基于网络药理学的桂枝加葛根汤治疗颈椎病作用机制研究

发布时间：2021-07-13 17:23

　　目的查询筛选桂枝加葛根汤治疗颈椎病的靶点、通路,明确桂枝加葛根汤的药理学作用。方法通过TCMSP中药系统药理学数据库与分析平台,定义生物利用度（OB）≥30%,类药性（DL）≥0. 18,获得桂枝加葛根汤的有效成分,利用Uni Prot系统确定靶点基因,然后查询OMIM、Dis Ge NET、Gene Cards等数据库,挖掘颈椎病相关的基因靶点。最后对两种靶点基因取交集,运用STRING数据库和Cytoscape软件,构建中药-成分-靶基因-疾病的中药调控网络,查找桂枝加葛根汤治疗颈椎病的核心靶点基因,对核心蛋白进行GO和KEGG的分析。结果桂枝加葛根汤的有效化学成分共1 001个,筛选后获得最终150个,基因靶点221个。确定颈椎病靶点12 171个,二者共同靶点基因180个,PPI网络分析发现STAT3、AKT1、JUN、IL6、MAPK、EGFR可能是桂枝加葛根汤治疗颈椎病的关键靶点。GO富集分析确定了154个条目（P <0. 05）,其中生物过程主要包括DNA结合转录激活剂活性、酰胺结合、细胞因子受体结合等; KEGG通路富集分析明确了166条信号通路,其中信号通路涉及... 

【文章来源】：世界中西医结合杂志. 2020,15(07)

【文章页数】：6 页

【部分图文】：

药物预测靶点与疾病靶点韦恩图

通过Cytoscape 3.7.1软件绘制并分析桂枝加葛根汤干预颈椎病成分-靶点网络图。红色菱形表示颈椎病，蓝色长方形代表桂枝加葛根汤的中药组成，黄色箭头代表活性成分，绿色椭圆表示基因靶点。该网络共包括节点296个，成分靶点间共存在3 409条相互作用关系。结果见图2。2.4 PPI网络构建及核心蛋白确定

通过STRING 11.0数据库在线检索蛋白质(已知蛋白和预测蛋白)之间相互作用的数据库，初步构建PPI蛋白网络图，设置medium confidence参数为0.9，在Export模块中，导出文本文件保存为string＿interactions.tsv，依据节点(degree)的多少，得到互作关系排名前30的靶点确定核心蛋白，制作barplot条形图。结果见图3。左列为基因名，如STAT3(Signal transducer and activator of Transcription3，信号传导及转录活化子3)，数字为相应基因邻接节点数目，如STAT3邻接节点数目为31个。

【参考文献】：
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本文编号：3282481