对应蛋白靶标。通过Drugbank和TTD数据库收集已知调控AP的蛋白靶标,与成分对应蛋白相对应,筛选出共有基因作为候选预测靶标。采用String数据库对预测靶标进行基因本体（GO）功能分析以及KEGG通路富集分析,Discovery studio 3.0软件对候选活性成分与候选靶标进行虚拟对接。利用Cytoscape 3.7.2绘制"成分-靶标"和"蛋白-通路"网络图。结果:通过口服利用度（OB）、类药性（DL）、药物半衰期（HL）筛选CSS全方成分,共得68个活性成分。网络分析表明,CSS中的柴胡皂苷C、柴胡皂苷D、叶酸、柚皮苷、橙皮苷和甘草苷可能通过癌症、PI3K-Akt、细胞凋亡、AGE-RAGE等信号通路来调控BCL2L1、PTGS2、MCL1、RAF1、IL-6、AKT1等25个靶点治疗急性胰腺炎。结论:建立CSS-AP-靶点互作网络来诠释多成分-多靶点-...
【文章来源】：陕西中医. 2020,41(07)
【文章页数】：5 页
【部分图文】：
FDR前10名GO分析
通过TCMSP收集68个活性化合物对应靶点,去重得到249个蛋白靶标,与TTD数据库和DrugBank数据库去重所得354个蛋白靶标进行比对取交集,利用韦恩图展示疾病靶点与成分靶点之间交集情况(图1),红色代表AP靶点,绿色代表CSS靶点,重叠部分为共同靶点。共得到25个交集靶点,分别为PRKCA、PPARG、PTGS1、PTGS2、MAPK14、MAPK8、MAPK1、MAPK10、GSK3B、PTGES、MDM2、APP、CASP3、CASP7、IL6、ACHE、BCL2、BCL2L1、IKBKB、AKT1、CHEK2、HMOX1、VEGFA、MCL1、RAF1,用于后续网络药理学分析。3 GO与KEGG富集分析
将25个预测蛋白导入STRING数据库,物种选Homo sapiens,为提高准确率,置信度设置为0.9,共包含25个节点,46条边的蛋白质相互作用网络图(PPI)(图2)。同时,对预测蛋白进行GO分析,选取FDR排名前10名的条目建立柱状图(图3),蓝色为生物过程,粉色为细胞组成,黄色为分子功能。对预测蛋白进行KEGG通路分析并采用Cytoscape软件展示FDR前20名的通路的蛋白富集情况(图4),结果显示,蛋白较多富集在癌症信号通路、PI3K-Akt信号通路、细胞凋亡信号通路、AGE-RAGE信号通路和TNF信号通路等,说明CSS的活性成分可通过这些通路来干预急性胰腺炎。图3 FDR前10名GO分析
【参考文献】：
期刊论文
[1]基于UPLC-QE-Orbitrap-MS技术的柴胡-白芍药对血清药物化学分析[J]. 阴奇材,陈聪聪,田俊生,高晓霞,秦雪梅,杜冠华,周玉枝. 药学学报. 2019(12)
[2]急性胰腺炎相关发病机制及病因的研究进展[J]. 武亮,艾迎春. 齐齐哈尔医学院学报. 2019(05)
[3]川芎主要药理活性成分药理研究进展[J]. 李海刚,胡晒平,周意,徐丹丹,马宁,唐靖,鲍美华,郑霞辉. 中国临床药理学与治疗学. 2018(11)
[4]急性胰腺炎中医诊疗专家共识意见（2017）[J]. 张声生,李慧臻. 临床肝胆病杂志. 2017(11)
[5]网络药理学与中医药现代研究的若干进展[J]. 张彦琼,李梢. 中国药理学与毒理学杂志. 2015(06)
[6]柴胡疏肝散的临床应用及现代研究进展[J]. 张宏武,邹忠梅. 时珍国医国药. 2007(05)
[7]环氧合酶-2在重症急性胰腺炎大鼠胰腺组织中表达的实验研究[J]. 陈善正,李宜雄,吕新生. 中国普通外科杂志. 2004(06)
