基于网络药理学及分子对接技术探讨化湿败毒方治疗新型冠状病毒肺炎的分子机制
发布时间:2021-08-17 15:56
目的:从网络药理学角度探讨化湿败毒方治疗新型冠状病毒肺炎(COVID-19)的作用机制,为其临床治疗、新药开发提供参考。方法:在TCMSP数据库中筛选出化湿败毒方的药物有效活性成分,并提取其作用靶点,在GeneCards数据库检索COVID-19相关疾病靶点,将药物及疾病的共同靶点导入STRING数据库获取靶标蛋白互作网络关系,通过Cytoscape3.7.2软件构建PPI网络、"中药-潜在活性成分-潜在靶标-疾病"网络,并利用Cytoscape3.7.2软件、R软件及相应程序包进行GO功能富集分析及KEGG通路富集分析。同时进行分子对接验证。结果:检索得到269个药物活性成分和2 629个药物靶标,其中药物疾病共同靶标49个,GO功能富集分析涉及对脂多糖的反应、氧化应激反应及γ-干扰素介导的信号通路调控等条目,KEGG通路富集分析涉及AGE-RAGE通路、TNF信号通路、NF-κB通路、RIG-I样受体信号通路等。分子对接结果表明槲皮素、木犀草素和山柰酚与COVID-19相关蛋白及作用靶点具有较强的结合活性,可能起到类似于抗病毒药物的治疗效果。结论:化湿败毒方含槲皮素、木犀草素和山柰...
【文章来源】:中药药理与临床. 2020,36(03)北大核心CSCD
【文章页数】:8 页
【部分图文】:
GO生物学功能富集分析
利用GeneCards生物数据库检索得到319 个COVID-19疾病靶点,查重后剩262 个。借助R软件在239 个药物靶点与262 个疾病靶点中找出药物-疾病共同靶点,即化湿败毒方治疗COVID-19的潜在靶点,共49 个,结果展示见图1。2.3 化湿败毒方治疗COVID-19的PPI网络构建
化湿败毒方治疗COVID-19的PPI网络
【参考文献】:
期刊论文
[1]从“杂气致疫”谈新型冠状病毒肺炎证治[J]. 史光伟,梁永林,苏颖. 中医学报. 2020(06)
[2]基于网络药理学和分子对接法探寻黄连解毒汤治疗新型冠状病毒肺炎(COVID-19)活性化合物的研究[J]. 王琰,吴杰,向净匀,李慧敏,周爽,王国全,史永恒,王斌. 中药药理与临床. 2020(02)
[3]基于TCMIP V2.0探析新型冠状病毒肺炎全病程中医证候和推荐方剂的科学内涵[J]. 许海玉,张彦琼,秦月雯,赵海誉,王萍,刘峰. 中国中药杂志. 2020(07)
[4]Evolution of the novel coronavirus from the ongoing Wuhan outbreak and modeling of its spike protein for risk of human transmission[J]. Xintian Xu,Ping Chen,Jingfang Wang,Jiannan Feng,Hui Zhou,Xuan Li,Wu Zhong,Pei Hao. Science China(Life Sciences). 2020(03)
[5]隐丹参酮通过抑制p38 MAPK/NF-κB通路改善哮喘气道炎症[J]. 李俊峰,王重阳,徐畅,李莉,王知广,李良昌,延光海. 中药新药与临床药理. 2020(01)
[6]IL-1β、TNF-α联合IL-6对胃癌的诊断价值[J]. 董志强,刘美荣,任秀梅. 实用癌症杂志. 2020(01)
[7]大黄的化学成分和药理研究进展[J]. 金丽霞,金丽军,栾仲秋,刘聪,潘超. 中医药信息. 2020(01)
[8]中药阻断NF-κB信号通路抑制Ⅰ型单纯疱疹病毒感染的研究进展[J]. 綦鲁博,张保平. 中国医药导报. 2020(01)
[9]肿瘤坏死因子在恶性胸水局部治疗中的应用及进展[J]. 俞玲,徐兴祥,许文景. 中华肺部疾病杂志(电子版). 2019(06)
