利用网络药理学确定薏苡仁作用肝癌的有效活性成分
发布时间：2021-08-14 06:22
基于网络药理学预测薏苡仁治疗肝癌的有效活性成分及靶点。运用TCMSP数据库筛选薏苡仁的有效活性成分; ChEMBL及TCMSP数据库预测薏苡仁有效活性成分对应的靶点;运用GeneCards数据库,TTD数据库,GAD数据库和TCMSP数据库筛选肝癌的相关靶点;通过Cytoscape软件建立利用"薏苡仁有效活性成分-肝癌疾病靶点"网络模型; DAVID数据库对"薏苡仁有效活性成分-肝癌疾病靶点"进行GO注释分析和KEGG通路分析。通过Discovery Studio软件对薏苡仁有效活性成分与作用靶点进行分子对接验证。该研究筛选得到薏苡仁15个有效成分,与肝癌相关的靶点有13个及相关信号通路7条。网络分析结果表明薏苡仁可能通过作用于TERT,CYP3A4,NR1H3,ALDH1A1,ESR1,SLCO1B3,SRD5A2,CYP1A2,CYP2D6,FABP1等关键靶点发挥抗肝癌作用。分子对接结果显示SRD5A2蛋白与薏苡仁成分对接评分最高,而薏苡仁成分中以sitosterol,stigmasterol,oleic acid 3个成分与SRD5A2蛋白结合作用最强。该研究初步揭示了薏苡仁治...
【文章来源】：中国新药杂志. 2020,29(16)北大核心CSCD
【文章页数】：9 页
【部分图文】：
薏苡仁有效活性成分-靶点网络图
在Gene Card中与肝癌有关的靶点共737个，在TCMSP中与肝癌相关的靶点有1个，在TTD中与肝癌有关的靶点共11个，在GAD中与肝癌有关的靶点共76个，将4种方法得到的靶点取并集，即确定为肝癌相关的靶点。采用STRING数据库构建AD蛋白质相互作用关系网络图(见图2)。4薏苡仁有效活性成分-肝癌靶点网络图构建与分析
利用GAD,TCMSP,TTD和Gene Cards数据库检索肝癌相关靶点，并与ChEMBL数据库筛选靶点结果进行筛选比对，其中油酸甲酯(methyl oleate)并无肝癌相关靶点，整理剩余6个活性成分调控结果，可知共调控13个肝癌相关靶点。运用Cytoscape3.5.1构建“成分-靶点-疾病”网络，其中椭圆形节点是薏苡仁抗肝癌的有效活性成分共6个，菱形节点是薏苡仁有效活性成分抗肝癌的靶点共13个，红色节点为肝癌疾病(见表2和图3)。对网络节点进行网络拓扑分析，节点的大小是依据网络中的dgree而设定，即节点越大对应的靶基因的dgree值越大(见表3)。5通路富集分析
【参考文献】：
期刊论文
[1]基于网络药理学和分子对接研究龙葵治疗肝癌的分子机制[J]. 刘嘉辉,吕东勇,周厚明,邝卫红,陈泽雄,张诗军. 中国中药杂志. 2020(01)
[2]基于网络药理学的四物汤治疗原发性痛经的作用机制研究[J]. 李杰,石金凤,聂欣,江华娟,傅超美,何瑶. 中国中药杂志. 2019(03)
[3]基于TCMSP抗肿瘤中药小分子EGFR-TKI的研究[J]. 刘志强,王博龙. 井冈山大学学报(自然科学版). 2018(02)
[4]Cancer incidence and mortality in China, 2014[J]. Wanqing Chen,Kexin Sun,Rongshou Zheng,Hongmei Zeng,Siwei Zhang,Changfa Xia,Zhixun Yang,He Li,Xiaonong Zou,Jie He. Chinese Journal of Cancer Research. 2018(01)
[5]基于TCMSP对玫瑰花黄酮和挥发油防治心血管疾病的协同作用及其机制研究[J]. 袁长胜,陈文. 石河子大学学报(自然科学版). 2016(06)
[6]BiNGO及DAVID在miR-155靶基因富集分析中的应用[J]. 杨蓉,蔡琳. 福建医科大学学报. 2012(06)
[7]薏苡仁提取物注射液对人肺腺癌的抗肿瘤作用研究[J]. 严萍萍,尹蓓珮,刘畅,陆宏祺,李炳生. 世界临床药物. 2012(09)
[8]薏苡仁油软胶囊对移植于裸鼠的人体前列腺肿瘤PC-3M的抑制作用[J]. 蔡烈涛,尹蓓,刘畅,陆宏祺,李炳生. 中国现代应用药学. 2010(12)
[9]Experimental study on the effect of Kang-Lai-Te induced apoptosis of human hepatoma carcinoma cell HepG2[J]. Yun Lu,Li-Qun Wu,Qian Dong and Chang-Sheng Li Department of Hepatobiliary Surgery,Department of Pediatric Surgery,and Center of Cell and Molecular Pathology,Affiliated Hospital of Medical College, Qingdao University,Qingdao 266003,China. Hepatobiliary & Pancreatic Diseases International. 2009(03)