[8]急性胰腺炎时细胞凋亡及调控基因的研究进展[J]. 尚东,关凤林. 国外医学(生理、病理科学与临床分册). 2001(02)
硕士论文
[1]芍药甘草汤在正常及多囊卵巢综合征大鼠体内的药代动力学比较及药物代谢研究[D]. 程瑶.山西医科大学 2019
[2]柴胡皂苷d对顺铂导致大鼠胃粘膜炎性损伤的保护作用机制研究[D]. 沈珊.辽宁中医药大学 2018
本文编号：3276931
【文章来源】：陕西中医. 2020,41(07)
【文章页数】：5 页
【部分图文】：
FDR前10名GO分析
通过TCMSP收集68个活性化合物对应靶点,去重得到249个蛋白靶标,与TTD数据库和DrugBank数据库去重所得354个蛋白靶标进行比对取交集,利用韦恩图展示疾病靶点与成分靶点之间交集情况(图1),红色代表AP靶点,绿色代表CSS靶点,重叠部分为共同靶点。共得到25个交集靶点,分别为PRKCA、PPARG、PTGS1、PTGS2、MAPK14、MAPK8、MAPK1、MAPK10、GSK3B、PTGES、MDM2、APP、CASP3、CASP7、IL6、ACHE、BCL2、BCL2L1、IKBKB、AKT1、CHEK2、HMOX1、VEGFA、MCL1、RAF1,用于后续网络药理学分析。3 GO与KEGG富集分析
将25个预测蛋白导入STRING数据库,物种选Homo sapiens,为提高准确率,置信度设置为0.9,共包含25个节点,46条边的蛋白质相互作用网络图(PPI)(图2)。同时,对预测蛋白进行GO分析,选取FDR排名前10名的条目建立柱状图(图3),蓝色为生物过程,粉色为细胞组成,黄色为分子功能。对预测蛋白进行KEGG通路分析并采用Cytoscape软件展示FDR前20名的通路的蛋白富集情况(图4),结果显示,蛋白较多富集在癌症信号通路、PI3K-Akt信号通路、细胞凋亡信号通路、AGE-RAGE信号通路和TNF信号通路等,说明CSS的活性成分可通过这些通路来干预急性胰腺炎。图3 FDR前10名GO分析
【参考文献】：
期刊论文
[1]基于UPLC-QE-Orbitrap-MS技术的柴胡-白芍药对血清药物化学分析[J]. 阴奇材,陈聪聪,田俊生,高晓霞,秦雪梅,杜冠华,周玉枝. 药学学报. 2019(12)
[2]急性胰腺炎相关发病机制及病因的研究进展[J]. 武亮,艾迎春. 齐齐哈尔医学院学报. 2019(05)
[3]川芎主要药理活性成分药理研究进展[J]. 李海刚,胡晒平,周意,徐丹丹,马宁,唐靖,鲍美华,郑霞辉. 中国临床药理学与治疗学. 2018(11)
[4]急性胰腺炎中医诊疗专家共识意见（2017）[J]. 张声生,李慧臻. 临床肝胆病杂志. 2017(11)
[5]网络药理学与中医药现代研究的若干进展[J]. 张彦琼,李梢. 中国药理学与毒理学杂志. 2015(06)
[6]柴胡疏肝散的临床应用及现代研究进展[J]. 张宏武,邹忠梅. 时珍国医国药. 2007(05)
[7]环氧合酶-2在重症急性胰腺炎大鼠胰腺组织中表达的实验研究[J]. 陈善正,李宜雄,吕新生. 中国普通外科杂志. 2004(06)
[8]急性胰腺炎时细胞凋亡及调控基因的研究进展[J]. 尚东,关凤林. 国外医学(生理、病理科学与临床分册). 2001(02)
硕士论文
[1]芍药甘草汤在正常及多囊卵巢综合征大鼠体内的药代动力学比较及药物代谢研究[D]. 程瑶.山西医科大学 2019
[2]柴胡皂苷d对顺铂导致大鼠胃粘膜炎性损伤的保护作用机制研究[D]. 沈珊.辽宁中医药大学 2018
本文编号：3276931
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