[10]茯苓的化学成分、药理作用及临床应用研究进展[J]. 崔鹤蓉,王睿林,郭文博,王鹏龙,马涛,李瑞生,贾天柱,何塞·路易斯·里奥斯,张振秋,雷海民. 西北药学杂志. 2019(05)
博士论文
[1]RIG-I样受体在登革病毒诱导的I型干扰素反应中的作用[D]. 秦成峰.中国人民解放军军事医学科学院 2009
[2]卡介苗、γ-干扰素及维生素A对毛细支气管炎患儿免疫功能的影响[D]. 刘雅丽.重庆医科大学 2002
本文编号:3348061
【文章来源】:中药药理与临床. 2020,36(03)北大核心CSCD
【文章页数】:8 页
【部分图文】:
GO生物学功能富集分析
利用GeneCards生物数据库检索得到319 个COVID-19疾病靶点,查重后剩262 个。借助R软件在239 个药物靶点与262 个疾病靶点中找出药物-疾病共同靶点,即化湿败毒方治疗COVID-19的潜在靶点,共49 个,结果展示见图1。2.3 化湿败毒方治疗COVID-19的PPI网络构建
化湿败毒方治疗COVID-19的PPI网络
【参考文献】:
期刊论文
[1]从“杂气致疫”谈新型冠状病毒肺炎证治[J]. 史光伟,梁永林,苏颖. 中医学报. 2020(06)
[2]基于网络药理学和分子对接法探寻黄连解毒汤治疗新型冠状病毒肺炎(COVID-19)活性化合物的研究[J]. 王琰,吴杰,向净匀,李慧敏,周爽,王国全,史永恒,王斌. 中药药理与临床. 2020(02)
[3]基于TCMIP V2.0探析新型冠状病毒肺炎全病程中医证候和推荐方剂的科学内涵[J]. 许海玉,张彦琼,秦月雯,赵海誉,王萍,刘峰. 中国中药杂志. 2020(07)
[4]Evolution of the novel coronavirus from the ongoing Wuhan outbreak and modeling of its spike protein for risk of human transmission[J]. Xintian Xu,Ping Chen,Jingfang Wang,Jiannan Feng,Hui Zhou,Xuan Li,Wu Zhong,Pei Hao. Science China(Life Sciences). 2020(03)
[5]隐丹参酮通过抑制p38 MAPK/NF-κB通路改善哮喘气道炎症[J]. 李俊峰,王重阳,徐畅,李莉,王知广,李良昌,延光海. 中药新药与临床药理. 2020(01)
[6]IL-1β、TNF-α联合IL-6对胃癌的诊断价值[J]. 董志强,刘美荣,任秀梅. 实用癌症杂志. 2020(01)
[7]大黄的化学成分和药理研究进展[J]. 金丽霞,金丽军,栾仲秋,刘聪,潘超. 中医药信息. 2020(01)
[8]中药阻断NF-κB信号通路抑制Ⅰ型单纯疱疹病毒感染的研究进展[J]. 綦鲁博,张保平. 中国医药导报. 2020(01)
[9]肿瘤坏死因子在恶性胸水局部治疗中的应用及进展[J]. 俞玲,徐兴祥,许文景. 中华肺部疾病杂志(电子版). 2019(06)
[10]茯苓的化学成分、药理作用及临床应用研究进展[J]. 崔鹤蓉,王睿林,郭文博,王鹏龙,马涛,李瑞生,贾天柱,何塞·路易斯·里奥斯,张振秋,雷海民. 西北药学杂志. 2019(05)
博士论文
[1]RIG-I样受体在登革病毒诱导的I型干扰素反应中的作用[D]. 秦成峰.中国人民解放军军事医学科学院 2009
[2]卡介苗、γ-干扰素及维生素A对毛细支气管炎患儿免疫功能的影响[D]. 刘雅丽.重庆医科大学 2002
本文编号:3348061
本文链接:https://www.wllwen.com/yixuelunwen/zhongyaolw/3348061.html