[10]康莱特对大鼠的镇痛作用及其对促炎细胞因子的影响[J]. 谭煌英,李园,于莉莉,郭建,朱世杰,李佩文. 中国中西医结合外科杂志. 2007(02)
硕士论文
[1]康莱特治疗原发性肝癌的临床疗效观察[D]. 魏丽娜.吉林大学 2019
本文编号：3341946
【文章来源】：中国新药杂志. 2020,29(16)北大核心CSCD
【文章页数】：9 页
【部分图文】：
薏苡仁有效活性成分-靶点网络图
在Gene Card中与肝癌有关的靶点共737个，在TCMSP中与肝癌相关的靶点有1个，在TTD中与肝癌有关的靶点共11个，在GAD中与肝癌有关的靶点共76个，将4种方法得到的靶点取并集，即确定为肝癌相关的靶点。采用STRING数据库构建AD蛋白质相互作用关系网络图(见图2)。4薏苡仁有效活性成分-肝癌靶点网络图构建与分析
利用GAD,TCMSP,TTD和Gene Cards数据库检索肝癌相关靶点，并与ChEMBL数据库筛选靶点结果进行筛选比对，其中油酸甲酯(methyl oleate)并无肝癌相关靶点，整理剩余6个活性成分调控结果，可知共调控13个肝癌相关靶点。运用Cytoscape3.5.1构建“成分-靶点-疾病”网络，其中椭圆形节点是薏苡仁抗肝癌的有效活性成分共6个，菱形节点是薏苡仁有效活性成分抗肝癌的靶点共13个，红色节点为肝癌疾病(见表2和图3)。对网络节点进行网络拓扑分析，节点的大小是依据网络中的dgree而设定，即节点越大对应的靶基因的dgree值越大(见表3)。5通路富集分析
【参考文献】：
期刊论文
[1]基于网络药理学和分子对接研究龙葵治疗肝癌的分子机制[J]. 刘嘉辉,吕东勇,周厚明,邝卫红,陈泽雄,张诗军. 中国中药杂志. 2020(01)
[2]基于网络药理学的四物汤治疗原发性痛经的作用机制研究[J]. 李杰,石金凤,聂欣,江华娟,傅超美,何瑶. 中国中药杂志. 2019(03)
[3]基于TCMSP抗肿瘤中药小分子EGFR-TKI的研究[J]. 刘志强,王博龙. 井冈山大学学报(自然科学版). 2018(02)
[4]Cancer incidence and mortality in China, 2014[J]. Wanqing Chen,Kexin Sun,Rongshou Zheng,Hongmei Zeng,Siwei Zhang,Changfa Xia,Zhixun Yang,He Li,Xiaonong Zou,Jie He. Chinese Journal of Cancer Research. 2018(01)
[5]基于TCMSP对玫瑰花黄酮和挥发油防治心血管疾病的协同作用及其机制研究[J]. 袁长胜,陈文. 石河子大学学报(自然科学版). 2016(06)
[6]BiNGO及DAVID在miR-155靶基因富集分析中的应用[J]. 杨蓉,蔡琳. 福建医科大学学报. 2012(06)
[7]薏苡仁提取物注射液对人肺腺癌的抗肿瘤作用研究[J]. 严萍萍,尹蓓珮,刘畅,陆宏祺,李炳生. 世界临床药物. 2012(09)
[8]薏苡仁油软胶囊对移植于裸鼠的人体前列腺肿瘤PC-3M的抑制作用[J]. 蔡烈涛,尹蓓,刘畅,陆宏祺,李炳生. 中国现代应用药学. 2010(12)
[9]Experimental study on the effect of Kang-Lai-Te induced apoptosis of human hepatoma carcinoma cell HepG2[J]. Yun Lu,Li-Qun Wu,Qian Dong and Chang-Sheng Li Department of Hepatobiliary Surgery,Department of Pediatric Surgery,and Center of Cell and Molecular Pathology,Affiliated Hospital of Medical College, Qingdao University,Qingdao 266003,China. Hepatobiliary & Pancreatic Diseases International. 2009(03)
[10]康莱特对大鼠的镇痛作用及其对促炎细胞因子的影响[J]. 谭煌英,李园,于莉莉,郭建,朱世杰,李佩文. 中国中西医结合外科杂志. 2007(02)
硕士论文
[1]康莱特治疗原发性肝癌的临床疗效观察[D]. 魏丽娜.吉林大学 2019
本文编号：3341946
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